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膜貫通型一酸化窒素還元酵素の一酸化窒素複合体の振動分光学的解析

Research Project

Project/Area Number 18054034
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

永野 真吾  The Institute of Physical and Chemical Research, 城生体金属科学研究室, 専任研究員 (60286440)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 城 宜嗣  独立行政法人理化学研究所, 城生体金属科学研究室, 主任研究員 (70183051)
Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥6,500,000)
Fiscal Year 2007: ¥3,300,000 (Direct Cost: ¥3,300,000)
Fiscal Year 2006: ¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
Keywordsヘム / 反応中間体 / 呼吸 / 分子進化 / 脱窒 / 反応機構
Research Abstract

一酸化窒素還元酵素(NOR)は脱窒過程の中で一酸化窒素を亜酸化窒素に還元する。また、この反応は嫌気呼吸による生体エネルギーの合成に共役していることから、一酸化窒素還元酵素は嫌気呼吸を支える重要な酵素の一つとなっている。好気(酸素)呼吸系でこの酵素に対応するのがシトクロムc酸化酵素であり、両者は進化的に関連が深いことがアミノ酸配列などから明らかにされている。これら呼吸酵素の機能発現の仕組みを解明する鍵を握るのは短寿命な気体分子・呼吸酵素複合体である。本研究ではNORと一酸化窒素との複合体を安定に捕捉し、振動分光法によって解析することで活性部位の構造を明らかとし、その機能発現のメカニズムを解明することを目的としている。低温で凍結させた酵素を高圧ガスに曝露し、強制的に気体分子を試料内部に浸透させ短寿命な気体分子-蛋白質複合体を調製するクライオガスサイターを平成18年度に開発した。本年度は本装置を活用し、NORと一酸化窒素や分子状酸素との複合体を調製する条件検討を進めた。一酸化窒素ついては窒素ガス圧0.5気圧、-93度で20分間処理することでNORとの複合体と推定される化学種が吸収スペクトルにより観測された。また、酸素ガス圧10-20気圧、-53度で40分間処理することで酸素複合体の調製を試みた。調製した気体分子NOR複合体試料はナノリットルオーダーの微量であり、室温では不安定なため、その振動分光解析を行うため顕微低温共鳴ラマンスペクトル測定装置を兵庫県立大学の小倉教授らの協力の元整えた。本研究で確立した短寿命気体分子一酵素複合体の調製方法および測定装置をもちいて今後は複合体の詳細な振動分光解析を進めていく計画である。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2008 2007 2006

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (4 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Crystal structure of VioE, a key player in the construction of the molecular skeleton of violacein2008

    • Author(s)
      Satoshi Hirano
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. (in press)

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 抗がん剤のインドロカルバゾール骨格を作るP450の電子引き抜き反応2008

    • Author(s)
      尾仲宏康
    • Journal Title

      バイオサイエンスとオンダストリー 66

      Pages: 22-24

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Journal Article] Crystal structures and catalytic mechanism of cytochrome P450 StaP that produces the indolocarbazole skeleton2007

    • Author(s)
      Masatomo Makino
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104

      Pages: 11591-11596

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hydrogen peroxide dependent monooxygenations by tricking the substrate recognition of cytochrome P450(BS beta)2007

    • Author(s)
      Osami Shoji
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed 46

      Pages: 3656-3659

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 酸素添加酵素の分子メカニズム2006

    • Author(s)
      杉本 宏
    • Journal Title

      日本結晶学会誌 48・6

      Pages: 418-423

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Presentation] 膜貫通型-酸化窒素還元酵素の発現と結晶化2007

    • Author(s)
      松本悠史
    • Organizer
      日本生物物理学会第45回年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-23
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 抗がん剤の骨格を形成するチトクロムP450 StaPのX線結晶構造はP450の珍しい触媒機構を示唆する2007

    • Author(s)
      牧野正知
    • Organizer
      日本生物物理学会第45回年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-23
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Identification of an active site of VioE, which constructs a violacein skeleton, by crystallographic and mutagenesis analyses2007

    • Author(s)
      平野 聡
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-11
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Crystal Structure of Cytochrome P450 StaP-Chromopyrrolic Acid Complex: Implications for Indolocarbazole Core Biosynthesis2007

    • Author(s)
      Masatomo Makino
    • Organizer
      15th International Conference on Cytochrome P450
    • Place of Presentation
      Bled, Slovenia
    • Year and Date
      2007-06-18
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 蛋白質・気体複合体結晶の作成方法2006

    • Inventor(s)
      永野真吾, 城 宜嗣
    • Industrial Property Rights Holder
      永野真吾, 城 宜嗣
    • Industrial Property Number
      2006-208427
    • Filing Date
      2006-07-31
    • Related Report
      2006 Annual Research Report

URL: 

Published: 2006-04-01   Modified: 2018-03-28  

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