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転写制御における基本転写因子TFIIDサブユニット(TAFs)の分子機能

Research Project

Project/Area Number 18055028
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

古久保 哲朗  Yokohama City University, 国際総合科学研究科, 教授 (10271587)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥8,700,000 (Direct Cost: ¥8,700,000)
Fiscal Year 2007: ¥4,400,000 (Direct Cost: ¥4,400,000)
Fiscal Year 2006: ¥4,300,000 (Direct Cost: ¥4,300,000)
Keywords転写調節機構 / 転写因子 / 基本転写因子 / 転写制御 / 出芽酵母 / TFIID / TAF / TBP
Research Abstract

コアプロモーター構造を認識する基本転写因子TFIIDは、TATAボックス結合タンパク質(TBP)と14種類のTBP随伴因子(TAF1-14)から構成される巨大なタンパク質複合体であり、転写調節因子から受け取った信号を転写量の増減へと変換する上で中心的な役割を果たす。TAF1のN末端に存在するTAND(TAF N-terminal domain)は、TBPに強く結合する性質を持ち、転写調節因子の存在下においてTBPをTATAボックスに向けて放出する役割を担うと考えられている。
上記モデルを検証するべくTANDの異所移植を試みたところ、TANDは機能を保持したまま、ほぼ全てのTAFのN,C両末端に移植可能であることが示された。一方、移植が不可能なケースとして、(1)TAF3/8のN末端では活性が弱く、TAF6のC末端では全く機能できない、(2)TAF11のC末端ではTANDのTBP結合能依存的にTAF11自身の機能が損なわれる、(3)TAF13のN末端ではTAF1がTANDを有する場合にのみ、TBP結合能の有無によらずTAF13自身の機能が損なわれる等の興味深い事実も明らかとなった。このうち(2)についてはTAF1/6/8/9のみが選択的にTFIID複合体から脱離するためであることが判明したが、(1)(3)の原因は不明である。そこで現在、TFIIDへの取り込みが阻害されるTAFの有無やその特定を含め、TFIID機能が阻害される原因に関して詳細な検討を進めている。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (17 results)

All 2008 2007 2006

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (6 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Saccharomyces cerevisiae HM01 interacts with TFIID and participates in start site selection by RNA polymerase II.2008

    • Author(s)
      Kasahara K, et. al.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res. 36・4

      Pages: 1343-1357

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fluoroscopic assessment of protein leakage during Xenopus oocytes in-cell NMR experiment by co-injected EGFP.2007

    • Author(s)
      Sakai T, et. al.
    • Journal Title

      Anal Biochem. 371・2

      Pages: 247-249

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Assembly of regulatory factors on rRNA and ribosomal protein genes in Saccharomyces cerevisiae.2007

    • Author(s)
      Kasahara K, et. al.
    • Journal Title

      Mol Cell Biol. 27・19

      Pages: 6686-6705

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Real-time monitoring of functional interactions between upstream and core promoter sequences in living cells of sea urchin embryos.2007

    • Author(s)
      Kobayashi A, et. al.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res. 35・14

      Pages: 4882-4894

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional silencing of TATA-binding protein(TBP) by acovalent linkage of the N-terminal domain of TBP-associated factor 1.2007

    • Author(s)
      Mal TK, et. al.
    • Journal Title

      J Biol Chem. 282・30

      Pages: 22228-22238

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Magnetic resonance-based visualization of gene expression in mammalian cells using a bacterial polyphosphate kinase reporter gene2007

    • Author(s)
      Ki S, Sugihara F, Kasahara K, Tochio H, Shirakawa M, Kokubo T.
    • Journal Title

      Biotechniques 42・2

      Pages: 209-215

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      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] In-cell NMR spectroscopy of proteins inside Xenopus laevis oocytes2006

    • Author(s)
      Sakai T, Tochio H, Tenno T, Ito Y, Kokubo T, Hiroaki H, Shirakawa M
    • Journal Title

      J Biomol NMR 36・3

      Pages: 179-188

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      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] A novel magnetic resonance-based method to measure gene expression in living cells2006

    • Author(s)
      Ki S, Sugihara F, Kasahara K, Tochio H, Okada-Marubayashi A, Tomita S, M orita M, Ikeguchi M, Shirakawa M, Kokubo T
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res 34・6

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      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 磁気共鳴法を利用した生細胞での遺伝子発現解析2006

    • Author(s)
      古久保哲郎, 奇 世媛, 杉原文徳, 白川昌宏
    • Journal Title

      バイオテクノロジージャーナル 6・5

      Pages: 605-608

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    • Author(s)
      Sugihara F, et. al.
    • Organizer
      Regulatory Mechanisms in Eukaryotic Transcription
    • Place of Presentation
      Keystone, Colorado, USA
    • Year and Date
      2008-02-06
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    • Author(s)
      杉原文徳, ら
    • Organizer
      遺伝情報DECODE・転写研究会共催冬のワークショップ
    • Place of Presentation
      湯沢
    • Year and Date
      2008-01-22
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    • Author(s)
      笠原浩司, ら
    • Organizer
      BMB2007(第30回日本分子生物学会年会&第80回日本生化学会大会)
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-12
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      小林晶子, ら
    • Organizer
      BMB2007(第30回日本分子生物学会年会&第80回日本生化学会大会)
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-12
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    • Author(s)
      大山良文, ら
    • Organizer
      BMB2007(第30回日本分子生物学会年会&第80回日本生化学会大会)
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-12
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      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Assembly of regulatory factors on rrna and ribosomal protein genes in S. cerevisiae2007

    • Author(s)
      Kasahara K, et. al.
    • Organizer
      Mechanisms of Eukaryotic Transcription
    • Place of Presentation
      Cold Spring Harbor, USA
    • Year and Date
      2007-08-30
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      2007 Annual Research Report
  • [Book] V章 遺伝子発現系 5.1転写酵母のすべて◎系統, 細胞から分子まで2007

    • Author(s)
      古久保哲朗
    • Publisher
      シュプリンガー・ジャパン
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      2007 Annual Research Report
  • [Book] FRET(蛍光共鳴エネルギー移動)分光法〜タンパク質間相互作用の解析実験医学別冊:生命科学のための機器分析実験ハンドブック2007

    • Author(s)
      奇 世媛, ら
    • Publisher
      羊土社
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      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2006-04-01   Modified: 2018-03-28  

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