Comprehensive analysis of allelic imbalance by using high-densitysingle nucleotide polymorphism array in hepatocellular carcinoma
| Project/Area Number |
18590717
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Research Field |
Gastroenterology
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| Research Institution | Chiba University (2008)
The University of Tokyo (2006-2007) |
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Principal Investigator |
KANAI Fumihiko Chiba University, 医学部附属病院, 講師 (70334399)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
TANAKA Yasuo 東京大学, 医学部附属病院, 寄付講座教員 (40422290)
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| Project Period (FY) |
2006 – 2008
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2008)
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| Budget Amount *help |
¥4,100,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2008: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,500,000 (Direct Cost: ¥1,500,000)
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| Keywords | マイクロアレイ / ゲノム / 肝細胞癌 / ダノム / SNP |
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| Research Abstract |
我々は、肝細胞癌の細胞株から抽出したゲノムDNAや、肝細胞癌および非癌部肝組織をレーザーマイクロダイセクションにより切り出し、抽出したゲノムDNAについて、100kまたは500k chipを用いて共通の遺伝子増幅および欠失領域やLOHの有無を解析してきた。肝細胞癌において染色体8q22.3領域が高頻度に遺伝子増幅をおこし、その染色体領域にコードされるGRHL2遺伝子増幅が、肝細胞癌の早期再発に相関していることを見出した。RNAiにより肝癌培養細胞の内在性GRHL2をknock downすると細胞増殖が抑制されることからも、GRHL2の増幅は、肝細胞癌再発の予測因子となる可能性が示唆された。
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Report
(4 results)
Research Products
(5 results)
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[Presentation] Copy Number Analysis of Hepatocellular Carcinoma Using Ten Genes Derived from GeneChip Data Set of Hepatoma Cell Lines2007
Author(s)
Tanaka Y, Kanai F, Tada M, Tateishi R, Shiina S, Kobashi H, Kawabe T, Yokosuka O, Ogawa S, Omata M
Organizer
AASLD2007
Place of Presentation
Boston, Massachusetts
Year and Date
2007-11-03
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