Topogenesis of membrane proteins via the ER translocon

• Project/Area Number: 18770095
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Structural biochemistry
• Research Institution: University of Hyogo
• Principal Investigator: KIDA Yuichiro University of Hyogo, 大学院・生命理学研究科, 助教 (10423899)
• Project Period (FY): 2006 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2008: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2007: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000); Fiscal Year 2006: ¥1,500,000 (Direct Cost: ¥1,500,000)
• Keywords: 膜タンパク質 / シグナル配列 / 膜透過 / トランスロコン / 小胞体 / フォールディング / タンパク質膜透過 / 膜組み込み / 膜トポロジー / 生体膜 / オルガネラ / 膜蛋白質 / 蛋白質膜透過

Research Abstract

細胞及び細胞内小器官を取り囲む生体膜に埋まり込んでいる「膜タンパク質」は、膜内外の物質輸送、情報交換、膜構造の形成・維持に機能している。細胞内に存在する膜タンパク質の半分以上が、小胞体タンパク質膜透過チャネル(トランスロコン)を介して膜に組み込まれる。本研究では、膜貫通配列の小胞体膜組み込み制御系を構築し、組み込み過程を詳細に解析することで、膜貫通の方向性(膜トポロジー)の形成過程、及びトランスロコンの活動時の挙動に関する知見を得た。

Research Products

• [Journal Article] Signal-anchor sequence provides motive force for polypeptide-chain translocation through the ER membrane (2009)
  • Author(s): Kida, Y., Morimoto, F., and Sakaguchi, M
  • Journal Title: J. Biol. Chem 284 Pages: 2861-2866
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Signal-anchor sequence provides motive force for polypeptide-chain translocation through the ER membrane (2009)
  • Author(s): 木田祐一郎
  • Journal Title: The Journal of Biological Chemistry 284 Pages: 2861-2866
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Human ABC transporter isoform B6 (ABCB6) localizes primarily in the Golgi apparatus (2008)
  • Author(s): Tsuchida, M., Emi, Y., Kida, Y., and Sakaguchi, M
  • Journal Title: Biochem. Biophys. Res. Commun 369 Pages: 369-375
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Human ABC transporter isoform B6(ABCB6) localizes primarily in the Golgi annaratus (2008)
  • Author(s): 土田雅史
  • Journal Title: Biochemical and Biophysical Research Communications 369 Pages: 369-375
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Two translocating hydrophilic segments of a nascent chain span the ER membrane during multispanning protein topogenesis (2007)
  • Author(s): Kida, Y., Morimoto, F., and Sakaguchi, M
  • Journal Title: J. Cell Biol 179 Pages: 1441-1452
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Two translocating hydrophilic segments of a nascent chain span the ER membrane during multispanning protein tapogenesis (2007)
  • Author(s): 木田 祐一郎
  • Journal Title: The Journal of Cell Biology 179 Pages: 1441-1452
  • Peer Reviewed
• [Presentation] Dynamic function of ER translocon (2008)
  • Author(s): Sakaguchi, M
  • Organizer: BMB2008
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2008-12-12
• [Presentation] 正荷電アミノ酸残基による小胞体膜透過制御 (2008)
  • Author(s): 藤田英伸
  • Organizer: BMB2008
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2008-12-09
• [Presentation] 膜貫通配列の小胞体膜組み込みダイナ (2008)
  • Author(s): 木田祐一郎
  • Organizer: BMB2008
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2008-12-09
• [Presentation] PMP70のN-末端に存在する小胞体標的化抑制モチーフ (2008)
  • Author(s): 岩下昌平
  • Organizer: BMB2008
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2008-12-09
• [Presentation] ペルオキシソームABC輸送体におけるオルガネラ標的化シグナルの階層構造 (2008)
  • Author(s): 佃美和
  • Organizer: BMB2008
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2008-12-09
• [Presentation] 膜貫通配列の小胞体膜組み込みダイナミクス (2008)
  • Author(s): 木田祐一郎
  • Organizer: BMB2008
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド(神戸市中央区)
  • Year and Date: 2008-12-09
• [Presentation] Lateral movement of a signal-anchor sequence from translocon to lipid environment (2008)
  • Author(s): Kida, Y
  • Organizer: EMBO Conference Series "Control, Co-ordination and Regulation of Protein Targeting and Translocation"
  • Place of Presentation: Ste. Maxime
  • Year and Date: 2008-10-27
• [Presentation] Lateral movement of a signal-anchor sequence from translocon to lipid environment (2008)
  • Author(s): 木田祐一郎
  • Organizer: EMBO conference series "Control, Co-ordination and Regulation of Protein Targeting and Translocation"
  • Place of Presentation: Sainte-Maxime, France
  • Year and Date: 2008-10-26
• [Presentation] 膜貫通配列のトランスロコンを介した水平方向のダイナミクス (2008)
  • Author(s): 木田祐一郎
  • Organizer: 第8 回日本蛋白質科学会年
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2008-06-11
• [Presentation] 膜貫通配列のトランスロコンを介した水平方向のダイナミクス (2008)
  • Author(s): 木田祐一郎
  • Organizer: 第8回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: タワーホール船堀(東京都江戸川区)
  • Year and Date: 2008-06-11
• [Presentation] ポリペプチド鎖小胞体膜透過のシグナルアンカー配列による駆動メカニズム (2007)
  • Author(s): 木田祐一郎
  • Organizer: BMB2007
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2007-12-12
• [Presentation] ABCB6はミトコンドリアではなく細胞内分泌経路に局在する (2007)
  • Author(s): 土田雅史
  • Organizer: BMB2007
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2007-12-12
• [Presentation] PMP70分子内の細胞内局在化シグナルの相互関係 (2007)
  • Author(s): 阪口雅郎
  • Organizer: BMB2007
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2007-12-12
• [Presentation] ポリペプチド鎖小胞体膜透過のシグナルアンカー配列による駆動メカニズム (2007)
  • Author(s): 木田 祐一郎
  • Organizer: BM32007(第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会)
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(横浜市)
  • Year and Date: 2007-12-12
• [Presentation] Translocon accommodates two translocating hydrophilic chains and two signal sequences (2007)
  • Author(s): 木田 祐一郎
  • Organizer: Gordon Research Conference on Protein Transport Across Cell Membranes
  • Place of Presentation: II Ciocco (イタリア・リレッカ)
  • Year and Date: 2007-06-13
• [Presentation] Translocon accommodates two translocating hydrophilic chains and two signal sequences (2007)
  • Author(s): Kida, Y.
  • Organizer: Gordon Research Conference on Protein Transport Across Cell Membranes
  • Place of Presentation: Lucca(Itary)
  • Year and Date: 2007-06-11
• [Presentation] Flexibility of translocon and driving force for polypeptide chain translocation (2007)
  • Author(s): Sakaguchi, M.
  • Organizer: 第59回日本細胞生物学会大会
  • Place of Presentation: 福岡
  • Year and Date: 2007-05-28
• [Presentation] Translocon accommodates two translocating hydrophilic chains and two transmembrane sequences simultaneously (2007)
  • Author(s): Kida, Y.
  • Organizer: 第59回日本細胞生物学会大会
  • Place of Presentation: 福岡
  • Year and Date: 2007-05-28
• [Presentation] 小胞体トランスロコンのポリペプチド鎖収容能力 (2007)
  • Author(s): 木田 祐一郎
  • Organizer: 第40回日本発生生物学会・第59回日本細胞生物学会合同大会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場(福岡市)
  • Year and Date: 2007-05-28
• [Presentation] ポリペプチド鎖小胞体膜透過の膜貫通配列による駆動システム (2007)
  • Author(s): 木田祐一郎
  • Organizer: 第7回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 仙台
  • Year and Date: 2007-05-24
• [Presentation] ポリペプチド鎖小胞体膜透過の膜貫通配列による駆動システム (2007)
  • Author(s): 木田 祐一郎
  • Organizer: 第7回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 仙台国際センター(仙台市)
  • Year and Date: 2007-05-24
• [Presentation] Function of Positive Charges Following Signal-Anchor Sequences during Translocation of the N-terminal domain. (2006)
  • Author(s): Kida, Y.
  • Organizer: 20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 2006-06-23
• [Presentation] シグナルアンカー配列によって引き起こされるポリペプチド鎖膜透過のメカニズム (2006)
  • Author(s): 木田祐一郎
  • Organizer: 第6回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 2006-04-24