Construction of highly accurate information space for understanding 3D structures of pancreatic tumors
| Project/Area Number |
18H03262
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 61010:Perceptual information processing-related
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| Research Institution | Nagoya Institute of Technology |
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Principal Investigator |
HONTANI Hidekata 名古屋工業大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (60282688)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
片桐 孝洋 名古屋大学, 情報基盤センター, 教授 (40345434)
Kugler Mauricio 名古屋工業大学, 工学(系)研究科(研究院), 助教 (70456713)
横田 達也 名古屋工業大学, 工学(系)研究科(研究院), 助教 (80733964)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2020)
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| Budget Amount *help |
¥17,160,000 (Direct Cost: ¥13,200,000、Indirect Cost: ¥3,960,000)
Fiscal Year 2020: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000)
Fiscal Year 2019: ¥6,890,000 (Direct Cost: ¥5,300,000、Indirect Cost: ¥1,590,000)
Fiscal Year 2018: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
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| Keywords | 医用画像処理 / MRI / 病理画像 / 非剛体位置合わせ / 病理顕微鏡画像 / 免疫染色 / 画像処理 / 画像解析 / 病理画像解析 / 染色変換 / 3次元再構成 / 膵癌 / 腫瘍 |
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| Outline of Final Research Achievements |
We developed a method that non-rigidly registers microscopic images of spatial sequence of thin sections and successfully reconstructed a 3D pathological image of pancreatic tumor of KPC mouse and this method makes it possible to visualize 3D micro structures of various organs in tumors. Reconstructing 3D pathological images, we can improve the accuracy of the registration between the pathological images and the corresponding MR image and can correspond each voxel in the MR image to a rectangular region in the pathological images. These developed methods are useful for an integrated smart system that manages medical images from variety of modalities including MR and microscope. In addition, we developed a image generative model that can generate pathological images that would correspond to a given voxel of a tumor region in the given MR image by sampling from the conditional probability distribution of the images.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
病理顕微鏡画像は癌の種別を鑑別する際などに用いられる重要なモダリティであり、近年そのデジタル化が進んでいる。病理診断を実施する病院の多くにおいて癌診断に際して撮影されるMRI画像や病理画像が診断結果とともに記録され、保存され続けている。これら保存された画像と診断の組を有効活用するためには、例えば目の前の患者と類似する画像を過去の症例から検索したり、非侵襲で撮影出来るMRI画像から侵襲的にしか撮影することの出来ない病理画像を予測したりする画像処理技術が不可欠である。本研究成果は、腫瘍内部の微細な3次元構造に基づく病理画像の検索や、MRI画像からの病理画像予測に基づく手術計画立案に有用である。
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Report
(4 results)
Research Products
(24 results)
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[Journal Article] Robust 3D image reconstruction of pancreatic cancer tumors from histopathological images with different stains and its quantitative performance evaluation.2019
Author(s)
Kugler M, Goto Y, Tamura Y, Kawamura N, Kobayashi H, Yokota T, Iwamoto C, Ohuchida K, Hashizume M, Shimizu A, Hontani H.
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Journal Title
Int J Comput Assist Radiol Surg
Volume: 14
Issue: 12
Pages: 2047-2055
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] Re-staining Pathology Images by FCNN2019
Author(s)
Fujitani Masayuki、Mochizuki Yoshihiko、Iizuka Satoshi、Simo-Serra Edgar、Kobayashi Hirokazu、Iwamoto Chika、Ohuchida Kenoki、Hashizume Makoto、Hontani Hidekata、Ishikawa Hiroshi
Organizer
2019 16th International Conference on Machine Vision Applications (MVA)
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Int'l Joint Research
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