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細胞内蛋白質を可視化できるバイオプローブの開発

Research Project

Project/Area Number 18750159
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Chemistry related to living body
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

阿部 洋  The Institute of Physical and Chemical Research, 伊藤ナノ医工学研究室, 研究員 (80415067)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥3,700,000 (Direct Cost: ¥3,700,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,800,000 (Direct Cost: ¥1,800,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Keywords蛋白質 / 蛍光 / アプタマー / 消光 / タンパク質検出 / 蛍光発生化合物 / 試験管内進化法
Research Abstract

前回まで、蛋白質と化学反応することで蛍光発生する分子プローブの開発を目指していたが、蛋白質との化学反応性が低いプローブしか得られず、その開発は難しかった。一方、我々は遺伝子検出プローブとして、最近開発した分子は1分子内での蛍光のon/offが可能であり、蛋白質検出にも応用可能であることが期待された。この分子はアジドメチル基を持ち、トリフェニルボスフィン等の還元剤によってアジド基が還元されることにより構造変化が起こり蛍光を発することが可能となる。
今回、アジドメチル基を有する蛍光分子をもちいた化学反応を引金とする蛍光発光システムによるタンパク質およびペプチド検出を試みた。標的として17merからなるヒトHIV-1 Revタンパク質のarginine-rich motif(ARM)を選択した。ヒトHIV-1 Rev ARMペプチドには35merからなるRNAアプタマーが結合することがこれまでに報告されている。そこでこのRNAアプタマー配列を2分割し、ペプチド検出用プローブとすることにした。配列の異なる2種類のプローブのうち、一方にはアジドメチル基を有する蛍光分子を結合させ、もう一方のプローブには還元剤であるトリフェニルホスフィン基を導入した。この2種類のプローブを用いることで溶液中のRev ARMペプチドの検出を試みた。50mM Tris-HC1溶液中37℃で30分間反応させた結果、Rev ARMペプチド存在下の場合、非存在下の場合と比較してその蛍光強度が約25倍に増強することが示された。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2008 2007 2006

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Chemical Aminoacylation of RNA by an intermolecular Adenosine Transfer Reaction2008

    • Author(s)
      劉明哲、他
    • Journal Title

      Chemistry Letters 37

      Pages: 102-103

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Rapid DNA Chemical Ligation for Amplification of RNA and DNA Signal2007

    • Author(s)
      阿部洋、他
    • Journal Title

      Bioconjyugate Chemistry 19

      Pages: 327-333

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of adenophostin A analogues conjugating an aromatic group at the 5'-position as potent IP3 receptor ligands.2006

    • Author(s)
      T.Mochizuki, Y.Kondo, H.Abe, S.C.Tovey, S.G.Dedos, C.W.Taylor, M.Paul, B.V.Potter, A.Matsuda, S.Shuto
    • Journal Title

      Journal of Medicinal Chemistry 49

      Pages: 5750-5758

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Design and synthesis of 5'-deoxy-5'-phenyladenophostin A, a highly potent IP3 receptor ligand.2006

    • Author(s)
      T.Mochizuki, Y.Kondo, H.Abe, C.W.Taylor, B.V.L.Potter, A.Matsuda, S.Shuto
    • Journal Title

      Organic Letter 8

      Pages: 1455-1458

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] alpha -C-glucoside trisphosphates based on the conformational restriction strategy.2006

    • Author(s)
      M.Terauchi, H.Abe, S.C.Tovey, S.G.Dedos, C.W.Taylor, M.Paul, M.Trusselle, B.V.L.Potter, A.Matsuda, S.Shuto
    • Journal Title

      Journal of Medicinal Chemistry 49

      Pages: 1900-1909

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Flow cytometric detection of specific RNAs in native human cells with quenched auto ligating FRET probes2006

    • Author(s)
      H.Abe, E.T.Kool
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences USA 103

      Pages: 263-268

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Presentation] 化学的DNA連結反応における連結生成物の増幅2008

    • Author(s)
      近藤裕子
    • Organizer
      第11回生体触媒化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      鳥取県民文化会館
    • Year and Date
      2008-01-25
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 化学的DNA連結反応における生成物の増幅2007

    • Author(s)
      近藤裕子
    • Organizer
      第22回生体関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      東北大学多元物質科学研究所
    • Year and Date
      2007-09-28
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2006-04-01   Modified: 2016-04-21  

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