• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

植物栄養ゲノミクス研究のための転写制御因子の高速探索

Research Project

Project/Area Number 18056019
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

高橋 秀樹  The Institute of Physical and Chemical Research, 基礎代謝研究チーム, チームリーダー (00333302)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 鈴木 昭徳  独立行政法人理化学研究所, 基礎代謝研究チーム, リサーチアソシエイト (20415194)
丸山 明子  独立行政法人理化学研究所, 基礎代謝研究チーム, 研究員 (70342855)
Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥4,600,000 (Direct Cost: ¥4,600,000)
Fiscal Year 2007: ¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Fiscal Year 2006: ¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Keywords植物 / ゲノム / 環境応答 / 代謝調節 / 転写制御
Research Abstract

シロイヌナズナのゲノム上には約2000個の転写制御因子が存在する。これらのうち、K,N,P,Sなどの栄養分の吸収を調節する転写制御因子として機能が明らかにされているものはごく一部である。本年度は、窒素栄養および硫黄栄養の吸収過程の制御を中心に研究を進め、特に、窒素栄養応答で重要な役割を果たす新規転写制御因子AGL21について以下に記載する成果を得た。
昨年度、転写制御因子のコード領域または上流・100bpにトランスポゾンの挿入を有する303系統の遺伝子破壊株を用いて、硝酸イオントランスポーターNRT2.1のmRNA発現量が野生株と比較して変化する系統を複数系統単離した。その中で、AGL21遺伝子破壊株(agl21-1)は、低C/N条件でNRT2.1のmRNA発現量が野生株より顕著に増加する破壊株として単離された系統である。AGL21は、硝酸イオンの刺激に応答して側根の伸長を促進するANR1と相同性が高いMADS box型の転写制御因子であった。培地のC/N条件を変化させてagl21-1の表現型を観察した結果、AGL21が低N条件で主根の成長に必須の因子であることが明らかとなった。さらに、硝酸イオンセンサーとしての機能をもつと推定される硝酸イオントランスポーターNRT1.1の遺伝子破壊株(nrt1.1)は、低N条件でagl21-1と同一の表現型を示すことを見出した。この表現型は、高C/N条件で強まる傾向がみられた。野生型(Nossen)、agl21-1、nrt1.1を用いてマイクロアレイ解析を行った結果、agl21-1とnrt1.1において、窒素欠乏に応答する遺伝子群の発現プロファイルに強い相関が認められた。また、AGL21とNRT1.1は互いを制御する関係にはなく、何れかの欠損により、低N条件で主根の成長が抑制されることが明らかとなった。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (22 results)

All 2008 2007 2006

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (14 results)

  • [Journal Article] Molecular biology and functional genomics for identification of regulatory networks of plant sulfate uptake and assimilatory metabolism.2008

    • Author(s)
      Takahashi, H. and Saito, K.
    • Journal Title

      Advances in Photosynthesis and Respiration-Sulfur Metabolism in Phototrophic Organisms (Dahl, C., Hell, R., Knaff, D., Leustek, T., eds., Springer)

      Pages: 153-163

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Journal Article] 植物のアンモニア態窒素吸収機構の機能分担を解明2008

    • Author(s)
      小島創一、高橋秀樹
    • Journal Title

      ブレインテクノニュース 126(印刷中)

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Journal Article] The organization of high-affinity ammonium uptake in Arabidopsis rootsdepends on the spatial arrangement and biochemical properties of AMT1-type transporters.2007

    • Author(s)
      Yuan, L., et. al.
    • Journal Title

      Plant Cell 19

      Pages: 2636-2652

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Post-transcriptional regulation of high-affinity sulfate transporters in Arabidopsis by sulfur nutrition.2007

    • Author(s)
      Yoshimoto, N., et. al.
    • Journal Title

      Plant Physiology 145

      Pages: 378-388

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Arabidopsis SLIM1 is a central transcriptional regulator of plant sulfur response and metabolism.2006

    • Author(s)
      Maruyama-Nakashita et al.
    • Journal Title

      Plant Cell 18

      Pages: 3235-3251

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Additive contribution of AMT1;1 and AMT1;3 to ammonium uptake across the plasma membrane of nitrogen-deficient Arabidopsis roots.2006

    • Author(s)
      Loque et al.
    • Journal Title

      Plant Journal 48

      Pages: 522-534

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 硫黄代謝制御因子SLIM1の発見2006

    • Author(s)
      高橋秀樹, 丸山(仲下)明子
    • Journal Title

      バイオサイエンスとインダストリー 64

      Pages: 692-694

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 植物の硫酸イオントランスポーターとその制御2006

    • Author(s)
      丸山(仲下)明子, 高橋秀樹
    • Journal Title

      植物の生長調節 41(1)

      Pages: 46-55

    • NAID

      110004749495

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物における窒素栄養および硫黄栄養の吸収と制御2008

    • Author(s)
      高橋秀樹
    • Organizer
      東京工業大学大学院生命理工学研究科シンポジウム「次世代の植物研究に向けて」
    • Place of Presentation
      東京工業大学大学すずかけ台キヤンパス(横浜)
    • Year and Date
      2008-02-02
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 硫酸イオントランスポーターSULTR1;2の硫黄栄養応答シス配列2007

    • Author(s)
      丸山明子, 他
    • Organizer
      日本土壌肥料学会2007年度関東支部大会
    • Place of Presentation
      日本大学生物資源科学部(藤沢)
    • Year and Date
      2007-11-24
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物におけるアンモニウム輸送と代謝の分子メカニズム2007

    • Author(s)
      高橋秀樹
    • Organizer
      地球温暖化軽減と作物の窒素利用効率向上に向けた作物の生物的硝化抑制作用(BNI)の遺伝育種的利用に関する研究会
    • Place of Presentation
      横浜市立大学木原生物学研究所(横浜)
    • Year and Date
      2007-09-19
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Transcriptional regulation of plant sulfur metabolism: approaches from genetics and functional genomics2007

    • Author(s)
      Takahashi, H.
    • Organizer
      BIOTEC-RIKEN Research Forum
    • Place of Presentation
      タイ バンコク
    • Year and Date
      2007-05-23
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Identification of transcription factors regulating sulfate uptake in Arabidopsis2007

    • Author(s)
      Takahashi, H.
    • Organizer
      14th international Workshop Plant Membrane Biology
    • Place of Presentation
      スペイン バレンシア
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Unravelling mechanisms underlying the ammonium-responsive expression of glutamine synthetase 1;2 (GLN1;2) in Arabidopsis roots2007

    • Author(s)
      Takahashi, H.
    • Organizer
      Nitrogen2007
    • Place of Presentation
      イギリス ランカスター
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Transcriptional and post-transcriptional regulation of sulfate uptake in Arabidopsis2007

    • Author(s)
      Takahashi, H.
    • Organizer
      2007 Sulphyton Workshop
    • Place of Presentation
      ドイツ ポツダム
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] An RT-PCR-based knockout screening system for rapid identification of transcription facrors controlling nutrient uptake in Arabidopsis2007

    • Author(s)
      Suzuki, A., et. al.
    • Organizer
      18th International Conference on Arabidopsis Research
    • Place of Presentation
      中国 北京
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] The organization of high-affinity ammonium uptake in Arabidopsis rootsrelies on the isoform-specific localization and biochemical properties of AMT1-type transporters2007

    • Author(s)
      Yuan, L., et. al.
    • Organizer
      14th international Workshop Plant Membrane Biology
    • Place of Presentation
      スペイン バレンシア
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Identification of transcriptional regulators of nitrate uptake system by RT-PCR-based screening of a transcription factor mutant collection in Arabidopsis2007

    • Author(s)
      Suzuki, A., et. al.
    • Organizer
      Nitrogen2007
    • Place of Presentation
      イギリス ランカスター
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 硫酸イオントランスポーターSULTR1;1およびSULTR1;2のタンパク質蓄積量の抑制2007

    • Author(s)
      吉本尚子 他
    • Organizer
      第25回日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム
    • Place of Presentation
      千葉大学
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 硫酸イオントランスポーターのプロモーターを利用した環境中のクロム酸・セレン酸の検出と測定2007

    • Author(s)
      丸山明子 他
    • Organizer
      第25回日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム
    • Place of Presentation
      千葉大学
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 高等植物における高親和型尿素トランスポーターの生理機能2007

    • Author(s)
      小島創一 他
    • Organizer
      第2回トランスポーター研究会
    • Place of Presentation
      昭和大学(東京)
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 硫酸イオントランスポーターの硫黄栄養応答を制御するシス因子の解析2007

    • Author(s)
      丸山明子, 他
    • Organizer
      第2回トランスポーター研究会
    • Place of Presentation
      昭和大学(東京)
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2006-04-01   Modified: 2018-03-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi