Structural change and functional analysis of HutP-mediated anti-termination

• Project/Area Number: 18370073
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Molecular biology
• Research Institution: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• Principal Investigator: PENMETCHA Kumar (KUMAR Penmetcha) National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, 生物機能工学研究部門, 主任研究員 (80357938)
• Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha): SUBASH C.B Gopinath
• Project Period (FY): 2006 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥18,070,000 (Direct Cost: ¥15,100,000、Indirect Cost: ¥2,970,000); Fiscal Year 2008: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000); Fiscal Year 2007: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000); Fiscal Year 2006: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥5,200,000)
• Keywords: 核酸 / 生体分子 / 蛋白質 / 発現制御 / 転写制御 / RNA / RMA-タンパク質複合体 / X線解析 / BioXAS吸収スペクトル / 放射光 / Zn / 配位結合 / RNA結合蛋白質 / オペロン / モチーフ配列 / L-ヒスチジン / 発現

Research Abstract

転写制御蛋白質HutPと標的RNA複合体のX線解析を行った。その結果、HutPは6量体を形成していること、HutPは6量体の両面で、RNAの2個所のUAG繰り返し配列と結合していた。生化学的実験においても、UAG繰り返し配列の重要性が明らかにされた。また、in vivo実験により、活性発現がHutPにより誘導された。以上より、HutPはUAG繰り返し配列と結合し、RNAをステム-ループから3角形様構造に変化させるすることによって、転写終結解除する機構を明らかにした。

Research Products

• [Journal Article] Insights into antitermination regulation of hut operon in Bacillus subtilis: importance of dual RNA-binding surfaces of HutP (2008)
  • Author(s): Subash C.B. Gopinath, B. Dhakshnamoorthy, T.S. Kumarevel, Tomoko S. Misono, H. Mizuno and Penmetcha K.R. Kumar
  • Journal Title: Nucleic Acids Res 36 Pages: 3463-3473
• [Journal Article] Insights into anti-termination re gulation of the hut operonin BaciUus subtilis:importance of the dual RNA-bindingsurfaces of HutP (2008)
  • Author(s): Gopinath, SCB., Balasundaresan, D., Kumarevel, T., Misono, TS. Mizuno H. and Kumar, PKR
  • Journal Title: Nucleic Acids Research (In press)
  • Peer Reviewed
• [Presentation] Structure in the local environment of Zn_<2+> ion in the anti-termination protein of Bacillus subtilis (2008)
  • Author(s): P. Fons, D. Balasundaresan, H. Mizuno, P. K. R. Kumar
  • Organizer: IUCr2008国際結晶学会
  • Place of Presentation: 大阪市
  • Year and Date: 2008-08-28