Phylogenetic relationships among almost all species of Nitella (Characeae, Charales)

• Project/Area Number: 18770071
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Biodiversity/Systematics
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: SAKAYAMA Hidetoshi The University of Tokyo, 大学院総合文化研究科, 助教 (60391108)
• Project Period (FY): 2006 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥3,810,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥210,000); Fiscal Year 2008: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000); Fiscal Year 2007: ¥1,400,000 (Direct Cost: ¥1,400,000); Fiscal Year 2006: ¥1,500,000 (Direct Cost: ¥1,500,000)
• Keywords: 分類体系 / 植物 / 藻類 / シャジクモ藻類 / Nitella属 / 系統分類 / 分子系統 / 卵胞子 / シャジクモ類 / 分類 / 系統 / 分子系統解析 / 進化

Research Abstract

シャジクモ藻類Nitella属は世界中に広く分布し、大部分は特異な形態や生態を示す地域固有種である。本研究で世界中から多くの重要な種を採集し、分子系統解析によってそれらの系統関係を調査した結果、Nitella属は単系統群(共通祖先から派生した種をすべて含むグループ)ではなく、従来の分類体系は実際の系統関係と大きく矛盾していることが明らかになった。本研究の結果に基づいて従来の分類体系の矛盾点を修正し、その成果の一部を国際誌および学会で発表し、新分類体系構築への方向性を示した。

Research Products

• [Journal Article] Taxonomic reexamination of Ghara globularis (Charales, Uharophyceae) from Japan based on oospore morphology and rbcL gene sequences, and the description of C (2009)
  • Author(s): Sakayama, H., Kasai, F., Kawachi, M., Watanabe, M.M., Nozaki, H., Nishihiro, J., Washitani, I., Shigyo, M., Krienitz, L. & Ito
  • Journal Title: Journal of Phycoclogy 48(4)(In press)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Taxonomy of Nitella (Charales, Charophyceae) based on comparative morphology of oospores and multiple DNA marker phylogeny using cultured material (2008)
  • Author(s): Sakayama, H
  • Journal Title: Phycological Research 56 Pages: 202-215
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Morphological variation and intraspecific phylogeny of the ubiquitous species Chara braunii (Charales, Charophyceae) in Japan (2008)
  • Author(s): Kato, S., Sakayama, H., Sano, S., Kasai, F., Watanabe, M. M., Tanaka, J. & Nozaki, H
  • Journal Title: Phycologia 47 Pages: 191-202
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Morphological variation and intraspecific phylofeny of the ubiquitous species Chara braunii (Charales, Charophyceae) in Japan (2008)
  • Author(s): Kato, S., Sakayama, H., Sano, S., Kasai, F., Watanabe, M. M., Tanaka, J. & Nozaki, H.
  • Journal Title: Phycologia 47 Pages: 191-202
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Taxonomy of Nitella (Charales, Charophyceae) based on comparative morphology of oospores and multiple DNA marker phylogeny using cultured material (2008)
  • Author(s): Sakayama, H.
  • Journal Title: Phycological Research 56 Pages: 202-215
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Seasonality of gametophyte occurrence, maturation and fertilization of the freshwater red alga Thorea okadae (Thoreales, Rhodophyta) in the Kikuchi River, Japan (2007)
  • Author(s): Higa, A., Kasai, F., Kawachi, M., Kumano, S., Sakayama, H., Miyashita, M. & Watanabe, M. M
  • Journal Title: Phycologia 46 Pages: 160-167
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Seasonality of gametophyte occurrence, maturation and fertilization of the freshwater red alga Thorea okadae (Thoreales, Rhodophyta) in the Kikuchi River, Japan (2007)
  • Author(s): Higa, A., Kasai, F., Kawachi, M., Kumano, S., Sakayama, H., Miyashita, M., Watanabe, M.M
  • Journal Title: Phycologia 46 Pages: 160-167
• [Journal Article] Morphology, molecular phylogeny and taxonomy of Nitella comptonii (Charales, Characeae) (2006)
  • Author(s): Sakayama, H., Arai, S., Nozaki, H., Kasai, F. & Watanabe, M. M
  • Journal Title: Phycologia 45 Pages: 417-421
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Morphology, molecular phylogeny and taxonomy of Nitella comptonii (Charales, Characeae) (2006)
  • Author(s): Sakayama, H., Arai, S., Nozaki, H., Kasai, F., Watanabe, M.M.
  • Journal Title: Phycologia 45 Pages: 417-421
• [Journal Article] Taxonomic reexamination of Chara globularis (Charales, Charophyceae) from Japan based on oospore morphology and rbcL gene sequences, and the description of C. leptospora sp. Nov. Journal of Phycology
  • Author(s): Sakayama, H., Kasai, F., Kawachi, M., Watanabe, M. M., Nozaki, H., Nishihiro, J., Washitani, I., Shigyo, M., Krienitz, L. & Ito, M
  • Journal Title: Journal of Phycology (In press)
  • Peer Reviewed
• [Presentation] シャジクモ類におけるLEAFY遺伝子ホモログの単離 (2009)
  • Author(s): 坂山英俊・伊藤元己
  • Organizer: 日本藻類学会第33回大会
  • Place of Presentation: 沖縄(琉球大学)
  • Year and Date: 2009-03-28
• [Presentation] シャジクモ(Chara braunii)の生殖器官形成の解析 (2009)
  • Author(s): 佐藤真知子・坂山英俊・関本弘之・伊藤元己
  • Organizer: 日本藻類学会第33回大会
  • Place of Presentation: 沖縄(琉球大学)
  • Year and Date: 2009-03-27
• [Presentation] 絶滅危惧種であるシャジクモ類の生育と水質および周辺環境の影響について (2009)
  • Author(s): 笠井文絵・平林周一・坂山英俊・野崎久義・石本美和・宮地和幸・加藤 将・佐野郷美・森嶋秀治・大森雄治・樋口澄男・久米 修・松重一夫・須戸 幹・白岩善博・渡邉 信
  • Organizer: 日本藻類学会第33回大会
  • Place of Presentation: 沖縄(琉球大学)
  • Year and Date: 2009-03-27
• [Presentation] 青森県の鷹架沼で発見された日本新産シャジクモ類の1種について (2009)
  • Author(s): 加藤 将・坂山英俊・森嶋秀治・佐野郷美・大森雄治・加藤僖重・伊藤元己・笠井文絵・渡辺 信・野崎久義
  • Organizer: 日本植物分類学会第8回大会
  • Place of Presentation: 仙台(宮城県民会館)
  • Year and Date: 2009-03-13
• [Presentation] Taxonomy and phylogeny of the extant genus Nitella (2008)
  • Author(s): Sakayama, H., Garcia, A., Chivas, A., Nozaki, H. & Ito, M
  • Organizer: 第5回シャジクモ研究グループ国際シンポジウム
  • Place of Presentation: ドイツ(ロストック大学)
  • Year and Date: 2008-09-26
• [Presentation] 日本の池沼におけるシャジクモ類の衰退-香川県のため池を例として (2008)
  • Author(s): 笠井文絵・坂山英俊・野崎久義・石本美和・平林周一・宮地和幸・加藤将・佐野郷美・森嶋秀治・大森雄治・樋口澄男・久米修・松重一夫・須戸幹・白岩善博・渡邉信
  • Organizer: 日本植物学会第72回大会
  • Place of Presentation: 高知(高知大学)
  • Year and Date: 2008-09-26
• [Presentation] シャジクモ(Chara braunii)における生卵器形成抑制現象の解析 (2008)
  • Author(s): 佐藤真知子・坂山英俊・関本弘之・伊藤元己
  • Organizer: 日本植物学会第72回大会
  • Place of Presentation: 高知(高知大学)
  • Year and Date: 2008-09-26
• [Presentation] 日本の池沼におけるシャジクモ類の衰退口香川県のため池を例として (2008)
  • Author(s): 笠井文絵・坂山英俊・野崎久義・石本美和・平林周一・宮地和幸・加藤将・佐野郷美・森嶋秀治・大森雄治・樋口澄男・久米修・松重一夫・須戸幹・白岩善博・渡邉信
  • Organizer: 日本植物学会第72回大会
  • Place of Presentation: 高知(高知大学)
  • Year and Date: 2008-09-26
• [Presentation] Taxonomy of species of Nitella subgenus Tieffallenia and subgenus Hyella: phylogeny based on rbcL gene sequences and oospore morphology (2008)
  • Author(s): Garcia, A., Sakayama, H., Nozaki, H., Ito, M. & Chivas, A
  • Organizer: 第5回シャジクモ研究グループ国際シンポジウム
  • Place of Presentation: ドイツ(ロストック大学)
  • Year and Date: 2008-09-25
• [Presentation] Taxonomy of species of Nitella subgenus Tieffallenia and subgenus Hyella : phylogeny based on rbeL gene sequences and oospore morphology (2008)
  • Author(s): Garcia, A., Sakayama, H., Nozaki, H., Ito, M. & Chivas, A.
  • Organizer: 第5回シャジクモ研究グループ国際シンポジウム
  • Place of Presentation: ドイツ(ロストック大学)
  • Year and Date: 2008-09-25
• [Presentation] 車軸藻とは (2008)
  • Author(s): 坂山英俊
  • Organizer: 第3回車軸藻シンポジウム
  • Place of Presentation: 市川(市川教育会館)
  • Year and Date: 2008-05-24
• [Presentation] 日本産カタシャジクモの分類学的再検討 (2008)
  • Author(s): 坂山英俊・野崎久義・笠井文絵・渡辺 信・伊藤元己
  • Organizer: 日本藻類学会第32回大会
  • Place of Presentation: 東京(東京海洋大学)
  • Year and Date: 2008-03-23
• [Presentation] 日本産カタシャジクモの分類学的再検討 (2008)
  • Author(s): 坂山英俊・野崎久義・笠井文絵・渡辺信・伊藤元己
  • Organizer: 日本藻類学会第32回大会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2008-03-23
• [Presentation] シャジクモ類フラスコモ(Nitella)属の系統関係と形態進化 (2008)
  • Author(s): 坂山英俊・Adriana Garcia・野崎久義・伊藤元己
  • Organizer: 日本植物分類学会第7回大会
  • Place of Presentation: 東京(首都大学東京)
  • Year and Date: 2008-03-21
• [Presentation] シャジクモ類フラスコモ(Nitella)属の系統関係と形態進化 (2008)
  • Author(s): 坂山英俊・Adriana Garcia・野崎久義・伊藤元己
  • Organizer: 日本植物分類学会第7回大会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2008-03-21
• [Presentation] 保全生物学とDNAバーコーディング: シャジクモ類を例に (2008)
  • Author(s): 坂山英俊
  • Organizer: 日本生態学会55回大会
  • Place of Presentation: 福岡(福岡国際会議場)
  • Year and Date: 2008-03-14
• [Presentation] 保全生物学とDNAバーコーディング : シャジクモ類を例に (2008)
  • Author(s): 坂山英俊
  • Organizer: 日本生態学会55回大会
  • Place of Presentation: 福岡
  • Year and Date: 2008-03-14
• [Presentation] 複数の核DNA領域による日本産Chara braunii(シャジクモ目)の種内解析 (2008)
  • Author(s): 加藤将・坂山英俊・三沢計治・佐野郷美・笠井文絵・渡邉信・田中次郎・野崎久義
  • Organizer: 日本植物分類学会第7回大会
  • Place of Presentation: 東京(首都大学東京)
• [Presentation] 複数の核DNA領域による日本産Chara braunii(シャジクモ目)の種内解析 (2008)
  • Author(s): 加藤将・坂山英俊・三沢計治・佐野郷美・笠井文絵・渡邉信・田中次郎・野崎久義
  • Organizer: 日本植物分類学会第7回大会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] シャジクモ藻類フラスコモ属の全系統関係の解明に向けて (2007)
  • Author(s): 坂山英俊・Adriana Garcia・野崎久義・伊藤元己
  • Organizer: 日本植物学会第71回大会
  • Place of Presentation: 野田(東京理科大学)
  • Year and Date: 2007-09-08
• [Presentation] シャジクモ藻類フラスコモ属の全系統関係の解明へ向けて (2007)
  • Author(s): 坂山英俊・Adriana Garcia・野崎久義・伊藤元己
  • Organizer: 日本植物学会第71回大会
  • Place of Presentation: 野田
  • Year and Date: 2007-09-08
• [Presentation] 2007 Analyses of the ubiquitous species Chara braunii (Charales) in Japan, based on the morphology, chloroplast and nuclear DNA sequences (2007)
  • Author(s): Kato, S., Sakayama, H., Misawa, K., Sano, S., Kasai, F., Watanabe, M. M., Tanaka, J. & Nozaki, H
  • Organizer: アメリカ藻類学会第61回大会
  • Place of Presentation: Crowne Plaza Hotel in Providence-Warwick, Rhode Island, USA
  • Year and Date: 2007-08-08
• [Presentation] Analyses of the ubiquitous species Chara braunii (Charales) in Japan, based on the morphology, chloroplast and nuclear DNA sequences (2007)
  • Author(s): Kato, S., Sakayama, H., Misawa, H., Sano, S., Kasai, F., Watanabe, M. M., Tanaka, J. & Nozaki, H.
  • Organizer: アメリカ藻類学会, 61st PSA meeting
  • Place of Presentation: Rhode Island, USA
  • Year and Date: 2007-08-08
• [Presentation] 車軸藻とは (2007)
  • Author(s): 坂山英俊
  • Organizer: 第2回車軸藻シンポジウム
  • Place of Presentation: 長野(信濃町公民館野尻湖支館)
  • Year and Date: 2007-07-21
• [Presentation] 車軸藻とは (2007)
  • Author(s): 坂山英俊
  • Organizer: 第2回車軸藻シンポジウム
  • Place of Presentation: 長野
  • Year and Date: 2007-07-21
• [Presentation] シャジクモ藻類フラスコモ属の全系統関係の解明 (I) (2007)
  • Author(s): 坂山英俊・Adriana Garcia・野崎久義・伊藤元己
  • Organizer: 日本藻類学会第31回大会
  • Place of Presentation: 神戸(神戸大学)
  • Year and Date: 2007-03-24
• [Presentation] 車軸藻類の分類と生態 (2006)
  • Author(s): 坂山英俊
  • Organizer: 日本植物学会第70回大会
  • Place of Presentation: 熊本(熊本大学)
  • Year and Date: 2006-09-15
• [Book] 基礎生命科学実験 第2版(DVDつき) (2009)
  • Author(s): 青木誠志郎、浅島 誠、池内昌彦、石井直方、坂山英俊、(他24名, 東京大学教養学部基礎生命科学実験編集委員会編)(分担執筆)
  • Total Pages: 205
  • Publisher: 東京大学出版会
• [Book] 基礎生命科学実験、第2版(DVDつき, 東京大学教養学部基礎生命科学実験編集委員会編) (2009)
  • Author(s): 青木誠志郎、浅島誠、池内昌彦、石井直方、坂山英俊, 24名
  • Total Pages: 205
  • Publisher: 東京大学出版会
• [Book] シャジクモ科(15種を担当). 環境省版レッドリスト付属説明資料. 植物II(維管束植物以外) (2009)
  • Author(s): 坂山英俊
  • Publisher: 財団法人自然環境研究センター(印刷中)
• [Book] 14.4.陸上植物の進化. 図説生物学(仮)(図説生物学編集委員会編) (2009)
  • Author(s): 坂山英俊
  • Total Pages: 2
  • Publisher: 東京大学出版会(印刷中)
• [Book] シャジクモ科 牧野新日本植物図鑑(全22種を担当) (2008)
  • Author(s): 坂山英俊(改訂・分担執筆)
  • Publisher: 北隆館
• [Book] シャジクモ科.牧野新日本植物図鑑 (2008)
  • Author(s): 坂山英俊
  • Total Pages: 6
  • Publisher: 北隆館
• [Book] 基礎生命科学実験(DVDつき) (2007)
  • Author(s): 青木誠志郎・浅島 誠・池内昌彦・石井直方・坂山英俊、(他19名, 東京大学教養学部基礎生命科学実験編集委員会編)(分担執筆)
  • Total Pages: 205
  • Publisher: 東京大学出版会
• [Book] 基礎生命科学実験 (2007)
  • Author(s): 東京大学教養学部 基礎生命科学実験編集委員会 編
  • Total Pages: 205
  • Publisher: 東京大学出版会
• [Book] 冊子"しゃじくも"-車軸藻類の保全をめざして- (2006)
  • Author(s): 大森雄治、笠井文絵、加藤 将、坂山英俊 (他6名)(シャジクモ調査グループ編)(分担執筆)
  • Total Pages: 8
  • Publisher: 国立環境研究所
• [Book] 14. 4. 陸上植物の進化 図説生物学(仮)
  • Author(s): 坂山英俊 (図説生物学編集委員会編)(分担執筆)
  • Publisher: 東京大学出版会(印刷中)
• [Book] シャジクモ科 環境省版レッドリスト付属説明資料 植物II (維管束植物以外)(15種を担当)
  • Author(s): 坂山英俊(分担執筆)
  • Publisher: 財団法人自然環境研究センター(印刷中)
• [Remarks] しゃじくも-車軸藻類の保全を目指して-
  • URL: http://www.nies.go.jp/biology/mcc/Chara2006/chara-index.htm
• [Remarks] しゃじくも-車軸藻類の保全を目指して-
  • URL: http://www.nies.go.jp/biology/mcc/Chara2006/chara-index.htm
• [Remarks] しゃじくも-車軸藻類の保全を目指して-
  • URL: http://www.nies.go.jp/biology/mcc/Chara2006/chara-index.htm