Genome analysis of Blattabacterium sp.

• Project/Area Number: 18380045
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Applied entomology
• Research Institution: National Institute of Agrobiological Sciences
• Principal Investigator: WATANABE Hirofumi National Institute of Agrobiological Sciences, 昆虫・微生物間相互作用研究ユニット, 主任研究員 (10355745)
• Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha): 徳田 岳 琉球大学, 熱帯生物圏研究センター ; LO Nathan シドニー大学 ; BANDI Claudio ミラノ大学, 獣医学部, 准教授
• Project Period (FY): 2006 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥12,250,000 (Direct Cost: ¥10,300,000、Indirect Cost: ¥1,950,000); Fiscal Year 2008: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000); Fiscal Year 2007: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000); Fiscal Year 2006: ¥3,800,000 (Direct Cost: ¥3,800,000)
• Keywords: 絶対共生細菌 / 脂肪体 / ゲノム / パルスフィールド / 電気泳動 / パーコールコンティグ / ゴキブリ目 / Blattabacterium cuenoti / ゴキブリ / シロアリ / ブラクバクテリウム / 分離 / パルスフィールド電気泳動法 / ムカシシロアリ / GS20 / 細胞内共生細菌 / パルスフィールド電気泳動 / ショットガン解析 / ゲノムサイズ / pUC118 / Phi29 DNAポリメラーゼ / パーコール

Research Abstract

ブラタバクテリウムゲノムの分離精製法を確立しそのゲノムサイズ(650kbp)を決定した。また分離したゲノムDNAの配列を解読し, 523kbpのドラフトコンティグを作成した。

Research Products

• [Journal Article] Purification and partial genome characterization of the bacterial endosymbiont Blattabacterium cuenoti from the fat bodies of cockroaches. (2009)
  • Author(s): Gaku Tokuda, Nathan Lo, Aya Takase, Akinori Yamada, Yoshinobu Hayashi, Hirofumi Watanabe
  • Journal Title: BMC Research Notes 1 Pages: 118-126
• [Journal Article] Purification and partial genome characterization of the bacterial endosymbiont Blattabacterium cuenoti from the fat bodies of cockroaches (2009)
  • Author(s): Gaku Tokuda, Nathan Lo, Aya Takase, Akinori Yamada, Yoshinobu Hayashi, Hirofumi Watanabe
  • Journal Title: BMC Research Notes 1 Pages: 118-126
  • Peer Reviewed