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モデル膜貫通へリックスを用いた膜タンパク質フォールディング駆動力の計測

Research Project

Project/Area Number 18790025
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Physical pharmacy
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

矢野 義明  Kyoto University, 薬学研究科, 助教 (60402799)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥3,500,000 (Direct Cost: ¥3,500,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2006: ¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Keywords膜タンパク質 / 受容体 / 脂質 / コレステロール / 膜貫通ヘリックス
Research Abstract

(1)膜疎水部の物性がヘリックス間相互作用へ与える影響
POPC膜を基本組成として(A)cholesterolを30mo1%含む膜(B)POPEを50%含む膜中における、ヘリックス(AALALAA)3の逆平行型二量体形成の熱力学量測定に成功した。これらは脂質組成の変化によるヘリックス会合熱力学の初の測定例である。組成(A)では ΔG=-20.9kJ/mol, ΔH=-69.1kJ/mol, -TΔS=+48.3kJ/mol,組成(B)では ΔG=-17.7kJ/mol, ΔH=-61.5kJ/mol, -TΔS =+43.8kJ/mol,だった。これらの測定値を、ヘリックス-ヘリックス間、ヘリックス-脂質間、脂質-脂質間力に分けて考察した。
(2)ヘリックスの水溶性改善による水-膜間分配の測定
ホストペプチドのN末端に(RK)5配列を付加し、中心にTrpを導入したペプチド、(KR)5-AALALAAAALWLAAAALALAAC(NBD)-NH2が、水中で主としてランダムコイル構造を取ることをCDスペクトルで確認した。また、NBDやTrpの蛍光極大波長は水にさらされた環境での極大波長を示し、このペプチドが水中でモノマーとして溶解することがわかった。また、脂質ベシクル添加によりペプチドは迅速に膜へ分配し、膜貫通ヘリックスとして膜に挿入することが明らかになった。脂質濃度を変化させ滴定を行い、このヘリックスの水-膜間分配エネルギー(ΔG=-34.2kJ/mol)を得た。今後、中心の残基およびホスト配列の疎水性を変化させ、各アミノ酸の水-膜分配エネルギー測定を行う上で、有望なデザインを見いだすことが出来た。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2008 2007 Other

All Presentation (4 results) Remarks (1 results)

  • [Presentation] アミノ酸側鎖の水-膜分配測定を目指した水溶性膜貫通ヘリックスのデザイン2008

    • Author(s)
      島井 紀枝, ○矢野 義明, 松崎 勝巳
    • Organizer
      日本薬学会第128年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2008-03-28
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Effects of headgroup charge, lateral pressure, and rigidity of lipid bilayers on thermodynamics of membrane partitioning of a model transmembrane helix2008

    • Author(s)
      ○Yano Y, Ogura M, Matsuzaki K
    • Organizer
      Biophysical society 52nd annual meeting
    • Place of Presentation
      米国 Long Beach convention center
    • Year and Date
      2008-02-05
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] コレステロール含有脂質二分子膜における膜貫通ヘリックス会合の熱力学量の測定2007

    • Author(s)
      山本亜里沙, ○矢野 義明, 松崎 勝巳
    • Organizer
      日本生物物理学会第45年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-21
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 水-膜分配の測定を目指した水溶性膜貫通ヘリックスのデザイン2007

    • Author(s)
      ○島井 紀枝, 矢野 義明, 松崎 勝巳
    • Organizer
      日本生物物理学会第45年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-21
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.pharm.kyoto-u.ac.jp/yakkai/

    • Related Report
      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2006-04-01   Modified: 2016-04-21  

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