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細胞壁タンパク質の選別回収機構解明を目指した比較ゲノム的アプローチ

Research Project

Project/Area Number 18657014
Research Category

Grant-in-Aid for Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field 植物生理・分子
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

西谷 和彦  Tohoku University, 大学院・生命科学研究科, 教授 (60164555)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 横山 隆亮  東北大学, 大学院・生命科学研究科, 講師 (90302083)
Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥3,400,000 (Direct Cost: ¥3,400,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,600,000 (Direct Cost: ¥1,600,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,800,000 (Direct Cost: ¥1,800,000)
Keywords遺伝子 / 植物 / タンパク質 / 発生・分化 / プロテオーム / 細胞壁 / タンパク質修飾 / アポプラスト / 蛋白質
Research Abstract

植物細胞は常時多量のタンパク質や糖質、フェニールプロパノイドなどを細胞外、すなわち細胞壁中に分泌し、細胞壁を構築・再編しながら形熊形成、生体防御、細胞間の情報や物質の輸送など、多岐に亘る機能を処理している。分泌される高分子類は、恒久的に細胞壁中に残留するもの(構造タンパク質やセルロースなど)と,役割を終えた後、細胞壁中より速やかに姿を消すもの(酵素などの機能分子)とに大別される。後者は細胞壁中の何らかの選別・回収システムを介して、細胞内に戻され、再利用されている筈であるがその過程についての実証的知見は殆どなく、細胞の外で分子を識別し、選択的に細胞内へ回収するシステムの存在はいまだ植物においてはその存在すら知られていない。本研究ではこの点に着目し、細胞壁動態に関する知見の蓄積したシロイヌナズナのゲノム情報を活用しながら、雑多な細胞壁構成タンパク質の中より細胞壁タンパク質の選別回収の標的となるタンパク質の特定とタンパク質選別回収の分子機構の解明を目指した研究を計画して解析を進めた。すなわち、プロトプラストから細胞壁が再生される過程、並びに、根からカルスを誘導する過程で変動する細胞壁タンパク質の動態をプロテオームの手法で解析し、上記の細胞壁再編過程で、細胞壁中での修飾状態が異なるタンパク質種を多数同定した。これらのタンパク質の中には、タンパク質分解酵素を含めた、タンパク質を基質とする酵素が多数含まれていた。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2008 2007 2006 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (9 results) Book (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Reverse genetic approach to exploring genes responsible for cell-wall dynamics in supporting tissues of Arabidopsis thalianaunder microgravity conditions.2007

    • Author(s)
      Koizumi K, Yokoyama R, Kamada M, Omori K, Ishioka N, Takeoka H, Shimazu T. Nishitani K
    • Journal Title

      Biological Sciences in Space 21

      Pages: 48-55

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] JAXA Space plant research on the ISS with European modular cultivation system.2007

    • Author(s)
      Kamada M, Omori, K, Nishitani K, Hoson T, Simazu T, Ishilia N
    • Journal Title

      Biological Sciences in Space 21

      Pages: 62-66

    • NAID

      10019793571

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A principal role for AtXTH18 in Arabidopis thaliana root growth : a functional analysis using RNAi plants2006

    • Author(s)
      Y Osato, Yokoyama R, Nishitani K
    • Journal Title

      Journal of Plant Research 119

      Pages: 153-162

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Identification and characterization of Arabidopsis thaliana genes involved in xylem secondary cell walls2006

    • Author(s)
      Yokoyama R, Nishitani K
    • Journal Title

      Journal of Plant Research 119

      Pages: 189-194

    • NAID

      10019164634

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Roles of the XTH protein family in the expanding cell2006

    • Author(s)
      Nishitani K, Vissenberg K
    • Journal Title

      Plant Cell Monographs-The Expanding Cell 5

      Pages: 89-116

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 植物細胞壁の構造と機能-比較ゲノムからのアプローチ2006

    • Author(s)
      西谷和彦
    • Journal Title

      植物の生長調節 41

      Pages: 34-45

    • NAID

      110004749494

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      2006 Annual Research Report
  • [Presentation] 陸上植物の細胞壁機能の進化2008

    • Author(s)
      横山隆亮, 西谷和彦
    • Organizer
      第49回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2008-03-20
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  • [Presentation] Cell-type specific roles for members of the XTH family of proteins in plants2008

    • Author(s)
      Nishitani K, Yokoyama R, Osato Y, Matsui A, Kurasawa K, Hara Y, Uwagaki Y
    • Organizer
      Frontier in Plant Proteome Research
    • Place of Presentation
      つくば農林ホール
    • Year and Date
      2008-03-11
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      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナの支持組織形成に関わる遺伝子機能解明を目指した宇宙実験,Cell Wall2008

    • Author(s)
      小泉健人, 横山隆亮, 鎌田源司, 大森克徳, 石岡憲昭, 嶋津徹, 西谷和彦
    • Organizer
      第24回宇宙利用シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-01-18
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 陸上植物のエンド型キシログルカン転移酵素/加水分解酵素遺伝子ファミリーの比較解析2007

    • Author(s)
      横山隆亮, 原田太郎, 西谷和彦
    • Organizer
      第28回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-12
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      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナの花茎形成における細胞壁関連遺伝子群の包括的な機能解析2007

    • Author(s)
      野上三貴, 小泉健人, 横山隆亮, 西谷和彦
    • Organizer
      第28回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-11
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      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] A role of plasma membrane H+-ATP ase in anoxic tolerance of pondweed turions.2007

    • Author(s)
      Hara Y, Yokoyama R, Nishitani K, Ishizawa K
    • Organizer
      9th Conference of the International Society for Plant Anaerobiosis
    • Place of Presentation
      松島大観荘
    • Year and Date
      2007-11-22
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      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 花茎の形態形成と細胞壁関連遺伝子2007

    • Author(s)
      横山隆亮, 西谷和彦
    • Organizer
      日本植物学会71回大会
    • Place of Presentation
      東京理科大学
    • Year and Date
      2007-09-07
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Cell-type specific roles for XTH family for proteins2007

    • Author(s)
      Osato Y. Matsui A., Kurasawa K, Yokoyama R, Nishitani K
    • Organizer
      Copenhagen 2007 XI Cell Wall Meeting
    • Place of Presentation
      Copenhagen
    • Year and Date
      2007-08-14
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Functional analyses of an Arabidopsis cell wall genes involved in physical properties of xylem cell wall proteins2007

    • Author(s)
      Yokoyama R, Nishitani K.
    • Organizer
      Copenhagen 2007 XI Cell Wall Meeting
    • Place of Presentation
      Copenhagen
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Book] プラントミメティックス-植物に学ぶ (pp272-278)2006

    • Author(s)
      倉澤香澄, 横山隆亮, 西谷和彦
    • Total Pages
      664
    • Publisher
      NTS
    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Book] The Science and Lore of the Plant Cell Wall (pp148-154)2006

    • Author(s)
      Nishitani K
    • Total Pages
      355
    • Publisher
      Brown Walker Press
    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.biology.tohoku.ac.jp/lab-www/nishitani_lab/index.html

    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2006-04-01   Modified: 2016-04-21  

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