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放射光真空紫外円二色性による生体分子の構造解析

Research Project

Project/Area Number 18750151
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Chemistry related to living body
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

松尾 光一  広島大, 研究員 (40403620)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥3,400,000 (Direct Cost: ¥3,400,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,300,000)
Fiscal Year 2006: ¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Keywords放射光 / 真空紫外円二色性 / 生体分子 / 構造解析 / 多糖類 / タンパク質 / 変性状態
Research Abstract

広島大学放射光科学研究センターの真空紫外円二色性(VUVCD)分散計を用い,多糖類や変性タンパク質のVUVCDスペクトルを測定し、VUVCD分光法の生体分子構造解析への有用性を検討した。
硫酸基やカルボキシル基を持つ6種類の多糖類(コンドロイチン・コンドロイチン硫酸(A, B, C)・ヒアルロン酸・ヘパリン)のVUVCDスペクトルを160nmまで行い、これら発色団の位置や配向に依存した特徴的なCDを得ることができた。また、分光学的解析法からCDと多糖類の立体構造との関係を明らかにすると共に、単糖類と同様に多糖類においてもC-5位のヒドロキシメチル基の平衡状態(トランス・ゴーシュ)の変化が、CDに大きく寄与していることが分かった。
3種類のタンパク質(Metmyoglobin・thioredoxin・staphylococcal nuclease)の酸・熱・低温変性状態のVUVCDスペクトルを172nmまで測定し、塩酸グアニジン変性状態との比較からこれら変性状態においても多くの二次構造が保持されていることが分かった。31種類の天然タンパク質のVUVCDスペクトルを参照データとし、プログラムSELCON3で二次構造解析をした結果、天然状態に比べHelixは減少、Strand・PPII・Unorderedは増加することが確認された。また、これらの変性状態には、水素結合を持たないStrand構造が多く存在していることが明らかとなった。
以上の結果から、VUVCD分光法が、生体分子の構造解析に対して有効であることが示された。

Report

(1 results)
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2006 Other

All Journal Article (3 results)

  • [Journal Article] Vacuum-ultraviolet circular dichroism analysis of biomaterials2006

    • Author(s)
      K.Gekko
    • Journal Title

      Chirality 18

      Pages: 329-334

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Selective metal binding by Vanabin2 from the vanadium-rich Ascidian, Ascidia sydneiensis samea2006

    • Author(s)
      N.Kawakami
    • Journal Title

      Biochim Biophys. Acta 1760

      Pages: 1096-1101

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Secondary-Structure Analysis of Denatured Proteins by Vacuum-Ultraviolet Circular Dichroism Spectroscopy

    • Author(s)
      K.Matsuo
    • Journal Title

      Biophys.J (In press)

    • Related Report
      2006 Annual Research Report

URL: 

Published: 2006-04-01   Modified: 2016-04-21  

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