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新たな遺伝子タイピング法の開発と院内感染対策への応用

Research Project

Project/Area Number 18790372
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Laboratory medicine
Research InstitutionSapporo Medical University

Principal Investigator

古谷 大輔  Sapporo Medical University, 医学部, 研究員 (50404728)

Project Period (FY) 2006 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥2,700,000 (Direct Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,600,000 (Direct Cost: ¥1,600,000)
Keywords院内感染対策 / MRSA / PFGE法 / VNTR / AP-PCR法 / VNTR法
Research Abstract

院内感染対策として,MRSAを型別し,感染源や感染経路を把握することが重要な課題となっている。本研究では,遺伝子タイピングのgold standardであるPFGE法と,迅速な遺伝子タイピング法として汎用されているAP-PCR法に加え,複数のVNTRを同時に検出するmultiple-locus VNTR analysis(MLVA)を行い,MRSAの遺伝子タイピングにおける有用性を比較検討した。その結果,各種遺伝子タイピング法の単独での解析能を比較すると,AP-PCR法とMLVAがそれぞれ24,28パターンであったのに対し,PFGE法は36パターンと最も優れていた。しかし,PFGE法は解析に約5日間を要するため,院内感染対策上迅速性が求められる場合には,他法との組み合わせが必要と考えられた。組み合わせる数を増やすと解析能は当然高まるが,費用等を考えると実務上は2法が望ましい。そこで,AP-PCR法とMLVAの特性を総合的に比較評価したところ,AP-PCR法は再現性に乏しく結果の解釈が難しいという面で劣っていた。院内感染対策上,PFGE法と迅速遺伝子タイピング法のいずれかを組み合わせるとすると,MLVAが現段階では最適と考えられた。今回MLVAで用いた5領域7遺伝子に加え,VNTRを有するcna,coa,fnBP,pls遺伝子やsas遺伝子を併用することで,さらなる解析能の向上が期待される。また,VNTRを有する遺伝子は他の菌種においてもみられるため,バンコマイシン耐性腸球菌や多剤耐性緑膿菌なども含め,多くの菌株の解析にも応用可能と考えられた。

Report

(2 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2008 2007

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] 新たな遺伝子タイピング法の開発と院内感染対策への応用2008

    • Author(s)
      古谷 大輔
    • Journal Title

      日本臨床検査自動化学会会誌 33

      Pages: 115-120

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Light Cyierを用いたリアルタイムRT-PCR法によるノロウィルス院内検査の有用性2008

    • Author(s)
      細野 雪江
    • Organizer
      第23回日本環境感染学会総会
    • Place of Presentation
      長崎
    • Year and Date
      2008-02-22
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Light Cyclerを用いたリアルタイムRT-PCR法によるノロウイルス検出の有用性2007

    • Author(s)
      古谷 大輔
    • Organizer
      第54回日本臨床検査医学会総会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2007-11-22
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 新たな遺伝子タイピング法の開発と院内感染対策への応用2007

    • Author(s)
      古谷 大輔
    • Organizer
      第39回日本臨床検査自動化学会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-09-26
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2006-04-01   Modified: 2016-04-21  

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