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真核生物の「生命の樹」-その全体像の解明

Research Project

Project/Area Number 18J02091
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Biodiversity/Systematics
Research InstitutionJapan Agency for Marine-Earth Science and Technology

Principal Investigator

白鳥 峻志  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 地球環境部門(海洋生物環境影響研究センター), 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2018-04-25 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords真核生物 / 原生生物 / 微細構造 / 分子系統解析 / 進化
Outline of Annual Research Achievements

昨年度に確立した従属栄養性鞭毛虫の培養株SRT804株について、トランスクリプトーム解析と電子顕微鏡観察を行った。75のタンパク質コード遺伝子のアミノ酸配列を用いて分子系統解析を行ったところ、SRT804株はアルベオラータに属し、シンディニアーレス科に属することが示唆された。また、SRT804株について走査型電子顕微鏡観察を行ったところ、細胞の形や鞭毛の配置がシンディニアーレス科に類似していることが確認された。シンディニアーレス科はこれまでに寄生性の生物しか報告されていないため、SRT804株は初めての自由生活性のシンディニアーレス科であり、シンディニアーレス科の生活様式の進化を推測するのに重要な生物であることが示唆された。
新奇バクテリア’Candidatus Uab amorphum’を報告した(Shiratori et al. 2019)。このバクテリアはファゴサイトーシスのように他の真正細菌や微小な真正細菌を包み込んで捕食したり、アメーバのように柔軟に変形しながら移動するなど真核生物の特徴を多く有しており、真核生物の初期進化を理解する上で重要な生物であると考えられた。
'Ca. Uab amorphum' がもつ真核生物に似た特徴の起源と進化を明らかにするために、近縁な培養株3株についてゲノム解析を行った。得られたゲノムを比較したところ、プリン、ピリミジンや多くのアミノ酸の新規合成能を欠くこと、真核生物由来の遺伝子が殆ど見られないことなど、Ca. Uab amorphumと共通する特徴が確認された。また、'Ca. Uab amorphum'で報告され、真核生物に似た運動や捕食に関わっているとされたアクチンに近縁な遺伝子は一部の培養株では見られなかった。このことから、アクチンに近縁な遺伝子はCa. Uab amorphumの運動や捕食に関わっていないことが示唆された。

Research Progress Status

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2019 2018

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 4 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Phagocytosis-like cell engulfment by a planctomycete bacterium2019

    • Author(s)
      Takashi Shiratori, Shigekatsu Suzuki, Yukako Kakizawa & Ken-ichiro Ishida
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 10 Issue: 1 Pages: 5529-5529

    • DOI

      10.1038/s41467-019-13499-2

    • NAID

      120007132846

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Taxon-rich Multigene Phylogenetic Analyses Resolve the Phylogenetic Relationship Among Deep-branching Stramenopiles2019

    • Author(s)
      Rabindra Thakur, Takashi Shiratori, Ken-ichiro Ishida
    • Journal Title

      Protist

      Volume: 170 Issue: 5 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1016/j.protis.2019.125682

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 従属栄養性クリプト藻 Goniomonas avonleaのゲノム解析から明らかになる紅藻由来の二次共生の進化2019

    • Author(s)
      白鳥峻志
    • Journal Title

      藻類

      Volume: 67 Pages: 77-80

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Journal Article] Taming chlorophylls allowed eukaryotes to prosper on the oxygenated Earth.2019

    • Author(s)
      Kashiyama Y, Yokoyama A, Shiratori T, Bachy C, Gutierrez-Rodriguez A, Not F, Hess S, Wang M, Chen M, Gong Y, Seto K, Kagami M, Hamamoto Y, Honda D, Umetani T, Shihongi A, Kayama M, Matsuda T, Taira J, Yabuki A, Tsuchiya M, Hirakawa Y, Kawaguchi A, Nomura M, Nakamura A, Namba N, Matsumoto M, Tanaka T, Yoshino T et al.
    • Journal Title

      The ISME journal

      Volume: - Issue: 8 Pages: 1-12

    • DOI

      10.1038/s41396-019-0377-0

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Phylogeny and Morphology of New Diplonemids from Japan2018

    • Author(s)
      Tashyreva Daria、Prokopchuk Galina、Yabuki Akinori、Kaur Binnypreet、Faktorova Drahomira、Votypka Jan、Kusaka Chiho、Fujikura Katsunori、Shiratori Takashi、Ishida Ken-Ichiro、Horak Ales、Lukes Julius
    • Journal Title

      PROTIST

      Volume: 169 Issue: 2 Pages: 158-179

    • DOI

      10.1016/j.protis.2018.02.001

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Phylogenomics Places Orphan Protistan Lineages in a Novel Eukaryotic Super-Group2018

    • Author(s)
      Brown Matthew W、Heiss Aaron A、Kamikawa Ryoma、Inagaki Yuji、Yabuki Akinori、Tice Alexander K、Shiratori Takashi、Ishida Ken-Ichiro、Hashimoto Tetsuo、Simpson Alastair G B、Roger Andrew J
    • Journal Title

      Genome Biology and Evolution

      Volume: 10 Issue: 2 Pages: 427-433

    • DOI

      10.1093/gbe/evy014

    • NAID

      120007134343

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Novel alkenone-producing strains of genus Isochrysis (Haptophyta) isolated from Canadian saline lakes show temperature sensitivity of alkenones and alkenoates2018

    • Author(s)
      Araie Hiroya、Nakamura Hideto、Toney Jaime L.、Haig Heather A.、Plancq Julien、Shiratori Takashi、Leavitt Peter R.、Seki Osamu、Ishida Ken-ichiro、Sawada Ken、Suzuki Iwane、Shiraiwa Yoshihiro
    • Journal Title

      Organic Geochemistry

      Volume: 121 Pages: 89-103

    • DOI

      10.1016/j.orggeochem.2018.04.008

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] A novel predatory bacterium with endocytosis-like cell engulfment2019

    • Author(s)
      Takashi Shiratori, Shigekatsu Suzuki, Yukako Kakizawa, Ken-ichiro Ishida
    • Organizer
      The 14th International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Ventrifissura属(ケルコゾア門、テコフィローサ綱)2新種の形態、微細構造及び分子系統解析2019

    • Author(s)
      白鳥峻志、矢吹 彬憲、石田 健一郎
    • Organizer
      第52回日本原生生物学会大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 捕食性バクテリアCandidatus Uab amorphumと近縁株3株のゲノム比較2019

    • Author(s)
      白鳥峻志、鈴木重勝、柿澤侑花子、浜崎大雅、石田健一郎
    • Organizer
      日本微生物生態学会第33回大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 新奇原生生物 SRT308 株が明らかにするユーグレノゾアの初期進化2019

    • Author(s)
      白鳥峻志、矢崎裕規、久米慶太郎、稲垣祐司、橋本哲男、石田健一郎
    • Organizer
      日本藻類学会第43回大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] 新奇捕食性バクテリアCandidatus "Uab amorphum" の形態及びゲノム特性について2018

    • Author(s)
      白鳥峻志、鈴木重勝、柿澤侑花子、石田健一郎
    • Organizer
      日本微生物生態学会第32回大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] A novel predatory bacterium and the early evolution of eukaryotes2018

    • Author(s)
      Takashi Shiratori, Shigekatsu Suzuki, Yukako Kakizawa, Ken-ichiro Ishida
    • Organizer
      Joint meeting of the Korean Society of Protistologists and Japan Society of Protistology
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] アメーバのはなし ―原生生物・人・感染症―2018

    • Author(s)
      永宗 喜三郎、島野 智之、矢吹 彬憲
    • Total Pages
      152
    • Publisher
      朝倉書店
    • ISBN
      9784254171686
    • Related Report
      2018 Annual Research Report

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Published: 2018-05-01   Modified: 2024-03-26  

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