Basic research for quantification of mitochondrial DNA copy number and mutations associated with aging
| Project/Area Number |
18590317
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Research Field |
Human genetics
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| Research Institution | Tokyo Metropolitan Institute of Gerontology |
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Principal Investigator |
NISHIGAKI Yutaka Tokyo Metropolitan Institute of Gerontology, 東京都老人総合研究所, 研究副部長 (80296988)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
TANAKA Masashi 財団法人東京都高齢者研究・福祉振興財団, 東京都老人総合研究所, 研究部長 (60155166)
FUKU Noriyuki 財団法人東京都高齢者研究・福祉振興財団, 東京都老人総合研究所, 主任研究員 (40392526)
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| Project Period (FY) |
2006 – 2008
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2008)
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| Budget Amount *help |
¥3,860,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2008: ¥260,000 (Direct Cost: ¥200,000、Indirect Cost: ¥60,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2006: ¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
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| Keywords | ゲノム / ミトコンドリア / 加齢 / ゲノム定量 |
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| Research Abstract |
1.【ミトコンドリアゲノム多型および変異の網羅的解析】ヒトのミトコンドリアゲノム(ミトコンドリアDNA, 以下mtDNA)の加齢に伴う影響を検討した。mtDNAは、核DNAに比較して多様性が高く、多くの遺伝子多型が存在し、また、糖尿病や難聴などの症状を呈するミトコンドリア病の原因遺伝子変異が、数多く報告されている。mtDNAの加齢に伴う影響を検討する際には、これらの遺伝子多型および病因遺伝子変異を的確に同定する必要がある。遺伝子多型を明らかにするためには、数千人を対象とした大規模関連解析を行うことが必要であり、mtDNA多型を網羅的かつ迅速に分析するシステムの開発が必須であった。また、mtDNA病因変異は、ミトコンドリア病のみならず、糖尿病などの生活習慣病の原因になり、さらにその変異率の量的変化は、加齢による影響を直接的・間接的に受ける。したがって、蛍光ビーズを利用して主要な42種類のmtDNA病因変異を迅速に分析する解析システムを開発した。
2.【健康長寿に関連するmtDNA遺伝的背景の解明】 東京都老人総合研究所・自立促進と介護予防研究チーム「お達者健診」における、約500人の健常高齢男女、また、社会参加とヘルスプロモーション研究チームの65歳以上の住民を対象とした介護予防健診「草津町にっこり健診」650人から、それぞれ適正なインフォームド・コンセントの手続きを経て収集した血液試料ならびに関連情報を解析し、糖尿病・メタボリック症候群・脳梗塞・心筋梗塞・慢性腎臓病などの生活習慣病と、それらに関連するmtDNAおよび核DNA多型を分析した。(一部解析終了)
3.【mtDNAの加齢の影響の検討】 加齢に伴うmtDNAの量的変化の迅速解析法を開発することを目的とした。一方、mtDNA多型や病因変異は一般的に母系遺伝し、遺伝的体質や寿命との関係が明らかになっている。したがって双方を解析する事で、個人の遺伝的体質のみならず加齢に伴うmtDNAを網羅的に評価する事が可能である。収集した唾液から抽出したmtDNAにおける加齢の影響は明らかではなかったが、骨格筋などでは研究代表者らが開発したmtDNA定量法は、mtDNAの核DNAとの相対比率を評価することにより、mtDNAの増減を明らかにできる。
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Report
(4 results)
Research Products
(84 results)
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[Journal Article] Association of a polymorphism of apolipoprotein E gene with chronic kidney disease in Japanese individuals with metabolic syndrome.2009
Author(s)
Yoshida T, Kato K, Fujimaki T, Yokoi K, Oguri M, Watanabe S, Metoki N, Yoshida H, Satoh K, Aoyagi Y, Nishigaki Y, Tanaka M, Nozawa Y, Yamada Y.
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Journal Title
Genomics 93
Pages: 221-226
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Association of genetic variants with chronic kidney disease in Japanese individuals with type 2 diabetes mellitus.2009
Author(s)
Yoshida T, Kato K, Yokoi K, Watanabe S, Metoki N, Yoshida H, Satoh K, Aoyagi Y, Nishigaki Y, Suzuki T, Nozawa Y, Yamada Y.
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Journal Title
Int J Mol Med 23
Pages: 529-537
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Association of gene polymorphisms with chronic kidney disease in high-risk or low-risk subjects defined by conventional risk factors2009
Author(s)
Yoshida T, Kato K, Yokoi K, Oguri M, Watanabe S, Metoki N, Yoshida H, Satoh K, Aoyagi Y, Nishigaki Y, Nozawa Y, Yamada Y.
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Journal Title
Int J Mol Med 23
Pages: 785-792
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Association of genetic vriants with myocardial infarction in Japanese individuals with chronic kidney disease.2009
Author(s)
Fujimaki T, Kato K, Yoshida T, Oguri M, Watanabe S, Metoki N, Yoshida H, Satoh K, Aoyagi Y, Nishigaki Y, Tanaka M, Nozawa Y, Kimura G, Yamada Y.
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Journal Title
Thromb Haemost 101
Pages: 963-968
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Association of genetic variants with chronic kidney disease in individuals with different lipid profiles.2009
Author(s)
Yoshida T, Kato K, Yokoi K, Oguri M, Watanabe S, Metoki N, Yoshida H, Satoh K, Aoyagi Y, Nishigaki Y, Nozawa Y, Yamada Y.
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Journal Title
Int J Mol Med 24
Pages: 233-246
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Mitochondrial DNA Haplogroup D4a is a Marker for Extreme Longevity in Japan.2008
Author(s)
Bilal E, Rabadan R, Alexe G, Fuku N, Ueno H, Nishigaki Y, Fujita Y, Ito M, Arai Y, Hirose N, Ruckenstein A, Bhanot G, Tanaka M.
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Journal Title
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Women with mitochondrial haplogroup N9a are protected against metabolic syndrome.2007
Author(s)
Tanaka M, Fuku N, Nishigaki Y, Matsuo H, Segawa T, Watanabe S, Kato K, Yokoi K, Yamaguchi S, Nozawa Y, Yamada Y.
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Journal Title
Diabetes 56
Pages: 518-521
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Mitochondrial haplogroup N9b is protective against myocardial infarction in Japanese males.2007
Author(s)
Nishigaki Y, Yamada Y, Fuku N, Matsuo H, Segawa T, Watanabe S, Kato K, Yokoi K, Yamaguchi S, Nozawa Y, Tanaka M.
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Journal Title
Hum Genet 120
Pages: 827-836
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Mitochondrial haplogroup N9a confers resistance against type 2 diabetes in Asians.2007
Author(s)
Fuku N, Park KS, Yamada Y, Nishigaki Y, Cho YM, Matsuo H, Segawa T, Watanabe S, Kato K, Yokoi K, Nozawa Y, Lee HK, Tanaka M.
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Journal Title
Am J Hum Genet 80
Pages: 407415-407415
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Mitochondrial haplogroup A is a genetic riskfactor for atherothrombotic cerebral infarction in Japanese females.2007
Author(s)
Nishigaki Y, Yamada Y, Fuku N, Matsuo H, Segawa T, Watanabe S, Kato K, Yokoi K, Yamaguchi S, Nozawa Y, Tanaka M.
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Journal Title
Mitochondrion 7
Pages: 72-79
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Enrichment of longevity phenotype in mtDNA haplogroups D4b2b, D4a, and D5 in the Japanese population.2007
Author(s)
Alexe G, Fuku N, Bilal E, Ueno H, Nishigaki Y, Fujita Y, Ito M, Arai Y, Hirose N, Bhanot G, Tanaka M.
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Journal Title
Hum Genet 121
Pages: 347-356
Related Report
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[Journal Article] Association of polymorphisms of THBS2 and HSPA8 with hypertension in Japanese individuals with chronic kidney disease.
Author(s)
Oguri M, Kato K, Yokoi K, Watanabe S, Metoki N, Yoshida H, Satoh K, Aoyagi Y, Nishigaki Y, Yoshida H, Nozawa Y, Yamada Y.
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Journal Title
Mol Med Rep (印刷中)
Pages: 0-0
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Association of genetic variants with chronic kidney disease in Japanese individuals.
Author(s)
Yoshida T, Kato K, Fujimaki T, Yokoi K, Oguri M, Watanabe S, Metoki N, Yoshida H, Satoh K, Aoyagi Y, Nishigaki Y, Tanaka M, Nozawa Y, Kimura G, Yamada Y.
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Journal Title
Clin J Am Soc Nephrol (印刷中)
Pages: 0-0
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Association of genetic variants with myocardial infarction in Japanese individuals with metabolic syndrome
Author(s)
Oguri M, Kato K, Yokoi K, Itoh T, Metoki N, Yoshida H, Satoh K, Aoyagi Y, Nishigaki Y, Tanaka M, Nozawa Y, Yamada Y.
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Journal Title
Atherosclerosis (印刷中)
Pages: 0-0
Related Report
Peer Reviewed
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