Development of the method for molecular haplotyping using DNA probes with molecular recognition ability

Research Project

Project/Area Number	18750066
Research Category	Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Allocation Type	Single-year Grants
Research Field	Analytical chemistry
Research Institution	Tokyo University of Technology
Principal Investigator	KATO Teru Tokyo University of Technology, 応用生物学部, 講師 (00367195)
Project Period (FY)	2006 – 2008
Project Status	Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help	¥3,770,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥270,000) Fiscal Year 2008: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000) Fiscal Year 2007: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000) Fiscal Year 2006: ¥1,400,000 (Direct Cost: ¥1,400,000)
Keywords	ハプロタイプ / 遺伝子多型 / 一塩基多型 / SNP / 遺伝子診断 / 個別化医療 / 遺伝子 / 核酸 / 臨床検査 / SNPs
Research Abstract	同一染色体(DNA分子)上の複数の遺伝子多型の組み合わせ,すなわちハプロタイプは,一塩基多型(SNPs)などの個別の多型と同様,またはそれ以上に個人の薬剤応答性や疾患リスクの予測に有用と考えられている。本研究では,標的遺伝子配列にDNAプローブを結合させてDNAの分岐構造であるthree-way junction(TWJ)を形成させ,TWJとコール酸の親和性を利用して一対の対立遺伝子を一塩基の違いに基づいて分離することにより,微生物を用いたクローニングなどの煩雑な操作を必要としない,迅速・簡便なハプロタイプ解析法の開発を行った。