門レベルで新規の極小アーキアＡＲＭＡＮの生理学的性状の解明と機能未知遺伝子の解析
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18J10039
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| Research Category |
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 国内 |
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| Research Field |
Biodiversity/Systematics
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| Research Institution | Institute of Physical and Chemical Research (2019)
Soka University (2018) |
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Principal Investigator |
酒井 博之 国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, 特別研究員(PD)
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| Project Period (FY) |
2018-04-25 – 2020-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2019)
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| Budget Amount *help |
¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
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| Keywords | ARMAN / 好熱好酸性アーキア / 陸上熱水系 / 微生物生態学 / 酸性温泉 / DPANN / Micrarchaeota / 好熱菌 / 好酸性菌 / アーキア / 極小微生物 / 共生微生物 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
最終年度である令和元年度は、(1)培養に成功したARMAN（以後ARM-1株）の宿主範囲の調査、(2)ARM-1株のゲノム解析、(3)宿主（Metallosphaera sp. AS-7株）との共培養下におけるARM-1株の遺伝子発現解析を実施した。
(1)については、8属10種の好熱好酸性アーキアについて調査した結果、ARM-1株は少なくとも3属5種の好熱好酸性アーキアを利用して増殖可能なことが明らかとなった。(2)については、ARM-1株の完全ゲノムを決定することに成功し、代謝経路の推定、全ゲノムに基づく系統解析、ゲノム比較解析等を実施した。その結果、ARM1-株は0.81Mbpのゲノムを有し（GC含量：34.1％、タンパク質コード遺伝子数：849、rRNA遺伝子数：3、tRNA遺伝子数：46）、すでに報告されている他のARMANとよく似た遺伝子セットを持つことが明らかとなった（例：解糖系、塩基・アミノ酸・ビタミンの合成経路を持たないなど）。(3)については、RNASeq法を用いて共培養下におけるARM1株および宿種Metallosphaerasp.AS7株の遺伝子発現解析を行った。その結果、好熱性ARMANおよびその宿主の遺伝子発現プロファイルの一端が初めて明らかとなった。一方、遺伝子発現解析用ライブラリー作成時に十分な量のrRNAの除去ができなかった為、今後はrRNAを十分に除去する方法を検討していく必要がある。上記の本研究成果を国際学会で1回、国内学会で2回発表した。現在、これらの研究成果をまとめた論文を執筆中である。
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| Research Progress Status |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(2 results)
Research Products
(16 results)
