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Investigation of the interaction between rhizosphere microbes and Pteris vittata by multi-omics

Research Project

Project/Area Number 18F18393
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section外国
Review Section Basic Section 64020:Environmental load reduction and remediation-related
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

井上 千弘  東北大学, 環境科学研究科, 教授 (30271878)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) HO YING-NING  東北大学, 環境科学研究科, 外国人特別研究員
Project Period (FY) 2018-11-09 – 2020-03-31
Project Status Discontinued (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2018: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Keywordsモエジマシダ / 根圏微生物 / 根抽出物 / シデロフォア / ヒ素 / ファイトレメディエーション / メタボロミクス / 内生菌 / 相互関係
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、モエジマシダをはじめとするイノモトソウ属シダの根圏土壌中からヒ素の可溶化を促進させる微生物を選抜、同定し、その微生物を接種した系でのヒ素溶出促進を確認するとともに、モエジマシダとその根圏微生物の相互関係を遺伝子レベルおよび代謝産物レベルで詳細に解析することを目的とした。
モエジマシダ等の根圏から合計77株の細菌を単離し、亜ヒ酸酸化活性、ヒ酸還元活性、シデロフォア生成能力、IAA生成能力等の評価を行い、いずれの能力も高い2株(m318株およびr507株)を得た。m318株を根圏土壌に接種したところ、モエジマシダでは最大1.5倍、イノモトソウでは最大2.3倍のヒ素溶出効果が得られた。データベースより得られた遺伝子情報から、m318株が非リボゾームペプチド遺伝子クラスタを保有しており、シデロフォアを合成する可能性があることが推定された。そこでm318株をシデロフォア産生培地で生育させたところ、951種の既知物質が同定され、IAAや抗生物質、coenzyme Q10の前駆体であるUbiquinoneなどが見出されたが、既存のシデロフォアは見出されなかった。そのため、m318株はこれまで報告されていない新規のシデロフォア(またはその類似物質)を産生している可能性が高いことが明らかになった。モエジマシダの根抽出物を解析し、培地へのヒ素添加により影響を受けたと考えられる代謝経路27種類を同定した。これまでモエジマシダの根抽出物(根の代謝産物)の解析(メタボロミクス)は行われておらず、世界初の研究成果である。以上総括すると、本研究によりモエジマシダとその根圏微生物の相互関係を遺伝子レベルおよび代謝産物レベルで解析するMulti-omicsの土台がを確立できた。今後本研究の成果をヒ素高蓄積植物と根圏微生物との相互作用の解明とその環境修復への応用に繋げたい。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2020 2019

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] A multifunctional rhizobacterial strain with wide application in different ferns facilitates arsenic phytoremediation2020

    • Author(s)
      Yang Chongyang、Ho Ying-Ning、Makita Ryota、Inoue Chihiro、Chien Mei-Fang
    • Journal Title

      Science of The Total Environment

      Volume: 712 Pages: 134504-134504

    • DOI

      10.1016/j.scitotenv.2019.134504

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] MerB3, an organomercurial lyase of Bacillus as an antidote against organomercurial poisoning.2019

    • Author(s)
      Mei-Fang Chien, Ying-Ning Ho, Hui-Tzu Lin, Kuo-Hsing Lin, Ginro Endo, Chieh-Chen Huang
    • Journal Title

      Journal of Environmental Biotechnology

      Volume: 19 Pages: 73-80

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] P- and Fe-deficiency stresses affect arsenic uptake and root exudation of Pteris vittata2019

    • Author(s)
      Chongyang Yang, Mei-Fang Chien, Yin-Ning Ho, Chihiro Inoue
    • Journal Title

      International Journal of Environmental Science and Development

      Volume: 10 Issue: 12 Pages: 430-434

    • DOI

      10.18178/ijesd.2019.10.12.1211

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification of A Novel Arsenic Resistance Transposon Nested in A Mercury Resistance Transposon of Bacillus sp. MB242019

    • Author(s)
      Mei-Fang Chien, Ying-Ning Ho, Hui-Erh Yang, Masaru Narita, Keisuke Miyauchi, Ginro Endo and Chieh-Chen Huang
    • Journal Title

      Microorganisms

      Volume: 7 Issue: 11 Pages: 566-576

    • DOI

      10.3390/microorganisms7110566

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] MerB3, an organomercurial lyase of Bacillus as an antidote against organomercurial poisoning2019

    • Author(s)
      Mei-Fang Chien, Ying-Ning Ho, Hui-Tzu Lin, Kuo-Hsing Lin, Ginro Endo, Chieh-Chen Huang
    • Journal Title

      Journal of Environmental Microbiology

      Volume: in press

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Characterization of multifunctional rhizobacteria from As hyperaccumulators and their potential in promoting As phytoremediation2019

    • Author(s)
      Chongyang Yang, Mei-Fang Chien, Ying-Ning Ho, Chihiro Inoue
    • Organizer
      ASM Microbe 2019
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Metabolomic analyses of an arsenic hyperaccumulator, Pteris vittata, and its arsenic accumulation helper, Pseudomonas vancouverensis m3182019

    • Author(s)
      Ying-Ning, Ho, Chongyang, Yang, Mei-Fang Chien, Chihiro Inoue
    • Organizer
      第13回細菌学若手コロッセウム
    • Related Report
      2019 Annual Research Report

URL: 

Published: 2018-11-12   Modified: 2024-03-26  

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