A technology to measure personal interactomes
| Project/Area Number |
18H02428
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 43060:System genome science-related
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
Yachie Nozomu 東京大学, 先端科学技術研究センター, 客員准教授 (60636801)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2020)
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| Budget Amount *help |
¥17,550,000 (Direct Cost: ¥13,500,000、Indirect Cost: ¥4,050,000)
Fiscal Year 2020: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2019: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2018: ¥7,410,000 (Direct Cost: ¥5,700,000、Indirect Cost: ¥1,710,000)
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| Keywords | タンパク質間相互作用 / インタラクトーム / 酵母遺伝学 / DNAバーコード / 超並列シークエンシング / 次世代シークエンシング |
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| Outline of Final Research Achievements |
Human disorders and cancers are rarely interpreted by a single gene defect but rather by a malfunction of the cellular network. The recent deep sequencing-based screening methods have enabled high-throughput identification of human protein interaction maps. Furthermore, computational studies have shown that phenotypic prediction of mutations can be improved using cellular network information. This study aimed to develop a personal interactome technology using a high-throughput interactome screening method BFG-Y2H (barcode fusion genetics-yeast two-hybrid) that we have established previously.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
ゲノム変異情報をヒトのリファレンスインタラクトームにマッピングすることで病態予測や予後予測の精度が向上することが示されている。また疾患関連変異が他のゲノム変異に比べて有意に多くのタンパク質間相互作用を阻害することも知られている。したがって、インタラクトーム情報を個人レベルで調べることが可能になればパーソナルゲノム情報に加えてより高度な細胞あるいは疾病の動態予測が可能になる。またより高速なインタラクトーム測定技術の開発は様々な生物種のゲノム情報がどのように形質として転写されるのか知る大きな手がかりともなり、本技術が医療分野および基礎生物学分野に与える影響は大きい。
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Report
(4 results)
Research Products
(35 results)
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[Journal Article] Base editors for simultaneous introduction of C-to-T and A-to-G mutations2020
Author(s)
Sakata Rina C.、Ishiguro Soh、Mori Hideto、Tanaka Mamoru、Tatsuno Kenji、Ueda Hiroki、Yamamoto Shogo、Seki Motoaki、Masuyama Nanami、Nishida Keiji、Nishimasu Hiroshi、Arakawa Kazuharu、Kondo Akihiko、Nureki Osamu、Tomita Masaru、Aburatani Hiroyuki、Yachie Nozomu
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Journal Title
Nature Biotechnology
Volume: na
Issue: 7
Pages: 865-869
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Engineered CRISPR-Cas9 nuclease with expanded targeting space2018
Author(s)
Nishimasu Hiroshi、Shi Xi、Ishiguro Soh、Gao Linyi、Hirano Seiichi、Okazaki Sae、Noda Taichi、Abudayyeh Omar O.、Gootenberg Jonathan S.、Mori Hideto、Oura Seiya、Holmes Benjamin、Tanaka Mamoru、Seki Motoaki、Hirano Hisato、Aburatani Hiroyuki、Ishitani Ryuichiro、Ikawa Masahito、Yachie Nozomu、Zhang Feng、Nureki Osamu
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Journal Title
Science
Volume: 361
Issue: 6408
Pages: 1259-1262
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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