Molecular genetic analysis of RNA dynamism involved in dedifferentiation and reactivation of proliferation of plant cells

• Project/Area Number: 18370016
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: 植物生理・分子
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: SUGIYAMA Munetaka The University of Tokyo, 大学院・理学系研究科, 准教授 (50202130)
• Project Period (FY): 2006 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥16,590,000 (Direct Cost: ¥15,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000); Fiscal Year 2008: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000); Fiscal Year 2007: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000); Fiscal Year 2006: ¥11,000,000 (Direct Cost: ¥11,000,000)
• Keywords: 全能性 / 脱分化 / シロイヌナズナ / 細胞分裂 / 温度感受性突然変異体 / snRNA / プレmRNAスプライシング / プロモデオキシウリジン / rRNAプロセッシング / ブロモデオキシウリジン / SnRNA

Research Abstract

カルス形成に関し特異な表現型を示すシロイヌナズナの条件的突然変異体を広く調査し、責任遺伝子の同定と解析を通して、プレmRNA スプライシングやrRNA 前駆体プロセッシングの破綻に特別に敏感な事象が植物細胞の脱分化・分裂再開の特定段階に関与することを示した。とくにスプライシングを介して細胞増殖能を規定すると考えられる核内低分子RNA(snRNA)の蓄積量については、転写活性化因子SRD2 の発現に依存してダイナミックに変動することを明らかにした。

Research Products

• [Journal Article] Identification of novel meristem factors involved in shoot regeneration through the analysis of temperature-sensitive mutants of Arabidopsis (2009)
  • Author(s): 玉置裕章, 小西美稲子, 大門靖史, 相田光宏, 田坂昌生, 杉山宗隆
  • Journal Title: The Plant Journal 57 Pages: 1027-1039
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Identification of novel meristem factors involved in shoot regeneration through the analysis of temperature-sensitive mutants of Arabidopsis. (2009)
  • Author(s): Hiroaki Tamaki
  • Journal Title: The Plant Journal 57 Pages: 1027-1039
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Differential requirement for the function of SRD2, an snRNA transcription activator, in various stages of plant development (2008)
  • Author(s): 大谷美沙都, 出村拓, 杉山宗隆
  • Journal Title: Plant Molecular Biology 66 Pages: 303-314
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Differential requirement for the function of SRD2, an spRNA transcription activator, in various stages of plant development (2008)
  • Author(s): Misato Ohtani
  • Journal Title: Plant Molecular Biology 66 Pages: 303-314
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A NIMA-related protein kmase suppresses ectopic outgrowth of epidemal cells through its kinase activity and the association with microtubules (2008)
  • Author(s): Hiroyasu Motose
  • Journal Title: The Plant Journal 54(掲載確定済)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Dose-, time-, and tissue-dependent effects of 5-bromo-2'-deoxyuridine on the in-vitro organogenesis of Arabidopsis thaliana (2006)
  • Author(s): 杉山宗隆, 今村建朗
  • Journal Title: Plant Cell, Tissue, Organ Culture 87 Pages: 17-25
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Dose-, time-, and tissue-dependent effects of 5-bromo-2'-deoxyuridine on the in-vitro organogenesis of Arabidopsis thaliana. (2006)
  • Author(s): Munetaka Sugiyama
  • Journal Title: Plant Cell, Tissue and Organ Culture 87・1 Pages: 17-25
• [Presentation] 植物の発生におけるsnRNA転写のダイナミズム〜シロイヌナズナSRD2遺伝子の解析を通して〜 (2009)
  • Author(s): 大谷美沙都
  • Organizer: 第50回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2009-03-24
• [Presentation] シロイヌナズナの茎頂分裂組織新形成に関与する新規因子RID3とRGD3の解析 (2009)
  • Author(s): 玉置裕章
  • Organizer: 第50回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2009-03-22
• [Presentation] 成長追跡プログラム"GrowthTracer"を用いたシロイヌナズナの根端伸長速度の解析 (2009)
  • Author(s): 岩元明敏
  • Organizer: 第50回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2009-03-22
• [Presentation] 制限温度下で帯化根を形成するシロイヌナズナ温度感受性変異体πd1、rrd2、rid4の解析 (2009)
  • Author(s): 大塚蔵嵩
  • Organizer: 第50回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2009-03-21
• [Presentation] rRNAプロセッシングに関わるシロイヌナズナの新規核小体因子RID2の解析 (2009)
  • Author(s): 大林祝
  • Organizer: 第50回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2009-03-21
• [Presentation] シロイヌナズナの新規プロモデオキシウリジン耐性変異体bro3およびわbro4の解析 (2009)
  • Author(s): 今村建朗
  • Organizer: 第50回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2009-03-21
• [Presentation] 植物の発生におけるsnRNA 転写のダイナミズム~シロイヌナズナSRD2遺伝子の解析を通して (2009)
  • Author(s): 大谷美沙都, 杉山宗隆
  • Organizer: 第50回日本植物生理学会
  • Place of Presentation: 名古屋
• [Presentation] rRNAプロセッシングに関わるシロイヌナズナの新規核小体因子RID2の解析 (2009)
  • Author(s): 大林祝, 杉山宗隆
  • Organizer: 第50回日本植物生理学会
  • Place of Presentation: 名古屋
• [Presentation] シロイヌナズナの頂端分裂組織新形成に関与する因子RID3およびRGD3の解析 (2008)
  • Author(s): 玉置裕章
  • Organizer: 日本植物学会第72回大会
  • Place of Presentation: 高知
  • Year and Date: 2008-09-27
• [Presentation] シロイヌナズナ温度感受性変異体rrd1、rrd2、rid4の帯化根形成に関する解析 (2008)
  • Author(s): 大塚蔵嵩
  • Organizer: 日本植物学会第72回大会
  • Place of Presentation: 高知
  • Year and Date: 2008-09-26
• [Presentation] シロイヌナズナの新規核小体因子RID2はrRNAプロセッシングに関与する (2008)
  • Author(s): 大林祝
  • Organizer: 日本植物学会第72回大会
  • Place of Presentation: 高知
  • Year and Date: 2008-09-25
• [Presentation] シロイヌナズナのプロモデオキシウリジン耐性関連遺伝子の解析 (2008)
  • Author(s): 今村 建朗
  • Organizer: 第49回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 札幌
  • Year and Date: 2008-03-22
• [Presentation] NIMA様タンパク質カイネースによる表皮細胞の形態調節 (2008)
  • Author(s): 本瀬 宏康
  • Organizer: 第49回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 札幌
  • Year and Date: 2008-03-22
• [Presentation] シロイヌナズナのsnRNA転写活性化因子をコードする遺伝子SRD2の発現制御に関する解析 (2008)
  • Author(s): 春山 誠
  • Organizer: 第49回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 札幌
  • Year and Date: 2008-03-20
• [Presentation] シロイヌナズナのブロモデオキシウリジン耐性関連遺伝子の解析 (2008)
  • Author(s): 今村建朗, 杉山宗隆
  • Organizer: 第49回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 札幌
• [Presentation] シロイヌナズナのsnRNA 転写活性化因子をコードする遺伝子SRD2 の発現制御に関する解析 (2008)
  • Author(s): 春山誠, 大谷美沙都, 杉山宗隆
  • Organizer: 第49回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 札幌
• [Presentation] シロイヌナズナの温度感受性変異体rid2を用いた脱分化・細胞増殖再活性化過程の解析 (2007)
  • Author(s): 大林 祝
  • Organizer: BMB2007
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2007-12-11
• [Presentation] 脱分化と分聯形成に関わるシロイメナズナ RID1遺伝子の解析 (2007)
  • Author(s): 大谷 美沙都
  • Organizer: BMB2007
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2007-12-11
• [Presentation] シロイヌナズナの表皮細胞の形態を調節するダンパク質ガイネースIBOlの解析 (2007)
  • Author(s): 本瀬 宏康
  • Organizer: BMB2007
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2007-12-11
• [Presentation] シロイヌナズナのsnRNA転写活性化因子SRD2の発現制御機構に関する解析 (2007)
  • Author(s): 春山 誠
  • Organizer: 日本植物学会第71回大会
  • Place of Presentation: 野田
  • Year and Date: 2007-09-08
• [Presentation] 細胞の伸長方向を制御するプロテインカイネースの解析 (2007)
  • Author(s): 本瀬 宏康
  • Organizer: 日本植物学会第71回大会
  • Place of Presentation: 野田
  • Year and Date: 2007-09-08
• [Presentation] シロイヌナズナの温度感受性変異nid3およびrgd3のCUC・STM経路に対する影響 (2007)
  • Author(s): 玉置 裕章
  • Organizer: 日本植物学会第71回大会
  • Place of Presentation: 野田
  • Year and Date: 2007-09-07
• [Presentation] シロイヌナズナの発生・成長におけるsnRNA転写活性化の重要性 (2007)
  • Author(s): 大谷 美沙都
  • Organizer: 日本植物学会第71回大会
  • Place of Presentation: 野田
  • Year and Date: 2007-09-07
• [Presentation] シロイヌナズナ変異体rrd1、rrd2、rid4における温痩依存的な帯化根形成の解析 (2007)
  • Author(s): 大塚 蔵嵩
  • Organizer: 日本植物学会第71回大会
  • Place of Presentation: 野田
  • Year and Date: 2007-09-07
• [Presentation] 脱分化と分裂組織新形成に関わるシロイヌナズナRID1遺伝子の解析 (2007)
  • Author(s): 大谷美沙都, 出村拓, 杉山宗隆
  • Organizer: BMB 2007
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] シロイヌナズナの温度感受性突然変異体rid2を用いた脱分化・細胞増殖再活性化過程の解析 (2007)
  • Author(s): 大林祝, 杉山宗隆
  • Organizer: BMB 2007
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] 植物の細胞増殖制御におけるsnRNA 転写調節の意味 (2006)
  • Author(s): 杉山宗隆, 大谷美沙都
  • Organizer: 日本分子生物学会2006フォーラム
  • Place of Presentation: 名古屋
• [Presentation] Developmental significance of SRD2-mediated activation of snRNA transcription in Arabidopsis (2006)
  • Author(s): 大谷美沙都, 出村拓, 杉山宗隆
  • Organizer: RNA 2006 Izu
  • Place of Presentation: 伊豆の国
• [Book] 理系総合のための生命科学(東京大学生命科学教科書編集委員会) (2007)
  • Author(s): 杉山宗隆
  • Publisher: 羊土社
• [Book] 理系総合のための生命科学 (2007)
  • Author(s): 浅島 誠
  • Total Pages: 334
  • Publisher: 羊土社
• [Remarks]
  • URL: http://www.bg.s.u-tokyo.ac.jp/koishikawa/research/sugi-lab/sugi-1.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.bg.s.u-tokyo.ac.jp/koishikawa/research/sugi-lab/sugi-1.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.bg.s.u-tokyo.ac.jp/koichikawa/research/sugi-lab/sugi-1.html