• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

ナノ開口基板を用いたGroEL-GroESの結合解離の1分子蛍光イメージング

Research Project

Project/Area Number 18770126
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Biophysics
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

上野 太郎  The University of Tokyo, 大学院・薬学研究科, 助教 (80376590)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥3,700,000 (Direct Cost: ¥3,700,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,400,000 (Direct Cost: ¥1,400,000)
Fiscal Year 2006: ¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Keywordsナノ開口基板 / 1分子蛍光イメージング / シャペロニン
Research Abstract

次世代1分子蛍光イメージング技術として注目されるナノ開口基板を用いた測定法は、全反射照明法を用いた従来の1分子蛍光イメージング法では不可能なμMオーダーの蛍光色素存在下での1分子解析を可能にする。本研究では、この技術を応用してシャペロニンGroELの1分子機能解析を行うことを目的としている。実験を行う過程で、タンパク質から発せられる蛍光がアルミニウムのナノ開口を通過する際に減衰してしまうという問題が明らかになった。そこで、ナノ開口の底部の石英ガラスを数十nm掘り下げ、タンパク質をナノ開口の外部に固定することで蛍光強度の減衰を抑えた。その結果、SNを約2倍向上することに成功した(Miyake, et. al.,投稿中)。300nM以上のGroES存在下では、シャペロニンGroELの両方のリングに2個のGroESが結合したFootball型複合体(FB)が形成されることが分かっている。そこで、この掘り下げ型ナノ開口基板を利用して、500nM蛍光標識GroESと4.5uM無標識GroES存在下でGroELとの結合解離反応を1分子解析した。事前の予想とは異なり、GroELとGroESの結合時間は、FBが形成されない20nMGroES存在下での1分子解析の結果と同じであった。そこで、FBが形成される様子を直接可視化するため、500nM Cy3-GroESと500nM Cy5-GroES存在下で、ナノ開口基板上に固定されたGroELへの相互作用を観察した。ほとんどの場合、両側のリングにGroESが交互に結合解離を繰り返していたが、Cy3-GroESとCy5-GroESが同時に結合している状態も観察されることが明らかになった。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2008 2007

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (8 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Rapid Multi-reagents Exchange TIRFM Microfluidic system for a Single Biomolecular Imaging2007

    • Author(s)
      Takahiro Arakawa
    • Journal Title

      Sensor and Actuator B 128

      Pages: 218-225

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 人工ホットスポットを用いたSAM膜のラマン検出2008

    • Author(s)
      柳沢雅広
    • Organizer
      第55回応用物理学会
    • Place of Presentation
      日本大学船橋キャンパス
    • Year and Date
      2008-03-29
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] ナノ開口基板を用いたシャペロニンの1分子機能解析2007

    • Author(s)
      上野太郎
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-23
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 古細菌型シャペロニンの1分子構造変化計測2007

    • Author(s)
      飯塚怜
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-22
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] GroELのC末端欠損変異はATP加水分解反応を遅くする2007

    • Author(s)
      鈴木深保子
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-21
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] ADPが対称型1:2GroEL-GroES複合体の形成を阻害する2007

    • Author(s)
      鮫島知哉
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-21
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 古細菌型シャペロニンの1分子構造変化計測2007

    • Author(s)
      飯塚怜
    • Organizer
      第80回日本生化学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-13
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] ADPがGroELのtransリングへのATPの結合を阻害することにより2個目のGroESが結合できなくなる2007

    • Author(s)
      鮫島知哉
    • Organizer
      第80回日本生化学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-13
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] GroELのC末端欠損変異はATP加水分解反応を遅くする2007

    • Author(s)
      鈴木深保子
    • Organizer
      第80回日本生化学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-13
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Book] ナノバイオ計測の実際(第12章担当)2007

    • Author(s)
      上野太郎
    • Total Pages
      13
    • Publisher
      講談社サイエンティフィク
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2006-04-01   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi