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転移因子LINEの転移・増幅に関わる宿主因子の探索

Research Project

Project/Area Number 18770004
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Genetics/Genome dynamics
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

梶川 正樹  Tokyo Institute of Technology, 大学院・生命理工学研究科, 講師 (90361766)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥3,700,000 (Direct Cost: ¥3,700,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,800,000 (Direct Cost: ¥1,800,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Keywords転移因子 / レトロトランスポゾン / レトロポゾン / 宿主因子 / DNA損傷修復 / NHEJ / 逆転写酵素
Research Abstract

転移因子Long Interspersed Element (LINE)は、様々な真核生物のゲノム中に広く存在し、我々真核生物のゲノム進化に大きな影響を及ぼしていることが知られている。たとえば、ヒトゲノムDNA中にはおよそ85万コピーの転移因子LINE配列が存在し、ヒトゲノムの約20%を構成している。 LINEがいかにしてこのように莫大なコピー数を獲得することができたのか、その転移・増幅機構についてはいまだ多くのなぞが残されている。 LINEの転移・増幅には、自身のコードするタンパク質(LINEタンパク質)と宿主のコードするタンパク質(宿主タンパク質)がかかわると考えられている。 LINE転移におけるLINEタンパク質の機能解析は進められているが、LINE転移における宿主タンパク質の役割はほとんど解析されておらず、LINE転移にどのような宿主タンパク質が係わるのか明らかにされていない。私は、LINE転移にかかわる宿主タンパク質を同定するため、ニワトリDT40細胞内でLINE転移を検出する実験系を構築した。DT40細胞の様々な遺伝子欠損株を用いてLINEの転移頻度を測定することにより、宿主細胞のDNA修復系、特に非相同末端結合経路(NHEJ)に係わる宿主タンパク質がLINE転移に係わることを発見した。また、NHEJ欠損細胞株内でのLINE転移の解析により、NHEJ修復系が、LINE配列5'末端と宿主ゲノムの連結に関わることを見い出した。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2007 2006

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] A new system for analyzing LINE retrotransposition in the chicken DT 40 cell line widely used for reverse genetics.2007

    • Author(s)
      Honda, Ichiyanagi, Suzuki, Ono, Koyama, Kajikawa, Okada
    • Journal Title

      Gene 395

      Pages: 116-124

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Novel sex pheromone desaturases in the genomes of corn borers generated through gene duplication and retroposon fusion.2007

    • Author(s)
      Xue, Rooney, Kajikawa, Okada, Roelofs
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104

      Pages: 4467-4472

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Functional splice sites in a zebrafish LINE and their influence on zebrafish gene expression.2007

    • Author(s)
      Tamura, Kiajikawa, Okada
    • Journal Title

      Gene 390

      Pages: 221-231

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Novel retrotransposon analysis reveals multiple mobility pathways dictated by hosts.2007

    • Author(s)
      Ichiyanagi, Nakajima, Kajikawa, Okada
    • Journal Title

      Genome Res. 17

      Pages: 33-41

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Solution structure and functional importance of a conserved RNA hairpin of eel LINE UnaL2.2006

    • Author(s)
      Nomura, Kajikawa, Baba, Nakazato, Imai, Sakamoto, Okada, Kawai
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res. 34

      Pages: 5184-5193

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Presentation] Reconstruction of TPRT in vitro using the zebrafish LINE ZfL2-l2007

    • Author(s)
      Kajikawa>, Matsui Norihiro Okada
    • Organizer
      2007 FASEB Summer Research Conferences (Mobile Elements in Mammalian Genomes)
    • Place of Presentation
      Tucson, Arizona
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2006-04-01   Modified: 2016-04-21  

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