Environmental Assessment Based on Synoptic Molecular Taxonomy of Soil Bacterial DNA
| Project/Area Number |
18310009
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Research Field |
Environmental dynamic analysis
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| Research Institution | Yokohama National University |
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Principal Investigator |
ITOH Kiminori Yokohama National University, 大学院・工学研究院, 教授 (40114376)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
AMEMIYA Takashi 横浜国立大学, 大学院・工学研究院, 准教授 (60344149)
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| Project Period (FY) |
2006 – 2008
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2008)
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| Budget Amount *help |
¥14,560,000 (Direct Cost: ¥12,700,000、Indirect Cost: ¥1,860,000)
Fiscal Year 2008: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Fiscal Year 2007: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2006: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥6,500,000)
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| Keywords | 環境計測 / 土壌細菌 / 鎖長多形 / DGGE / SSCP / DNA二次元電気泳動 / 生態系 / 湖 / 複雑系 / 食物網 / レジームシフト / 多様性 / 二次元電気泳動 / ランク・アバンダンスプロット / 回復性 |
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| Research Abstract |
環境中で重要な機能を担うにも関わらず、その詳細が不明な土壌細菌群集に関して、実験的・理論的な解析を行った。実験的には、DNA を高い分離能の検出できる二次元電気泳動法と、異なるDNA の集合を全体的に見るための総観的分子分類学に基づいて、新しい評価法を開発した。二次元電気泳動では、それぞれの細菌種を、1 つ1 つのスポットとして得ることができるため、全体の見通しが良い。理論的には、多様性が出現する機構を、「食う・食われる」の関係を表す食物網から検討すると共に、生態系中の非線形な相互作用による動態の解析を行い、典型的な湖汚染であるアオコ(シアノバクテリアの集団)の季節変動や日内変動などの挙動を明らかにした
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Report
(4 results)
Research Products
(77 results)
