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ATP依存性プロテアーゼ系と共役したDNAータンパク質クロスリンク修復機構

Research Project

Project/Area Number 18310039
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field Risk sciences of radiation/Chemicals
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

井出 博  Hiroshima University, 大学院・理学研究科, 教授 (30223126)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 田内 広  茨城大学, 理学部, 教授 (70216597)
寺東 宏明  広島大学, 大学院・理学研究科, 助教 (00243543)
Project Period (FY) 2006 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥18,330,000 (Direct Cost: ¥15,600,000、Indirect Cost: ¥2,730,000)
Fiscal Year 2008: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000)
Fiscal Year 2007: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2006: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥6,500,000)
KeywordsDNA損傷 / クロスリンク / ヌクレオチド除去修復 / 相同組換え
Research Abstract

DNA-タンパク質クロスロスリンク(DPC)は,タンパク質がDNAに共有結合して生じるゲノム損傷であるが,その修復機構は解明されていない。これまでの大腸菌を用いた研究で,DPC修復にはヌクレオチド除去修復(NER)と相同組換え(HR)が関与していることが明らかとなった。さらに,NERで働くUvrABCヌクレアーゼが除去できるクロスリンクタンパクのサイズには上限があり,これ以上のサイズのタンパクを含むDPCは,HRで回避されることが示された。本年度は,DPCに対するHR機構の詳細を検討した。
大腸菌のHRは,RecBCD依存的経路あるいはRecFOR依存的経路で進行する。DPCのHRに対する両経路の関与を明らかにするため,recBおよびrecF欠損株のDPC誘発剤感受性を調べた。recBは高感受性を示したが,recFはまったく感受性を示さなかった。RecFOR経路で働くrecJ,recQの欠損株も感受性は示さなかった。
したがって,DPCのHRはRecBCD依存的経路のみで進行し,これはゲノム損傷のHRにおいてDPCに特徴的な応答であることが示された。HRのpostsynaptic stageで働く因子を調べた結果,ruvAB,ruvC,recG欠損株がDPC誘発剤に高感受性を示した。RuvABおよびRuvCは,Holliday構造の移動と解消に関わっていると考えられるが,RecGの役割についてはさらに検討が必要である。HR後の複製再開に関わる因子を明らかにするため,priA,priB,priC,rep欠損株の感受性を調べた。priA欠損株は高感受性を示したが,priBおよびpriC欠損株は弱い感受性で,rep欠損株は感受性を示さなかった。したがって,複製再開はPriA-PriBあるいはPriA-Pric経路で進行し,両経路は相補的に働いていると考えた。

Report

(3 results)
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2008 2007 2006

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (11 results)

  • [Journal Article] Repair of DNA-protein crosslink damage : Coordinated actions of nucleotide excision repair and homologous recombination2008

    • Author(s)
      We H.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symposium Series 52

      Pages: 57-58

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    • Author(s)
      Yamamoto, R.
    • Journal Title

      Journal of Radiation Research 49

      Pages: 249-259

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  • [Journal Article] DNA-タンパク質クロスリンク損傷の修復機構2008

    • Author(s)
      井出 博
    • Journal Title

      放射線生物研究 (印刷中)

    • NAID

      40015940989

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      2007 Annual Research Report
  • [Journal Article] Nucleotide excision repair and homologous recombination systems commit differentially to the repair of DNA-protein crosslinks2007

    • Author(s)
      Nakano, T.
    • Journal Title

      Molecular Cell 28

      Pages: 147-158

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      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] TopBP1 associates with NBS1 and is involved in homologous recombination repair2007

    • Author(s)
      Morishima, K.
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications 362

      Pages: 872-879

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Major oxidative products of cytosine are substrates for the nucleotide incision repair pathway2007

    • Author(s)
      Stephane Daviet
    • Journal Title

      DNA Repair 6

      Pages: 8-18

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  • [Journal Article] 哺乳類の酸化的ゲノム障害修復機構2006

    • Author(s)
      井出 博
    • Journal Title

      生物物理 46

      Pages: 263-269

    • NAID

      110004810272

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      中野 敏彰
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会
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      北九州市
    • Year and Date
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      Salem, A.
    • Organizer
      10th International Workshop on Radiation Damageto DNA
    • Place of Presentation
      福島県北塩原村
    • Year and Date
      2008-06-10
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  • [Presentation] DNA-タンパク質クロスリンク損傷の修復機構2007

    • Author(s)
      井出 博
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-14
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  • [Presentation] DNA-タンパク質クロスリンク:損傷検出と修復機構2007

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      井出 博
    • Organizer
      日本環境変異原学会第36回大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Year and Date
      2007-11-29
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    • Author(s)
      Toshiaki Nakano
    • Organizer
      5th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      Tokyo(Japan)
    • Year and Date
      2007-11-20
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  • [Presentation] Sensitivity of E coli DNA repair-deficient mutants to DNA-protein cross-linking agents2007

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      Amir Salem
    • Organizer
      日本放射線影響学会第50回大会
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      千葉
    • Year and Date
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  • [Presentation] DNA-タンパク質クロスリンク損傷のヌクレオチド除去修復2007

    • Author(s)
      西村 はる菜
    • Organizer
      日本放射線影響学会第50回大会
    • Place of Presentation
      千葉
    • Year and Date
      2007-11-15
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  • [Presentation] DNA-タンパク質クロスリンク修復におけるヌクレオチド除去修復と相同組換えの連携2007

    • Author(s)
      井出 博
    • Organizer
      第66回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-10-04
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  • [Presentation] 哺乳類細胞におけるDNA-タンパク質クロスリンク損傷の修復機構2007

    • Author(s)
      西村はる菜
    • Organizer
      第32回中国地区放射線影響研究会
    • Place of Presentation
      広島
    • Year and Date
      2007-07-27
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  • [Presentation] Repair of DNA-protein cross-links: Roles of nucleotide excision and recombination repair systems2007

    • Author(s)
      Toshiaki Nakano
    • Organizer
      13th International Congress of Radiation Research
    • Place of Presentation
      San Francisco(USA)
    • Year and Date
      2007-07-10
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2006-04-01   Modified: 2016-04-21  

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