Development and clinical application of cDNA microarray using formalin fixed paraffin embedded specimen

• Project/Area Number: 18390362
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Digestive surgery
• Research Institution: Tokyo Medical and Dental University
• Principal Investigator: UETAKA Hiroyuki (UETAKE Hiroyuki) Tokyo Medical and Dental University, 医歯学総合研究科, 寄附講座教員 (60311651)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): SUGIHARA Kenichi 東京医科歯科大学, 医歯学総合研究科, 教授 (10171167) ; HIGUCHI Teturo 東京医科歯科大学, 医歯学総合研究科, 助教 (90334416) ; IIDA Satoshi 東京医科歯科大学, 医歯学総合研究科, 助教 (20361694) ; ISHIKAWA Tosiaki 東京医科歯科大学, 医歯学総合研究科, 寄附講座教員 (00422478)
• Project Period (FY): 2006 – 2009
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2009)
• Budget Amount: ¥15,780,000 (Direct Cost: ¥13,800,000、Indirect Cost: ¥1,980,000); Fiscal Year 2009: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000); Fiscal Year 2008: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000); Fiscal Year 2007: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000); Fiscal Year 2006: ¥7,200,000 (Direct Cost: ¥7,200,000)
• Keywords: 大腸小腸肛門外科学 / パラフィン包埋標本 / マイクロアレイ / RT-PCR / 遺伝子発現 / リアルタイムPCR / 予後因子 / 抗癌剤感受性 / 化学療法

Research Abstract

Microarray technology is potentially a powerful approach to identify genes expression signatures that predict the effects of chemotherapeutic drugs. The aim of this study is to develop cDNA microarray using RNA isolated from laser-capture microdisssected formalin fixed paraffin embedded (FFPE) specimens.

Research Products

• [Journal Article] Over-and under-expressed microRNAs in human colorectal cancer (2009)
  • Author(s): Motoyama K, Inoue H, Takatsuno Y, Tanaka F, Mimori K, Uetake H, Sugihara K, Mori M.
  • Journal Title: Int J Oncol 34 Pages: 1069-1075
• [Journal Article] 【大腸癌治療の現在化学療法と外科手術のコンビネーション】病期 (ステージ) と大腸癌術後補助化学療法の適応 (2009)
  • Author(s): 植竹宏之, 杉原健一
  • Journal Title: Pharma Medica 27 Pages: 11-14
• [Journal Article] 【大腸がん化学療法のNEW STRATEGY】切除不能進行・再発大腸がんに対する化学療法 大腸がん化学療法におけるベバシズマブの位置付けとその効果 (2009)
  • Author(s): 植竹宏之, 石川敏昭, 杉原健一
  • Journal Title: Mebio Pages: 66-71
• [Journal Article] 【大腸癌治療の現在 化学療法と外科手術のコンビネーション】病期(ステージ)と大腸癌術後補助化学療法の適応 (2009)
  • Author(s): 植竹宏之, 杉原健一
  • Journal Title: Pharma Medica 27 Pages: 11-14
• [Journal Article] 【大腸がん化学療法のNEW STRATEGY】切除不能進行・再発大腸がんに対する化学療法 大腸がん化学療法におけるベバシズマブの位置付けとその効果 (2009)
  • Author(s): 植竹宏之, 石川敏昭, 杉原健一
  • Journal Title: Mebio 26 Pages: 66-71
• [Journal Article] 大腸がん術後補助化学療法における欧米と日本の相違点 (2009)
  • Author(s): 植竹宏之, 石川敏昭, 杉原健一
  • Journal Title: 臨床腫瘍プラクティス 5 Pages: 305-307
  • NAID: 40016795387
• [Journal Article] Tumor-targeted cancer therapy with capecitabineカペシタビンが刻む大腸がん治療の新たな1ページ (2009)
  • Author(s): 植竹宏之
  • Journal Title: Mebio 26 Pages: 6-15
• [Journal Article] Efficacy of laser capture microdissection plus RT-PCR technique in analyzing gene expression levels in human gastric cancer and colon cancer (2008)
  • Author(s): Makino H, Uetake H, Danenberg K, Danenberg PV, Sugihara K.
  • Journal Title: BMC Cancer 8 Pages: 210-210
• [Journal Article] Lactate dehydrogenase-5 (LDH-5) expression in human gastric cancer : Association with hypoxia-inducible factor (HIF-1 alpha) pathway, angiogenic factors production and poor prognosis (2008)
  • Author(s): Kolev Y, Uetake H, Takagi Y, Sugihara K.
  • Journal Title: Ann Surg Oncol 15 Pages: 2336-2344
• [Journal Article] Clinical Significance of High Mobility Group A2 in Human Gastric Cancer and Its Relationship to let-7 MicroRNA Family (2008)
  • Author(s): Motoyama K, Inoue H, Nakamura Y, Uetake H, Sugihara K, Mori M.
  • Journal Title: Clin Cancer Res 14 Pages: 2334-2340
• [Journal Article] Messenger RNA expression of vascular endothelial growth factor and its receptors in primary colorectal cancer and corresponding liver metastasis (2008)
  • Author(s): Kobayashi H, Sugihara K, Uetake H, Higuchi T, Yasuno M, Enomoto M, Kuramochi H, Lenz HJ, Danenberg KD, Danenberg PV.
  • Journal Title: Ann Surg Oncol 15 Pages: 1232-1238
• [Journal Article] Efficacy of laser capture microdissection plus RT-PCR technique in analyzing gene expression levels in human gastric cancer and colon cancer (2008)
  • Author(s): Makino H, Uetake H, Danenberg K, Danenberg PV, Sugihara K
  • Journal Title: BMC Cancer 8 Pages: 210-210
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Clinical Significance of High Mobility Group A2 in Human Gastric Cancer and Its Relationship to let-7 MicroRNA Family. (2008)
  • Author(s): Motoyama K, Inoue H, Nakamura Y, Uetake H, Sugihara K, Mori M.
  • Journal Title: Clin Cancer Res 14 Pages: 2334-2340
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Messenger RNA expression of vascular endothelial growth factor and its receptors in primary colorectal cancer and corresponding liver metastasis. (2008)
  • Author(s): Kobayashi H, Sugihara K, Uetake H, Higuchi T, Yasuno M, Enomoto M, Kuramochi H, Lenz HJ, Danenberg KD, Danenberg PV.
  • Journal Title: Ann Surg Oncol 15 Pages: 1232-1238
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 大腸癌の発生から転移までのメカニズム (2007)
  • Author(s): 石川敏昭, 植竹宏之, 杉原健一
  • Journal Title: 薬局 58(5) Pages: 1855-1860
• [Journal Article] コンセンサス術後補助療法 大腸癌 (2007)
  • Author(s): 石川敏昭, 植竹宏之, 杉原健一
  • Journal Title: コンセンサス癌治療 6(2) Pages: 72-75
• [Journal Article] 下部消化管疾患における最近の話題 大腸癌の化学療法の進歩と限界 (2007)
  • Author(s): 植竹宏之, 石川敏昭, 杉原健一
  • Journal Title: 日本医師会雑誌 136(3) Pages: 535-538
• [Journal Article] 侵襲をめぐるQ&A血管新生 癌に対する血管新生阻害薬の臨床効果について教えて下さい (Q&A) (2007)
  • Author(s): 植竹宏之, 石川敏昭, 杉原健一
  • Journal Title: Surgery Frontier. 14(4) Pages: 463-465
• [Journal Article] 大腸癌化学療法の進歩と限界 (2007)
  • Author(s): 植竹宏之、石川敏昭、杉原健一
  • Journal Title: 日医会雑誌 136 Pages: 535-538
• [Journal Article] 神経障害とその対策 (2007)
  • Author(s): 植竹宏之、石川敏昭、杉原健一
  • Journal Title: 消化器外科 30 Pages: 1213-1218
• [Journal Article] 外科医から見た化学療法時の緊急対応 (2007)
  • Author(s): 植竹宏之、石川敏昭、杉原健一
  • Journal Title: 医学の歩み Pages: 1209-1212
• [Journal Article] 大腸癌治療に関する最新のデータ (2007)
  • Author(s): 植竹宏之、榎本雅之、樋口哲郎、安野正道、飯田聡、小林宏寿、石川敏昭、石黒めぐみ、杉原健一
  • Journal Title: 臨床外科 Pages: 349-353
• [Journal Article] 「癌に対する血管新生阻害薬の臨床効果について教えてください」 (2007)
  • Author(s): 植竹宏之、石川敏昭、杉原健一
  • Journal Title: Surgery Frontier Pages: 113-115
• [Journal Article] Bevacizumab使用について外科医のおさえるべき点 (2006)
  • Author(s): 植竹宏之
  • Journal Title: 医学のあゆみ 219 Pages: 23-26
• [Journal Article] 治療法をめぐる最近の進歩 抗癌剤 消化器癌化学療法における感受性因子、耐性因子 (2006)
  • Author(s): 植竹宏之
  • Journal Title: 医学のあゆみ別冊 消化器疾患 3 Pages: 322-324
• [Journal Article] 最近の癌化学療法の動向 (2006)
  • Author(s): 植竹宏之
  • Journal Title: 外科治療 95 Pages: 579-585
• [Journal Article] 大腸癌におけるAdjuvant Chemotherapyの動向 (2006)
  • Author(s): 植竹宏之
  • Journal Title: FOCUS on ONCOLOGY 5 Pages: 11-12
• [Journal Article] Expression of 5-lipoxygenase in human colorectal cancer (2006)
  • Author(s): Soumaoro LT
  • Journal Title: WORLD JOURNAL OF GASTROENTEROLOGY 12 Pages: 6355-6360
• [Journal Article] High Pinl expression is associated with tumor progression in colorectal cancer (2006)
  • Author(s): Kuramochi J
  • Journal Title: JOURNAL OF SURGICAL ONCOLOGY Pages: 155-160
• [Presentation] 進行再発大腸がん化学療法の新たな治療戦略 (2009)
  • Author(s): 植竹宏之
  • Organizer: 第20回日本消化器癌発生学会総会ランチョンセミナー
  • Place of Presentation: 広島
  • Year and Date: 2009-11-27
• [Presentation] 大腸癌術後補助化学療法 (2009)
  • Author(s): 植竹宏之
  • Organizer: 大腸癌化学療法講演会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2009-11-14
• [Presentation] 大腸癌化学療法のありかた. 外科の立場から (2009)
  • Author(s): 植竹宏之
  • Organizer: 弘前大腸癌化学療法懇話会
  • Place of Presentation: 弘前
  • Year and Date: 2009-11-13
• [Presentation] 大腸癌術後補助化学療法～世界との乖離をどこまで埋める? (2009)
  • Author(s): 植竹宏之
  • Organizer: 第47回日本癌治療学会学術集会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2009-10-22
• [Presentation] 大腸癌肝転移に対する Bevacizumab 併用化学療法後肝切除の有用性 (2009)
  • Author(s): 植竹宏之, 石川敏昭, 光法雄介, 有井滋樹, 杉原健一
  • Organizer: 第17回 日本消化器関連学会週間
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 2009-10-16
• [Presentation] 大腸癌肝転移に対するBevacizumab併用化学療法後肝切除の有用性 (2009)
  • Author(s): 植竹宏之, 石川敏昭, 光法雄介, 有井滋樹, 杉原健一
  • Organizer: 第17回 日本消化器関連学会週間
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 2009-10-16
• [Presentation] 大腸癌術後補助化学療法…レジメン選択のポイントを考える… (2009)
  • Author(s): 植竹宏之
  • Organizer: 消化器癌の治療成績向上を目指して～アドヒアランスを考える～
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2009-10-02
• [Presentation] 進行再発大腸癌化学療法の新たな治療戦略 (2009)
  • Author(s): 植竹宏之
  • Organizer: 山口アバスチンシンポジウム
  • Place of Presentation: 山口
  • Year and Date: 2009-09-18
• [Presentation] 大腸癌化学療法の実際 (2009)
  • Author(s): 植竹宏之
  • Organizer: 第2回Meet the Expert～大腸癌化学療法のテクニック～
  • Place of Presentation: 熊本
  • Year and Date: 2009-09-11
• [Presentation] 日本における大腸癌化学療法の現状と展望 (2009)
  • Author(s): 植竹宏之
  • Organizer: 第16回山梨癌治療セミナー
  • Place of Presentation: 甲府
  • Year and Date: 2009-09-04
• [Presentation] Current status of chemotherapy for CRC in Japan (2009)
  • Author(s): Hiroyuki Uetake
  • Organizer: CURSO INTERNACIONAL DE ENDOSCOPIA DIAGNOSTICA Y TERAPEUTICA
  • Place of Presentation: Santiago, Chile
  • Year and Date: 2009-08-27
• [Presentation] Treatment of colorectal cancer(CRC)in Japan (2009)
  • Author(s): Hiroyuki Uetake
  • Organizer: CURSO INTERNACIONAL DE ENDOSCOPIA DIAGNOSTICA Y TERAPEUTICA
  • Place of Presentation: Santiago, Chile
  • Year and Date: 2009-08-27
• [Presentation] 大腸癌化学療法の現状-外科医の立場から- (2009)
  • Author(s): 植竹宏之
  • Organizer: 岩手大腸癌化学療法フォーラム
  • Place of Presentation: 盛岡
  • Year and Date: 2009-08-21
• [Presentation] 大腸癌化学療法における最新の知見-分子標的治療薬の位置づけ- (2009)
  • Author(s): 植竹宏之
  • Organizer: Achieve Symposium in Nagasaki
  • Place of Presentation: 長崎
  • Year and Date: 2009-07-29
• [Presentation] 抗VEGF抗体製剤アバスチン(ベバシズマブ)の結腸直腸癌全例調査結果報告 (2009)
  • Author(s): 植竹宏之, 白尾國昭, 土井俊彦, 畠清彦
  • Organizer: 第64回日本消化器外科学会総会
  • Place of Presentation: 大阪
  • Year and Date: 2009-07-17
• [Presentation] Quantitative analysis of genes using FFPE sample was dependent to dilution of a formalin solution and soaking duration : A report of the SACURA Study Group (2009)
  • Author(s): Hiroyuki Uetake, Toshiaki Ishikawa, Hideki Ueno, Kenichi Sugihara, Naohiro Tomita
  • Organizer: The 101st annual meeting of AACR
  • Place of Presentation: Denver, Colorado, USA
  • Year and Date: 2009-04-21
• [Presentation] 大腸癌肝転移に対するBevacizumab併用化学療法後肝切除の有用性 (2009)
  • Author(s): 植竹宏之, 石川敏昭, 光法雄介, 有井滋樹, 杉原健一
  • Organizer: 第42回制癌剤適応研究会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2009-02-20
• [Presentation] Danenberg^1Molecular Signatures of Gastric Cancers Derived from Microarray Analysis of Paraffin-Embedded Specimens Predict the Degree of Response to CPT11/S-1 Chemotherapy (2008)
  • Author(s): Shinji Morita, Mikito Inokuchi, Hiroyuki Uetake, Andreas C. Hoffmann, Janine Cooc, Akiko Omori, Kenichi Sugihara, Kathleen D. Danenberg, Peter V.
  • Organizer: The annual meeting of ASCO
  • Place of Presentation: Chicago, IL, USA
  • Year and Date: 2008-06-01
• [Presentation] Promoter hypermethylation of BNIP3 was correlated to poor prognosis in human colorectal cancer. (2008)
  • Author(s): Hiroyuki Uetake, Satoru Iida, Toshiaki Ishikawa, Sayaka Shimizu, Megumi Ishiguro, Kenichi Sugihara.
  • Organizer: ASCO Annual Meeting
  • Place of Presentation: McCormick Place, Chicago, Illinois
  • Year and Date: 2008-05-30
• [Presentation] Promoter hypermethylation of BNIP3 was correlated to poor prognosis in colorectal cancer patients (2008)
  • Author(s): Hiroyuki Uetake, Satoru Iida, Toshiaki Ishikawa, Sayaka Shimizu, Megumi Ishiguro, Kenichi Sugihara
  • Organizer: AACR Annual Meeting
  • Place of Presentation: San Diego, CA
  • Year and Date: 2008-04-16
• [Presentation] 大腸癌化学療法の現状と今後 (2007)
  • Author(s): 植竹宏之
  • Organizer: 第62回大腸肛門病学会学術集会(ランチョンセミナー)
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2007-11-02
• [Presentation] 大腸癌原発巣と肝転移巣における各種血管新生因子の発現量の相関 (2007)
  • Author(s): 植竹宏之、Nakamoto Regina、安野正道、杉原健一
  • Organizer: 第62回日本消化器外科学会定期学術総会(口演)
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2007-07-18
• [Presentation] Microarray analysis using paraffin embedded samples of gastric cancer. (2007)
  • Author(s): Uetake H, Inokuchi M, Yamashita T, Danenberg K, Danenberg P, Sugihara K.
  • Organizer: ASCO 2007 Annual Meeting (Poster)
  • Place of Presentation: Chicago
  • Year and Date: 2007-06-01
• [Presentation] Positive correlation of angiogenetic factors between primary tumor and liver metastasis in human colorectal cancer. (2007)
  • Author(s): Uetake H, Nakamoto RH, Kolev YV, Soumaoro LT, Yasuno M, Iida S, Sugihara K
  • Organizer: AACR Annual Meeting 2007(Poster)
  • Place of Presentation: Los Angeles
  • Year and Date: 2007-04-16
• [Presentation] 消化器癌における抗癌剤感受性因子と遺伝子および遺伝子発現解析法の工夫 (2007)
  • Author(s): 植竹宏之、飯田聡、石川敏昭、Peter Danenberg, Kathleen Danenberg、井ノ口幹人、杉原健一
  • Organizer: 第107回日本外科学会定期学術集会(ワークショップ)
  • Place of Presentation: 大阪
  • Year and Date: 2007-04-13
• [Book] インフォームドコンセントのための図説シリーズ 抗悪性腫瘍薬 大腸癌大腸癌の化学療法で用いられる主なレジメン(6)その他の治療法 (2009)
  • Author(s): 植竹宏之, 石川敏昭, 杉原健一
  • Total Pages: 108
  • Publisher: 医薬ジャーナル
• [Book] インフォームドコンセントのための図説シリーズ 抗悪性腫瘍薬 大腸癌(10)CVポート留置について (2009)
  • Author(s): 植竹宏之, 石川敏昭, 杉原健一
  • Total Pages: 108
  • Publisher: 医薬ジャーナル
• [Book] インフォームドコンセントのための図説シリーズ 抗悪性腫瘍薬 大腸癌(11)肝動注療法 (2009)
  • Author(s): 植竹宏之, 石川敏昭, 杉原健一
  • Total Pages: 108
  • Publisher: 医薬ジャーナル
• [Book] Cancer treatment navigator (2008)
  • Author(s): 植竹宏之, 石川敏昭, 杉原健一
  • Total Pages: 287
  • Publisher: メディカルレビュー社
• [Book] クリニカルオンコロジーガイド 消化器癌化学療法 (分担執筆) (2007)
  • Author(s): 植竹宏之、杉原健一
  • Total Pages: 278
  • Publisher: 南山堂
• [Book] 消化器癌化学療法 (2006)
  • Author(s): 転移性肝癌に対する化学療法
  • Total Pages: 308
  • Publisher: 日本メディカルセンター