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高感度かつ選択的な脱塩基損傷検出試薬の開発

Research Project

Project/Area Number 18790023
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Chemical pharmacy
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

佐藤 浩輔  Hokkaido University, 大学院・薬学研究院, 助教 (70415686)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥3,500,000 (Direct Cost: ¥3,500,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,300,000)
Fiscal Year 2006: ¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
Keywords遺伝子損傷 / 検出試薬 / 蛍光 / 核酸 / 生体分子 / 有機化学
Research Abstract

昨年度に引き続き、5-ホルミルウリジンと高い反応性をもつ新規試薬のデザインと合成を行った。その結果、フェニル基のパラ位にメトキシ基を有する化合物が、塩基性条件下極めて強い蛍光を発することが明らかとなった。一連の反応後の蛍光化合物について種々の蛍光物理定数の算出を行った結果、メトキシ誘導体のものはその蛍光量子収率が0.8以上となり、核酸誘導体として水中でも極めて強い蛍光を発する化合物を見いだすことができた。また、予期していた通り、これらの新規検出試薬はバックグラウンドとなる蛍光を示さなかった。
つぎに生体内で最も多く生成すると考えられるホルミル誘導体である、脱塩基損傷に対する選択性をまず単量体を用いて確認した。その結果、脱塩基損傷は新規試薬と速やかに反応するものの、得られた試薬との付加体は全く蛍光を示さなかった。さらに天然型のDNAに含まれるデオキシアデノシン、デオキシグアノシン、デオキシシチジン、チミジンについても同様にその反応性を比較検討した。これらの天然型核酸はいずれも新規検出試薬と反応せず、蛍光も観察されないことを明らかにした。そのため、本試薬は蛍光による検出を行うことで、5-ホルミルウリジンを選択的に検出することが可能であると考えられる。
つづいて、昨年度に合成したオリゴヌクレオチドへ5-ホルミルウリジンを導入するためのユニットを用いて1個の5-ホルミルウリジンを含む15量体のオリゴヌクレオチドを合成した。このオリゴヌクレオチドに対して、新規試薬との反応を行った結果、新規試薬は水中のオリゴヌクレオチドとも反応することがわかった。このことは実際に細胞等から得られたDNAに対して反応を行うにあたり、極めて重要な結果であると考えられる。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2008 2007

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Novel amino linkers enabling efficient labeling and convenient purification of amino-modified oligonucleotides2008

    • Author(s)
      Komatsu, Y.
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. 16

      Pages: 941-949

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Enzymatic and Chemical Synthesis of Isodeoxynucleic acid (INA) and its properties2007

    • Author(s)
      Ogino, T.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symposium Series 51

      Pages: 355-356

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 糖部修飾型人工核酸:apioNA及びそのトリリン酸体の合成2008

    • Author(s)
      片岡真由美
    • Organizer
      日本薬学会第128年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2008-03-27
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Enzymatic and Chemical Synthesis of Isodeoxynucleic acid (INA) and its properties2007

    • Author(s)
      Ogino, T.
    • Organizer
      第5回国際核酸化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学安田講堂
    • Year and Date
      2007-11-21
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2006-04-01   Modified: 2016-04-21  

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