Three-dimensional structure and function of polytheonamide B, a channel-forming polypeptide from a marine sponge

• Project/Area Number: 18550161
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Chemistry related to living body
• Research Institution: Kagoshima University
• Principal Investigator: HAMADA Toshiyuki Kagoshima University, 理学部, 准教授 (40321799)
• Project Period (FY): 2006 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥4,360,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥660,000); Fiscal Year 2008: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2007: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000); Fiscal Year 2006: ¥1,500,000 (Direct Cost: ¥1,500,000)
• Keywords: ポリセオナミドB / チャンネル / 海綿 / NMR / 界面活性剤 / 三次元構造 / 二次元NMR / 2D NMR / 界面活性剤ミセル

Research Abstract

日本近海産海綿Theonella swinhoeiから単離した細胞毒性ポリペプチド、ポリセオナミドBは、多数の異常アミノ酸やD型アミノ酸を含んでいる。また、生体膜においてチャンネルとして機能することが期待できる。本研究において、NMR法を用いて有機溶媒中での三次元構造を決定した。また、界面活性剤などに取り込んだポリセオナミドBについて、NMR構造解析と結晶化を行った。