Using gene expression profiling to identify a prognostic molecular spectrum in gliomas

• Project/Area Number: 18390398
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Cerebral neurosurgery
• Research Institution: Tazuke Kofukai Medical Research Institute (2008); Kyoto University (2006-2007)
• Principal Investigator: TAKAHASHI Jun Tazuke Kofukai Medical Research Institute, 医学研究所・第5研究部, 研究主幹 (80252435)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): KATO Kikuya 大阪府立成人病センター, 研究所, 所長 (60194809) ; HASHIMOTO Nobuo 京都大学, 医学研究科, 教授 (40135570)
• Project Period (FY): 2006 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥17,290,000 (Direct Cost: ¥15,100,000、Indirect Cost: ¥2,190,000); Fiscal Year 2008: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000); Fiscal Year 2007: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000); Fiscal Year 2006: ¥7,800,000 (Direct Cost: ¥7,800,000)
• Keywords: 遺伝子発現プロファイリング / 予後予測 / 神経膠腫 / ATAC-PCR / Real-time PCR / RNA / 予後判定 / 悪性神経膠腫 / PCR / 遺伝子発現 / プロファイリング / PCRアレイ / 個別化療法

Research Abstract

遺伝子発現プロファイリングの結果、神経膠腫の予後を予測する58遺伝子群を同定し、予後予測(補助療法感受性予測)するためのアルゴリズムを作成した。既知の1p19q染色体のLOHの有無及びMGMTの発現とは独立した予後因子としてこの58遺伝子プロファイルは有用であった。更に、臨床応用を容易にするために、PCRアレイを操作性の簡便なreal time PCRに転換し、これに基づいたアルゴリズムも作成した

Research Products

• [Journal Article] Using gene expression profiling to identify a prognostic molecular spectrum in gliomas (2009)
  • Author(s): Shirahata M, Oba S, Iwao-Koizumi K, Saito S, Ueno N, Oda M, Hashimoto N, Ishii S, Takahashi JA, Kato K
  • Journal Title: Cancer Sci 100(1) Pages: 165-72
  • NAID: 10025141815
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Using gene expression profiling to identify a prognostic molecular spectrum in gliomas (2009)
  • Author(s): Shirahata M, Oba S, Iwao-Koizumi K, Saito S, Ueno N, Oda M, Hashimoto N, Ishii S, Takahashi J A, Kato K.
  • Journal Title: Cancer Sci. 100 Pages: 165-72
  • NAID: 10025141815
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Long term outcomes in patients with intracranial germinomas : a single institution experience of irradiation with or without chemotherapy (2008)
  • Author(s): Kawabata Y, Takahashi JA, Arakawa Y, Shirahata M, Hashimoto N.
  • Journal Title: J Neurooncol 88 Pages: 161-167
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Gene expression-based molecular diagnostic system for malignant gliomas is superior to histological diagnosis (2007)
  • Author(s): Shirahata M, Iwao-Koizumi K, Saito S, Ueno N, Oda M, Hashimoto N, Takahashi JA, Kato K
  • Journal Title: Clin Cancer Res 13(24) Pages: 7341-56
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 臨床に役立つグリオーマの遺伝子解析 (2009)
  • Author(s): 白畑充章、橋本信夫、高橋潤、加藤菊也
  • Organizer: 第11回癌治療増感研究シンポジウム
  • Place of Presentation: 奈良
• [Presentation] Using gene expression profiling to identify a prognostic molecular spectrum in gliomas (2008)
  • Author(s): Shirahata,M, Takahashi JA, Kato K
  • Organizer: AACR Annual Meeting
  • Place of Presentation: San Diego、U.S.A
• [Presentation] Clinical application of molecular diagnostics using gene expression profiling (2008)
  • Author(s): 白畑充章、橋本信夫、高橋潤、加藤菊也
  • Organizer: 第26回日本脳腫瘍学会
  • Place of Presentation: 松山
• [Presentation] 悪性グリオーマに対するテモダール併用放射線治療後のpseudoprogressionについての検討 (2008)
  • Author(s): 白畑充章、橋本信夫、高橋潤、加藤菊也
  • Organizer: 第67回日本脳神経外科学会
  • Place of Presentation: 盛岡
• [Presentation] 遺伝子発現に基づいたanaplastic oligodendroglioma/glioblastoma診断モデル (2008)
  • Author(s): 白畑充章、橋本信夫、高橋潤、加藤菊也
  • Organizer: 第26回日本脳腫瘍病理学会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] Gliomaにおける遺伝子発現プロファイルの臨床的有用性について (2007)
  • Author(s): 白畑充章、,橋本信夫、高橋潤、加藤菊也
  • Organizer: 第25回日本脳腫瘍学会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] 遺伝子発現に基づいたanaplastic oligodendroglioma /glioblastoma診断モデル (2007)
  • Author(s): 白畑充章、橋本信夫、高橋潤、加藤菊也
  • Organizer: 第66回日本脳神経外科学会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] Gene expreion-based prtorictor for gliomas classified primary glioblastomas into prognostically distinct subgroups (2007)
  • Author(s): Shirahata,M, Takahashi JA, Kato K
  • Organizer: 日本癌学会
  • Place of Presentation: 横浜