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ハロゲン結合の物理化学的描像の解明と超分子化学への応用

Research Project

Project/Area Number 18655003
Research Category

Grant-in-Aid for Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Physical chemistry
Research InstitutionShizuoka University

Principal Investigator

鳥居 肇  Shizuoka University, 教育学部, 教授 (80242098)

Project Period (FY) 2006 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥3,600,000 (Direct Cost: ¥3,600,000)
Fiscal Year 2008: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2007: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,800,000 (Direct Cost: ¥1,800,000)
Keywordsハロゲン結合 / 物理化学 / 超分子化学 / 分子間相互作用 / 指向性 / 芳香族 / 置換基 / 電子求引性 / 超分子科学
Research Abstract

共有結合に与るハロゲン原子(Cl,Br,I)の原子内電子分布の異方性に由来し,原子上の電気四重極子により表現できるような,近距離で働く指向性の強い分子間相互作用は,分子集合体の化学に新しい展開をもたらす可能性がある。特に,分子内の他の置換基によって,ハロゲン結合の形成されやすさが大幅に変化する点について,十分な物理化学的考察を行うことは,超分子化学等へ応用するにあたって,重要なファクターである。
平成20年度においては,平成19年度までに行った計算を発展させ,生理活性を持ったタンパク質と,それに対する阻害剤として作用するハロゲン化芳香族分子の会合体を念頭に置いたモデル分子系を対象に,理論計算を行った。ハロゲン結合の形成が,ペプチド主鎖の構造とペプチドの振動モードに,どのような効果を及ぼすかについて,検討した。その結果,ペプチド基のアミドIモードに対するハロゲン結合形成の効果は,水素結合形成の効果と大きく異なり,疎水的環境に対応することが示唆された。
また,ハロゲン結合による人工的な超分子形成の一例として,ハロゲン化芳香族分子が3分子会合してハロゲン原子が三角形状に配置する系についても,理論計算による検討を行った。トリヨードベンゼン3量体などでは,このような三角形状構造は安定ではないが,的確な置換基導入により,三角形状構造が安定となるという結果などが得られ,大きな置換基効果が示唆された。

Report

(3 results)
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2008 2007 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Merged and separate band profiles arising from resonantly coupled vibrational modes of liquid mixtures : Theoretical study2008

    • Author(s)
      H. Torii
    • Journal Title

      J. Raman Spectrosc. 39

      Pages: 1592-1599

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Vibrational spectroscopic signature indicating the mixing of the cis conformers in liquid N-methylformamide2007

    • Author(s)
      M.Yoshida
    • Journal Title

      Computing Letters 3

      Pages: 449-455

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Properties of halogen atoms for representing intermolecular electrostatic interactions related to halogen bonding and their substituent effects

    • Author(s)
      H. Torii
    • Journal Title

      J. Comput. Chem. (印刷中)

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Modulations of vibrational frequencies and other vibrational properties of the C=O stretching mode of liquid acetone

    • Author(s)
      H.Torii
    • Journal Title

      J. Mol. Liq. (印刷中)

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Presentation] ハロゲン結合に関わる分子開静電相互作用の表現法とハロゲン原子のプロパティ2008

    • Author(s)
      鳥居肇
    • Organizer
      第22回分子シミュレーション討論会
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山市)
    • Year and Date
      2008-11-19
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 振動スペクトルの理論的解析による液体外メチルホルムアミドの構造の研究2008

    • Author(s)
      吉田正輝
    • Organizer
      第11回理論科学討論会
    • Place of Presentation
      慶慮義塾大学(横浜市)
    • Year and Date
      2008-05-22
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 分子間共鳴的振動相互作用の存在下における同位体混合液体の振動スペクトル形状の理論的解析2008

    • Author(s)
      鳥居肇
    • Organizer
      第11回理論科学討論会
    • Place of Presentation
      慶慮義塾大学(横浜市)
    • Year and Date
      2008-05-22
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] ハロゲン化芳香族化合物の分子間静電相互作用に対するハロゲン原子の電気四重極子の効果の理論的解析2007

    • Author(s)
      吉田 正輝
    • Organizer
      第1回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      東北大学(仙台市)
    • Year and Date
      2007-09-18
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2006-04-01   Modified: 2016-04-21  

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