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線虫遺伝子破壊による低分子量G蛋白質RABファミリーのゲノム機能解析

Research Project

Project/Area Number 18057020
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionTokyo Women's Medical University

Principal Investigator

安藤 恵子  Tokyo Women's Medical University, 医学部, 助教 (40221741)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥5,400,000 (Direct Cost: ¥5,400,000)
Fiscal Year 2007: ¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,500,000)
Fiscal Year 2006: ¥2,900,000 (Direct Cost: ¥2,900,000)
Keywords線虫 / Rab / 低分子量G蛋白質 / 逆遺伝学 / 遺伝子破壊 / G蛋白質 / RABファミリー
Research Abstract

Rabは酵母からほ乳類まであらゆる真核細胞で保存されている低分子量G蛋白質でありさまざまな小胞輸送経路を制御することが知られている。しかしヒトやマウスでは60種以上もの異なるRab蛋白質が存在するためその生理機能は不明なものが多い。本研究課題では線虫Rabファミリーの体系的な逆遺伝学的解析により、Rab蛋白質の個体レベルでの生理機能を明らかにすることを目的としている。平成19年度は1.Rab遺伝子変異体の作成と株化、2.Rab遺伝子変異体の表現型解析、3.Rab遺伝子の発現解析を行った。線虫ゲノム上にはヒトRabの約半分に相当する29個のRab遺伝子が存在する。TMP/UV法で線虫ゲノム内にランダムに欠失変異を導入したmutant bankを各Rab遺伝子のプライマーでPCRスクリーニングし、欠失変異体を分離した。欠失部位のシークエンス解析を行い、エクソン配列を欠失していることを確認後、野生型線虫と数回戻し交配を行い、二次的な変異を取り除いた。当初計画通り、線虫全Rab遺伝子の欠失変異体を確立することができた。表現型解析の結果、酵母からヒトまで保存されているRab遺伝子変異体はほとんどが致死となり、ハウスキーピング遺伝子としての役割をもつと考えられた。一方、多細胞動物で獲得されたRab遺伝子の変異体はほとんどが生存可能であることがわかった。これらのRabは特定の組織や細胞における特殊な機能をもつ可能性や、サブファミリー間での機能相補の可能性が考えられる。また、GFP融合Rab遺伝子をもつトランスジェニック線虫を体系的に作製する方法を確立し、Rab遺伝子の発現解析を行った。Rab5やRab7などユビキタスな発現パターンを示すものや、Rab3やRab27など組織特異的な発現パターンを示すものがあり、現在各変異体表現型との対応付けを行っている。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2008 2007 2006

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] The SM protein VPS-45 is required for RAB-5-dependent endocytic transport in Caenorhabditis elegans2007

    • Author(s)
      Gengyo-Ando K, et. al.
    • Journal Title

      EMBO Reports 8(2)

      Pages: 152-157

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] C. elegans mitochondrial factor WAH-1 promotes phosphatidylserine exte rnalization in apoptotic cells through phospholipid scramblase SCRM-12007

    • Author(s)
      Wang X, et. al.
    • Journal Title

      Nature Cell Biology 9(5)

      Pages: 541-549

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] IFT-81 and IFT-74 are required for intraflagellar transport in C. elegans.2007

    • Author(s)
      Kobayashi, et. al.
    • Journal Title

      Genes to Cells 12(5)

      Pages: 593-602

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] C. elegans mitochondrial factor WAH-1 promotes phosphatidylserine externalization in apoptotic cells through phospholipid scramblase SCRM-1.2007

    • Author(s)
      Wang X et al.
    • Journal Title

      Nature Cell Biol (in press)

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Expression of rib-1 a Caenorhabditis elegans homolog of the human tumor suppressor EXT genes, is indispensable for heparan sulfate synthesis and embryonic morphogenesis.2007

    • Author(s)
      Kitagawa H et al.
    • Journal Title

      J Biol Chem (in press)

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] The SM protein VPS-45 is required for RAB-5-dependent endocytic transport in Caenorhabditis elegans2007

    • Author(s)
      Gengyo-Ando K et al.
    • Journal Title

      EMBO Rep 8・2

      Pages: 152-157

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Familial Parkinson mutant alpha-synuclein causes dopamine neuron dysfunction in transgenic Caenorhabditis elegans.2006

    • Author(s)
      Kuwahara T et al.
    • Journal Title

      J Biol Chem 281・1

      Pages: 334-340

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] ASB-1, a germ line-specific isoform of mitochondrial ATP synthase b subunit is required to maintain the rate of germline development in Caenorhabditis elegans.2006

    • Author(s)
      Kawasaki I et al.
    • Journal Title

      Mech Dev 124・3

      Pages: 237-251

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] An efficient transgenic system by TA cloning vectors and RNAi for C. elegans.2006

    • Author(s)
      Gengyo-Ando K et al.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun 349・4

      Pages: 1345-1350

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Presentation] 線虫遺伝子破壊による低分子量G蛋白質RABファミリーのゲノム機能解析2008

    • Author(s)
      安藤 恵子
    • Organizer
      平成19年度特定領域「G蛋白質シグナル」研究公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      2008-02-02
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2006-04-01   Modified: 2018-03-28  

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