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リン原子の絶対立体配置を厳密に制御したDNA類縁体の合成法の開発

Research Project

Project/Area Number 18750143
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Chemistry related to living body
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

岡 夏央  The University of Tokyo, 大学院・新領域創成科学研究科, 助教 (50401229)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥3,500,000 (Direct Cost: ¥3,500,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,800,000 (Direct Cost: ¥1,800,000)
Keywordsオキサザホスホリジン / H-ホスホネート / 立体選択的 / リン原子修飾DNA類縁体 / 固相合成 / ホスホロアミデート / ボラノホスフェート / 核酸医薬 / オキサザボスホリジン / DNA / リン原子修飾DNA / 立体化学 / 立体選択性 / ホスファイト
Research Abstract

研究代表者らは平成18年度の研究において、ヌクレオシド3'-O-オキサザホスホリジン誘導体を用いるH-ホスホネートインターヌクレオチド結合の高立体選択的合成法の開発に成功した。平成19年度の研究では、この手法を固相法によるオリゴマー合成へと応用し、固相担体上において、リン原子の絶対立体配置を厳密に制御したH-ホスホネートDNAのオリゴマーを合成することに成功した。これは、立体化学的に純粋なH-ホスホネートDNAオリゴマーの初めての合成例であり、極めて画期的な実験結果と言える。このH-ホスホネートDNAオリゴマーは化学的に不安定であり、そのままでの単離精製は困難であるが、リン原子に対して更なる修飾を施すことによって、立体化学的な純度を保ったまま、種々のリン原子修飾DNA類縁体へと変換できることが期待される。そこで、固相担体上で立体化学的に純粋なジチミジンH-ホスホネートを合成し、リン原子の修飾反応に関する検討を行ったところ、リン原子上に硫黄原子(ホスホロチオエート型)、窒素原子(ホスホロアミデート型)、ホウ素原子(ボラノホスフェート型)、ヒドロキシメチル基(ヒドロキシメチルホスホネート型)を導入したリン原子修飾DNA類縁体について、収率84-95%、立体選択性〓99:1で合成することができた。これらリン原子修飾DNA類縁体の内、ホスホロチオエート型を除く3種に関しては、既存の手法では立体化学的に純粋な形での入手が極めて困難である。本研究の成果を受けて、今後、これらを核酸医薬として応用する研究への展開が期待される。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2008 2007 2006 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Synthesis of glycosyl boranophosphates and their applications as precursors of glycosyl phosphate analogues.2008

    • Author(s)
      Matsumura, F.; Oka, N.; Wada, T.
    • Journal Title

      Organic Letters 10

      Pages: 1557-1560

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Protein-based peptide-bond formation by aminoacyl-tRNA protein transferase.2007

    • Author(s)
      Watanabe, K.; Toh, Y.; Suto, K.; Shimizu, Y.; Oka. N.; Wada, T.; Tomita, K.
    • Journal Title

      Nature 449

      Pages: 867-871

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Stereocontrolled synthesis of H-phosphonate DNA.2006

    • Author(s)
      Iwamoto, N., Sato, T., Oka, N., Wada, T.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symp.Ser. 50

      Pages: 159-160

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Solid-phase synthesis of stereoregulated oligodeoxyribonucleoside phosphorothioates.2006

    • Author(s)
      Oka, N., Yamamoto, M., Sato, T., Wada, T.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symp.Ser. 50

      Pages: 123-124

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Presentation] リン原子の立体を制御したPS/POキメラオリゴヌクレオチドの固相合成2008

    • Author(s)
      岡夏央・山本美佳・佐藤輝聴・和田猛
    • Organizer
      日本化学会第88春季年会
    • Place of Presentation
      立教大学池袋キャンパス
    • Year and Date
      2008-03-26
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] H-ホスホネートDNAの立体選択的合成とインターヌクレオチド修飾型DNA類縁体への変換反応2008

    • Author(s)
      岩本直樹・岡夏央・和田猛
    • Organizer
      日本化学会第88春季年会
    • Place of Presentation
      立教大学池袋キャンパス
    • Year and Date
      2008-03-26
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Nucleoside H-boranophosphonates: synthesis and properties of a new class of nucleotide analogs.2007

    • Author(s)
      Higashida, R.; Kawanaka, T.; Oka, N.; Wada, T.
    • Organizer
      第5回国際核酸化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学本郷キャンパス
    • Year and Date
      2007-11-20
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/moldes/index.html

    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2006-04-01   Modified: 2016-04-21  

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