• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Cooperative recruitment of RDR6 by SGS3 and SDE5 during siRNA amplification in plants

Research Project

Project/Area Number 18H02380
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 43010:Molecular biology-related
Research InstitutionNational Agriculture and Food Research Organization

Principal Investigator

Yoshikawa Manabu  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 生物機能利用研究部門, 上級研究員 (80391564)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 西野 達哉  東京理科大学, 基礎工学部生物工学科, 准教授 (50533155)
韓 龍雲  国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 研究員 (50566297)
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥17,290,000 (Direct Cost: ¥13,300,000、Indirect Cost: ¥3,990,000)
Fiscal Year 2020: ¥5,330,000 (Direct Cost: ¥4,100,000、Indirect Cost: ¥1,230,000)
Fiscal Year 2019: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2018: ¥7,280,000 (Direct Cost: ¥5,600,000、Indirect Cost: ¥1,680,000)
KeywordssiRNA / miRNA / Argonaute / RDR6 / RISC / RNA依存性RNAポリメラーゼ / 小分子RNA / 二次的siRNA
Outline of Final Research Achievements

RNA-induced silencing complexes (RISCs) containing a siRNA and an ARGONAUTE protein play an important role in development, stress responses and virus defense. In plants, RISCs induce secondary siRNA production from their targets. In this research we investigated the molecular mechanisms of secondary siRNA production through in vitro analyses using plant extracts. Our data showed that SGS3 and SDE5 cooperatively recruit RDR6 that function in dsRNA formation.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

動物のような免疫系を持たない植物では20-25塩基の長さの小分子RNAを介したRNAサイレンシングが、ウイルス抵抗性に重要なことがわかっている。我々は、この過程について生化学的な解析を行い、小分子RNAが増幅される分子機構の一端を明らかにした。ここでの成果は作物のウイルス抵抗性の付与に役立つことが期待できる。

Report

(4 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2020 2019 2018

All Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Presentation] 植物RNAサイレンシング増幅機構に関与するSDE5の構造機能解析2020

    • Author(s)
      相澤秀、吉川学、西野達哉
    • Organizer
      BIC(BioInterConference)2020(オンライン開催)
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物RNAサイレンシング増幅機構に関与するSGS3の構造機能解析2020

    • Author(s)
      飯野菜摘、吉川学、西野達哉
    • Organizer
      BIC(BioInterConference)2020(オンライン開催)
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] In vitro recapitulation of the secondary siRNA biogenesis in plants2019

    • Author(s)
      Yuriki Sakurai , Kyungmin Baeg , Andy Y.W. Lam, Keisuke Shoji, Manabu Yoshikawa, Yukihide Tomari, Hiro-oki Iwakawa
    • Organizer
      KEYSTONE SYMPOSIA
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] シロイヌナズナ培養細胞抽出液を用いた二次的siRNA生成機構の解析2019

    • Author(s)
      吉川 学、Kyungmin Baeg、櫻井 友理希、藤井 裕史、相澤 秀、西野 達哉、泊 幸秀、岩川 弘宙、石川 雅之
    • Organizer
      日本RNA学会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物における二次的小分子RNA生成の試験管内再現2019

    • Author(s)
      櫻井 友理希、Baeg Kyungmin、Andy Y.W. Lam 、庄司佳祐、吉川 学、泊 幸秀、岩川 弘宙
    • Organizer
      日本RNA学会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナ培養細胞抽出液を用いた22塩基小分子RNA-AGO1を含むRISC複合体による二次的siRNA生成機構の解析2019

    • Author(s)
      吉川 学、Kyungmin Baeg、櫻井 友理希、藤井 裕史、相澤 秀、西野 達哉、泊 幸秀、岩川 弘宙、石川 雅之
    • Organizer
      第8回植物RNA研究ネットワークシンポジウム
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] In vitro recapitulation of the secondary siRNA biogenesis in plants2019

    • Author(s)
      Yuriki Sakurai, Kyungmin Baeg, Andy Y.W. Lam, Keisuke Shoji, Manabu Yoshikawa, Yukihide Tomari, Hiro-oki Iwakawa
    • Organizer
      第8回植物RNA研究ネットワークシンポジウム
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物RNAサイレンシング増幅機構に関与するSDE5の機能解析2019

    • Author(s)
      相澤秀、藤井裕史、吉川学、西野達哉
    • Organizer
      Bio Inter-Conference
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物における二次的小分子RNA 生成の試験管内再現2018

    • Author(s)
      Baeg Kyungmin、櫻井友理希、吉川 学、泊幸秀、岩川弘宙
    • Organizer
      第20 回日本 RNA 学会年会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物RNAサイレンシング増幅機構に関与するSDE5の機能解析2018

    • Author(s)
      藤井裕史、吉川学、西野達哉
    • Organizer
      Bio Inter Conference 2018
    • Related Report
      2018 Annual Research Report

URL: 

Published: 2018-04-23   Modified: 2022-01-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi