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Creation of sugar type distribution in protein glycosylation based on protein subcellular localization

Research Project

Project/Area Number 18J02059
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Life / Health / Medical informatics
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

越中谷 賢治  国立研究開発法人産業技術総合研究所, バイオメディカル研究部門, 特別研究員(PD) (90806499)

Project Period (FY) 2018-04-25 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2018)
Budget Amount *help
¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
KeywordsGlycosylation / Protein / Sugar type / Bioinformatics / GPI modification
Outline of Annual Research Achievements

本年度は、タンパク質の細胞内局在に寄与する因子による分類と糖種の相関をもとに、タンパク質の細胞内局在性に応じた糖鎖修飾分布を明らかにした。加えて、バイオインフォマティクス解析の結果を実験的に明らかにするためにモデルタンパク質を選定し局在を人工的にコントロール可能な手法を構築した。
[A] 植物タンパク質を利用した、ヒト培養細胞内の様々なオルガネラに輸送可能な評価モデルの構築。植物由来のGPIアンカー型タンパク質CEBiPをもとに、局在性に関与するシグナル領域前後にAcGFPを導入し、最適な条件を検討した。GPI修飾に寄与するAS領域の前にGFPを導入することで、適切にオルガネラを経由し細胞膜に局在化することが本研究で示された。
> 2018年7月にチェコ・プラハで行われたThe 43rd FEBS Congressにてポスター発表行った。また、当該論文を投稿準備中である。
[B] 膜タンパク質の膜貫通領域を用いてオルガネラ膜局在の構築。小胞体やゴルジ体に局在化する膜タンパク質を対象に、モデルタンパク質を選定し膜貫通領域をAcGFPに導入し、HeLa細胞を用いてオルガネラ局在性を確認した。その結果、膜貫通領域周辺を蛍光タンパク質に導入することで、Nativeタンパク質と同様に輸送されることが確認された。この結果により、細胞内の様々なオルガネラに目的のキメラタンパク質を輸送する基盤が構築できたことが示された。
> Proceedings of the Eighteenth International Symposium on Advanced Fluid Informationに投稿した。また、2018年11月に日本・仙台で行われた15th International Conference on Flow Dynamicにて口頭発表を行った。

Research Progress Status

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Report

(1 results)
  • 2018 Annual Research Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2018

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] The Role of Signal-anchor Region of Type 2 Transmembrane Protein in Subcellular localization2018

    • Author(s)
      Kenji ETCHUYA, Tatsuki KIKEGAWA, Makoto Ohta, Yuri MUKAI
    • Journal Title

      Proceedings of the Eighteenth International Symposium on Advanced Fluid Information

      Volume: - Pages: 130-131

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] The Role of Signal-anchor Region of Type 2 Transmembrane Protein in Subcellular localization2018

    • Author(s)
      Kenji ETCHUYA, Tatsuki KIKEGAWA, Makoto Ohta, Yuri MUKAI
    • Organizer
      Fifteenth International Conference on Flow Dynamics
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Comparative analysis of GPI modification mechanisms between human and rice proteins2018

    • Author(s)
      Kenji ETCHUYA, Tatsuki KIKEGAWA, Hiromu SUGITA, Hanae KAKU, Yuri MUKAI
    • Organizer
      The 43rd FEBS Congress
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2018-05-01   Modified: 2024-03-26  

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