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単一神経細胞マイクロアレイによる大脳皮質GABAニューロンの解析

Research Project

Project/Area Number 18700320
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Neuroscience in general
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

江角 重行  Kumamoto University, 大学院・医学薬学研究部, 助教 (90404334)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥3,500,000 (Direct Cost: ¥3,500,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,500,000 (Direct Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2006: ¥2,000,000 (Direct Cost: ¥2,000,000)
KeywordsGABAニューロン / Single-cell microarray / GAD67 / 大脳皮質 / シングルセル / Single-cell
Research Abstract

我々はタカラバイオ社のSuper Smart cDNA PCR synthesis kitとAffymetrix社のOne cycle RNA labeling kitを組み合わせて行うことができる単一細胞マイクロアレイ法を開発した。この方法の再現性、信頼度を確かめるために、E18-P0のGAD67-GFPノックインマウスの大脳皮質よりGFP陽性細胞をセルソーターにより分離して得た1μgのtotalRNAからOne cycle RNA labeling kitでマイクロアレイ解析を行なった場合と、このtotalRNAを10万倍希釈してから我々が確立した方法で増幅を行なった場合の結果を比較したところ、希釈して増幅した場合は、約56%の遺伝子をPresent callとして検出することができた。この方法を用いて、10個のE18-P0のGAD67-GFPノックインマウスの大脳皮質の脳室下帯のGAD67陽性細胞の単一シングルセルマイクロアレイ解析を行ったところ、細胞ごとに異なった発現プロファイリングを得ることができた。この解析した細胞のDNA replication関連遺伝子群を調べたところ、1個の細胞において、たくさんのDNA replication関連遺伝子の発現を検出することができた。この細胞はDNA合成期にあったと考えられる。また、他の細胞においても、DNA replication関連遺伝子の一部の発現が認められたことから、この細胞はGO期にあってもまだ分裂能を秘めた細胞であった可能性が考えられる。これらの結果はGABAergic intermediate progenitorが脳室下帯に多く含まれていることを示唆している。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2008 2006

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 2 results)

  • [Journal Article] Method for single-cell microarray analysis and application to gene-expression profiling of GABAergic neuron progenitors.2008

    • Author(s)
      Esumi S, Wu SX, Yanagawa Y, Obata K, Sugimoto Y, Tamamaki N.
    • Journal Title

      Neuroscience Research 60(4)

      Pages: 439-451

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The protocadherin-alpha family is involved in axonal coalescence of olfactory sensory neurons into glomeruli of the olfactory bulb in mouse.2008

    • Author(s)
      Hasegawa S, Hamada S, Kumode Y, Esumi S, Katori S, Fukuda E, Uchiyama Y, Hirabayashi T, Mombaerts P, Yagi T.
    • Journal Title

      Molecular Cellular Neuroscience Feb 13

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 分注RT-PCR法を用いた単一プルキンエ細胞における対立染色体での差次的遺伝子発現解析2008

    • Author(s)
      江角重行、金子涼輔、八木健
    • Journal Title

      実験医学 25(9)

      Pages: 1359-1366

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Journal Article] Split single-cell RT-PCR analysis of Purkinje cell.2006

    • Author(s)
      Shigeyuki Esumi, Ryosuke Kaneko, Yoshimi Kawamura, Takeshi Yagi
    • Journal Title

      Nature Protocols 1,(2143-2151) (2006) 1(4)

      Pages: 2143-2151

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Allelic gene regulation of protocadherin-alpha and -gamma clusters involving both monoallelic and biallelic expression in single Purkinje cells.2006

    • Author(s)
      Kaneko R, Kato H, Kawamura Y, Esumi S, Hirayama T, Hirabayashi T, Yagi T
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry 281(41)

      Pages: 30551-30560

    • Related Report
      2006 Annual Research Report

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Published: 2006-04-01   Modified: 2016-04-21  

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