Comprehensive analysis of allelic imbalance by using high-densitysingle nucleotide polymorphism array in hepatocellular carcinoma

• Project/Area Number: 18590717
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Gastroenterology
• Research Institution: Chiba University (2008); The University of Tokyo (2006-2007)
• Principal Investigator: KANAI Fumihiko Chiba University, 医学部附属病院, 講師 (70334399)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): TANAKA Yasuo 東京大学, 医学部附属病院, 寄付講座教員 (40422290)
• Project Period (FY): 2006 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥4,100,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥600,000); Fiscal Year 2008: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2007: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2006: ¥1,500,000 (Direct Cost: ¥1,500,000)
• Keywords: マイクロアレイ / ゲノム / 肝細胞癌 / ダノム / SNP

Research Abstract

我々は、肝細胞癌の細胞株から抽出したゲノムDNAや、肝細胞癌および非癌部肝組織をレーザーマイクロダイセクションにより切り出し、抽出したゲノムDNAについて、100kまたは500k chipを用いて共通の遺伝子増幅および欠失領域やLOHの有無を解析してきた。肝細胞癌において染色体8q22.3領域が高頻度に遺伝子増幅をおこし、その染色体領域にコードされるGRHL2遺伝子増幅が、肝細胞癌の早期再発に相関していることを見出した。RNAiにより肝癌培養細胞の内在性GRHL2をknock downすると細胞増殖が抑制されることからも、GRHL2の増幅は、肝細胞癌再発の予測因子となる可能性が示唆された。

Research Products

• [Journal Article] Gain of GRHL2 isassociated with early recurrence of hepatocellular carcinoma (2008)
  • Author(s): Tanaka Y et.al.
  • Journal Title: Journal of Hepatology 49 Pages: 746-757
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Gain of GRHL2 is associated with early recurrence of hepatocellular carcinoma (2008)
  • Author(s): Tanaka Y, et al.,
  • Journal Title: Journal of Hepatology 49 Pages: 746-757
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 高密度オリゴヌクレオチドアレイによる肝細胞癌の生物学的特性・再発に関連するゲノム異常解析 (2008)
  • Author(s): 田中康雄, ら
  • Organizer: 日本肝臓学会
  • Place of Presentation: 愛媛県県民会館
  • Year and Date: 2008-06-05
• [Presentation] 高密度オリゴヌクレオチドアレイによる肝細胞癌の生物学的特性・再発に関連するゲノム異常解析 (2008)
  • Author(s): 田中康雄
  • Organizer: 日本肝臓学会
  • Place of Presentation: 愛媛県県民文化会館
  • Year and Date: 2008-06-05
• [Presentation] Copy Number Analysis of Hepatocellular Carcinoma Using Ten Genes Derived from GeneChip Data Set of Hepatoma Cell Lines (2007)
  • Author(s): Tanaka Y, Kanai F, Tada M, Tateishi R, Shiina S, Kobashi H, Kawabe T, Yokosuka O, Ogawa S, Omata M
  • Organizer: AASLD2007
  • Place of Presentation: Boston, Massachusetts
  • Year and Date: 2007-11-03