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Enhanced production of aquatic plant biomass via the design of co-existing bacterial communities

Research Project

Project/Area Number 18J10181
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Design and evaluation of sustainable and environmental conscious system
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

石澤 秀紘  大阪大学, 工学研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2018-04-25 – 2020-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Keywordsウキクサ科植物 / バイオマス / ファイトレメディエーション / 根圏細菌 / 植物成長促進細菌 / ウキクサ / 遺伝子解析
Outline of Annual Research Achievements

本研究課題では、植物の成長を促進する機能を持つ細菌、PGPB(Plant Growth-Promoting Bacteria)をウキクサ科植物に定着させることで、本植物によるバイオマス生産、水質浄化の効率を高めることを目的として行った。前年度、ランダムな遺伝子破壊と次世代シーケンス解析に基づく手法により、PGPBであるAquitalea magnusonii H3がコウキクサに付着する際に重要な役割を果たす遺伝子の推定を行った。本年度は、この解析結果を統計解析や基地の遺伝子との相同性解析に供すことで生物学的な解釈を行った。

その結果、細胞外多糖の構造やIV型繊毛といった細胞外構造に加え、鞭毛運動、グルタミン代謝系、c-di-GMPシグナル伝達系といった機能に関する遺伝子がコウキクサへの付着に重要な役割を果たすことが示された。また、各種炭素源の資化や酸化的リン酸化経路に関する遺伝子にも強い関与が認められ、植物から分泌される炭素源を効率的に利用することの必要性も支持される結果となった。

また、特に重要と考えられた6種類の遺伝子について個別に破壊株を作成し、野生株との競争条件においてコウキクサへの付着量を評価した。その結果、いずれの遺伝子についても野生株より有意に付着能力に優れる/劣ることが確認され、前年度における解析結果の妥当性が示された。一方、前年度の解析においては走化性の関与は認められなかったが、H3株の持つ4つの走化性関連遺伝子クラスターを全て破壊した破壊株の挙動を調べたところ、実際には走化性も本菌株によるコウキクサへの付着に重大な関与を示すことが明らかとなった。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report
  • Research Products

    (20 results)

All 2020 2019 2018

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (16 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Enhanced biomass production and nutrient removal capacity of duckweed via two-step cultivation process with a plant growth-promoting bacterium, Acinetobacter calcoaceticus P232020

    • Author(s)
      Ishizawa Hidehiro、Ogata Yuka、Hachiya Yoshiyuki、Tokura Ko-ichiro、Kuroda Masashi、Inoue Daisuke、Toyama Tadashi、Tanaka Yasuhiro、Mori Kazuhiro、Morikawa Masaaki、Ike Michihiko
    • Journal Title

      Chemosphere

      Volume: 238 Pages: 124682-124682

    • DOI

      10.1016/j.chemosphere.2019.124682

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Performance of plant growth-promoting bacterium of duckweed under different kinds of abiotic stress factors2019

    • Author(s)
      Ishizawa Hidehiro、Tada Minami、Kuroda Masashi、Inoue Daisuke、Ike Michihiko
    • Journal Title

      Biocatalysis and Agricultural Biotechnology

      Volume: 19 Pages: 101146-101146

    • DOI

      10.1016/j.bcab.2019.101146

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Colonization and Competition Dynamics of Plant Growth-Promoting/Inhibiting Bacteria in the Phytosphere of the Duckweed Lemna minor2019

    • Author(s)
      Ishizawa Hidehiro、Kuroda Masashi、Inoue Kanako、Inoue Daisuke、Morikawa Masaaki、Ike Michihiko
    • Journal Title

      Microbial Ecology

      Volume: 77 Issue: 2 Pages: 440-450

    • DOI

      10.1007/s00248-018-1306-x

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Complete Genome Sequences of Two Plant Growth-Inhibiting Bacteria, Acinetobacter ursingii M3 and Asticcacaulis excentricus M6, Isolated from Duckweed (Lemna minor)2018

    • Author(s)
      Ishizawa Hidehiro、Kuroda Masashi、Inoue Daisuke、Ike Michihiko
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 7 Issue: 12

    • DOI

      10.1128/mra.01092-18

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 細菌の走化性がコウキクサへの定着に果たす役割2020

    • Author(s)
      石澤秀紘、黒田真史、和泉智也、井上大介、池道彦
    • Organizer
      第54回日本水環境学会年会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] ウキクサ成長促進細菌の共生化に関与する遺伝子のゲノムワイドスクリーニング2019

    • Author(s)
      石澤秀紘、黒田真史、井上大介、池道彦
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2019年度大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 水環境中における植物成長促進細菌の挙動解明と利用技術の開発2019

    • Author(s)
      石澤秀紘、黒田真史、井上大介、森川正章、池道彦
    • Organizer
      第22回日本水環境学会シンポジウム
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 様々な有機物がウキクサの成長に及ぼす影響2019

    • Author(s)
      牧田晟洋、石澤秀紘、黒田真史、井上大介、池道彦
    • Organizer
      第71回日本生物工学会大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 様々な栽培条件におけるコウキクサ分泌物成分の定性・定量解析2019

    • Author(s)
      和泉智也、石澤秀紘、黒田真史、井上大介、池道彦
    • Organizer
      日本水処理生物学会第56回大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Improvement of duckweed biomass production using plant growth-promoting bacteria under various abiotic stress factors2019

    • Author(s)
      Ishizawa, H., Tada, M., Kuroda, M., Inoue, D., Ike, M.
    • Organizer
      Water and Environment Technology (WET) Conference 2019
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Influence of various organic compounds on the biomass production of duckweed2019

    • Author(s)
      Makita, A., Ishizawa, H., Kuroda, M., Inoue, D., Morikawa, M., Ike, M.
    • Organizer
      The 12th Joint Workshop on Advanced Engineering Technology for Environment and Energy (ATEEE)
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Performance of plant growth-promoting bacterium of duckweed under different kinds of abiotic stress factors2019

    • Author(s)
      Tada, M., Ishizawa, H., Kuroda, M., Inoue, D., Ike, M.
    • Organizer
      The 12th Joint Workshop on Advanced Engineering Technology for Environment and Energy (ATEEE)
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Frond economics spectrum: correlations between duckweed morphology, physiology, and capacity2019

    • Author(s)
      Ishizawa, H., Kuroda, M., Inoue, D., Ike, M.
    • Organizer
      The 5th International ICDRA Conference Duckweed Research and Applications
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ウキクサ亜科植物の形態的特徴と成長速度および水質浄化能との相関解析2019

    • Author(s)
      石澤秀紘, 黒田真史, 井上大介, 池道彦
    • Organizer
      第53回日本水環境学会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物成長促進細菌の導入後におけるコウキクサ共生細菌群集の動態2018

    • Author(s)
      石澤秀紘, 黒田真史, 井上大介, 森川正章, 池道彦
    • Organizer
      日本水処理生物学会第55回大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] ウキクサバイオマスの増産へ向けた植物成長促進細菌と阻害細菌との競争関係の解析2018

    • Author(s)
      石澤秀紘, 黒田真史, 井上加奈子, 井上大介, 森川正章, 池道彦
    • Organizer
      第70回日本生物工学会大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] 異なるストレス条件下におけるAquitalea magnusonii H3のコウキクサ成長促進効果に関する検討2018

    • Author(s)
      多田三菜美, 石澤秀紘, 黒田真史, 井上大介, 森川正章, 池道彦
    • Organizer
      第70回日本生物工学会大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] コウキクサ共生細菌における種間競争と共存機構2018

    • Author(s)
      石澤秀紘, 黒田真史, 井上加奈子, 井上大介, 森川正章, 池道彦
    • Organizer
      日本微生物生態学会第32回大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] 様々な排水を用いたウキクサバイオマス生産ポテンシャルの評価2018

    • Author(s)
      牧田晟洋, 石澤秀紘, 黒田真史, 池道彦
    • Organizer
      環境技術学会第18回年次大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Community dynamics of duckweed-associated bacteria and its relation to host production2018

    • Author(s)
      Ishizawa, H., Kuroda, M., Inoue, D., Ike, M.
    • Organizer
      Workshop on Advanced Low-Carbon Biotechnology Core to Core Program A. Advanced Reserach Networks
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2018-05-01   Modified: 2024-03-26  

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