• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

鉄ニッケル型ヒドロゲナーゼの金属クラスター形成における構造生物学的研究

Research Project

Project/Area Number 18054029
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionUniversity of Hyogo

Principal Investigator

庄村 康人  University of Hyogo, 大学院・生命理学研究科, 助教 (50423900)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥3,300,000 (Direct Cost: ¥3,300,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,400,000 (Direct Cost: ¥1,400,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Keywords[NiFe]ヒドロゲナーゼ / 金属クラスター形成 / X線結晶構造解析 / カルバモイル基転移
Research Abstract

本研究では水素分子の酸化を可逆的に触媒するヒドロゲナーゼのNiFeクラスター活性中心形成過程に関与する,HypEとHypFが触媒するカルバモイルリン酸からニトリル基を合成する反応機構の解明を目指している.昨年度までは,硫酸還元菌Desulfovibrio vulgaris Hildenborough由来のタンパク質試料を用いて実験を行い,ヌクレオチド結合型,非結合型それぞれにおいてHypE単体の結晶構造決定に成功していたが,活性のあるHypFタンパク質試料の調整が困難であることが判明していた.そこで今年度は,大腸菌由来HypE,HypFタンパク質の調整を試みた.アフィニティークロマトグラフィー等による精製後のタンパク質は硫酸還元菌由来のものとは異なり,両者の間には有意な相互作用が見られ,さらにHypFによるHypEへのカルバモイル化反応も確認できた.HypEF複合体をゲルろ過カラムクロマトグラフィー等の手法により分析したところ,(HypE)_2(HypF)_2の量比を示唆する結果が得られ,高純度の複合体試料を得ることに成功している.また,全長HypF単体の結晶化は困難であることがこれまでに分かっているため,結晶化に適したコンストラクト作製にも着手しており,その結果,幾つかの有力な発現系が得られた.これらの発現系は,結晶化だけでなく,HypEとHypFの相互作用様式および反応機構の解明にも大いに役立つことが期待される.

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2008 2007 2006

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Crystal structures of hydrogenase maturation protein HypE in the Apoand ATP-bound forms2007

    • Author(s)
      Shomura Y.
    • Journal Title

      Journal of Molecular Biology 372

      Pages: 1045-1054

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Feslp acts as a nucleotide exchange factor for the ribosome-associated molecular chaperone Ssblp.2006

    • Author(s)
      Dragovic Z.
    • Journal Title

      Biological Chemistry 387

      Pages: 1593-1600

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Molecular chaperones of the Hsp110 family act as nucleotide exchange factors of Hsp70s.2006

    • Author(s)
      Dragovic Z.
    • Journal Title

      EMBO Journal 25

      Pages: 2519-2528

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Presentation] Crystal structure of a hydrogenase maturation protein HypE2008

    • Author(s)
      Shomura Y.
    • Organizer
      International symposium on chemistry of reductases
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2008-03-11
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] [NiFe]ヒドロ下なーぜ成熟化因子HypEの構造科学的研究2007

    • Author(s)
      庄村 康人
    • Organizer
      生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-06-23
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] [NiFe]ヒドロ下なーぜ成熟化因子HypEの構造生物学的研究2007

    • Author(s)
      庄村 康人
    • Organizer
      蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-05-24
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2006-04-01   Modified: 2018-03-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi