• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

大腸菌転写因子によるRNAポリメラーゼ機能分化機構の解析

Research Project

Project/Area Number 18770157
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Molecular biology
Research InstitutionHosei University (2007)
Kinki University (2006)

Principal Investigator

山本 兼由  Hosei University, 工学部, 講師 (40351580)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥3,700,000 (Direct Cost: ¥3,700,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,300,000)
Fiscal Year 2006: ¥2,400,000 (Direct Cost: ¥2,400,000)
Keywords大腸菌 / 転写制御 / RNAポリメラーゼ / 情報伝達 / 二成分制御系 / 転写因子 / レスポンスレギュレーター / ニ成分制御系
Research Abstract

ゲノム上で厳密に制御される遺伝子発現の全貌を理解する上で、RNAポリメラーゼの機能分化が重要であると考えられる。大腸菌では、基本転写装置RNAポリメラーゼの分子構造は明らかとされ、DNA結合転写因子によるRNAポリメラーゼの機能分化のモデルが提唱されている。本研究では、単純な特定のアスパラギン酸のリン酸化で活性化するDNA結合性転写因子であるレスポンスレギュレーターについて解析した。昨年度までに、レスポンスレギュレーターは二量体としてDNAに結合し、その活性化がDNAポリメラーゼの機能を変化させ、転写制御する可能性を示唆した。解析したレスポンスレギュレーターのプロモーター結合位置は、RNAポリメラーゼ結合付近であり、その結合アフィニティーが複数遺伝子の発現ヒエラルキーを決定していることが示された。これらの知見に加え、大腸菌ゲノム発現の包括的解析から、レスポンスレギュレーター(PhoP)が他のレスポンスレギュレーター遺伝子(rstA)発現を制御するカスケードに加え、同一プロモーター(spy)上に異なるレスポンスレギュレーターCpxRとBaeRが作用し得る独立したシス因子が存在し転写制御するネットワークを見出した。後者のネットワーク機構では、CpxRのプロモーターへの結合はspyプロモーターのRNAポリメラーゼ結合付近であったのに対して、BaeRは少し上流の2箇所に結合していた。このような結合様式はCitBレスポンスレギュレーターでも観察された。これらの結果は、大腸菌のレスポンスレギュレーターによるRNAポリメラーゼの機能変化はプロモーター付近の相互作用に加え、上流のエンハンサー様の作用によっても機能制御を受けること可能性を示唆した。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (16 results)

All 2008 2007 2006

All Journal Article (15 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Involvement of multiple transcription factors for metal-induced spy gene expression in Escherichia coli.2008

    • Author(s)
      Kaneyoshi Yamamoto
    • Journal Title

      Journal of Biotechnology 133

      Pages: 196-200

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Construction of ‘Promoter Chip' for microarray analysis of regulation targets of transcription factors.2008

    • Author(s)
      Kaneyoshi Yamamoto
    • Journal Title

      Micro- and Nano-Mechatronics and Human Science, 2007 IEEE International Symposium

      Pages: 130-132

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] グラム陽性菌とグラム陰性菌における金属応答機構2007

    • Author(s)
      山本兼由
    • Journal Title

      化学と生物 45

      Pages: 164-167

    • Related Report
      2007 Annual Research Report 2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] PdhR (pyruvate dehydrogenase complex regulator) controls the respiratory electron transport system in Escherichia coli.2007

    • Author(s)
      Hiroshi Ogasawara
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 189

      Pages: 5534-5541

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RutR is the uracil/thymine sensing master regulator of a set of genes for synthesis and degradation of pyrimidines.2007

    • Author(s)
      Tomohiro Shimada
    • Journal Title

      Molecular Microbiology 66

      Pages: 744-757

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Targeting two-component signal transduction: a novel drug discovery system.2007

    • Author(s)
      Ario Okada
    • Journal Title

      Method in Enzmology 422

      Pages: 386-395

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Journal Article] Genomic SELEX search for target promoters under the control of PhoQ P-RstBA signal relay cascade.2007

    • Author(s)
      Hiroshi Ogasawara
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 189

      Pages: 4791-4799

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A novel two-component signaling system that activates transcription of an enterohemorrhagic E. coli (EHEC) effector involved in remodeling of host actin.2007

    • Author(s)
      Nicola Reading
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 66

      Pages: 2468-2476

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Enhancement of the synthesis of RpoN, Cra and H-NS by polyamines at the level of translation in Escherichia coli cultured with glucose and glutamate.2007

    • Author(s)
      Yusuke Terui
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 66

      Pages: 2359-2368

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Multi-scale genetics of transcription network: understanding the regulatory roles of all 300 transcription factors from a single organism Escherichia coli.2007

    • Author(s)
      Akira Ishihama
    • Journal Title

      Micro- and Nano-Mechatronics and Human Science, 2007 IEEE International Symposium

      Pages: 21-27

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Enhancement of the synthesis of RpoN, Cra and H-NS by polyamines at the level of translation in Escherichia coli cultured with glucose and glutamate.2007

    • Author(s)
      Terui, Y.
    • Journal Title

      J. Bacteriol. 189(6)

      Pages: 2359-2368

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] A novel two-component signaling system that activates transcription of an enterohemorrhagic E. coli (EHEC) effector involved in remodeling of host actin.2007

    • Author(s)
      Reading, N.
    • Journal Title

      J. Bacteriol. 189(6)

      Pages: 2468-2476

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Characterization of copper-inducible promoters regulated by CpxA/CpxR in Escherichia coli.2006

    • Author(s)
      Yamamoto, K.
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 70(7)

      Pages: 1688-1695

    • NAID

      10018529229

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Enhancement of +1 frameshift by polyamines during translation of polypeptide release factor 2 in Escherichia coli.2006

    • Author(s)
      Higashi, K.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 281(14)

      Pages: 9527-9537

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] 大胆菌における金属ホメオスタシス2006

    • Author(s)
      山本兼由
    • Journal Title

      バイオサイエンスとインダストリー 64(3)

      Pages: 151-154

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Book] Microbiology Monographs Volume 6 ‘Molecular Microbiology of Heavy Metals'2007

    • Author(s)
      John L. Hobman
    • Publisher
      Springer-Verlag, Berlin
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2006-04-01   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi