Identification of the cellulose-binding proteins from rumen contents
| Project/Area Number |
18688015
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Field |
Zootechnical science/Grassland science
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| Research Institution | Ibaraki University |
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Principal Investigator |
TOYODA Atsushi Ibaraki University, 農学部, 講師 (00292483)
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| Project Period (FY) |
2006 – 2008
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2008)
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| Budget Amount *help |
¥29,640,000 (Direct Cost: ¥22,800,000、Indirect Cost: ¥6,840,000)
Fiscal Year 2008: ¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000)
Fiscal Year 2007: ¥10,530,000 (Direct Cost: ¥8,100,000、Indirect Cost: ¥2,430,000)
Fiscal Year 2006: ¥12,090,000 (Direct Cost: ¥9,300,000、Indirect Cost: ¥2,790,000)
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| Keywords | ルーメン / セルロース / セルラーゼ / セルロース結合性タンパク質 / プロテーム / モノクロナール抗体 / メタゲノム / ゲノムライブラリー / 質量分析 / プロテオーム |
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| Research Abstract |
ルーメン内セルロース分解を効率化するためには、その分子メカニズムについて詳細に理解する必要がある。本研究ではルーメン内でセルロース分解に関与するタンパク質(CBPs)を網羅的に同定することを目的とした。ルーメン内CBPsとしてFibrobacter succinogenesのEndoglucanase F、TPR domain protein、OmpA family protein、Fibro-slim domain protein、Piromyces equiのCel6Aが同定された。ルーメン内セルロース付着菌のメタゲノム解析を行った。ルーメンからセルロースに付着する菌を採取し、ゲノムDNAを抽出後、次世代シーケンサーによる解析を行った。F. succinogenesなどの繊維分解菌由来のDNAと相同性の高いDNAが多数検出された。
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Report
(4 results)
Research Products
(29 results)
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[Journal Article] Effect of Bacillus subtilis var. natto fermented soybean on growth performance, microbial activity in the caeca and cytokine gene expression of domestic meat type chickens2009
Author(s)
K. Fujiwara, M. Yamazaki, H. Abe, K. Nakashima, Y. Yakabe, M. Otsuka, Y. Ohbayashi, Y. Kato, K. Namai, A. Toyoda, Y. Miyaguchi, Y. Nakamura
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Journal Title
The Journal of Poultry Science 46(2)
Pages: 116-122
NAID
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