• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

病原菌に存在するヘム分解酵素が有する鉄獲得とは異なる新たな生理機能

Research Project

Project/Area Number 18J10820
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Bio-related chemistry
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

道順 暢彦  北海道大学, 大学院総合化学院, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2018-04-25 – 2020-03-31
Project Status Declined (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥1,500,000 (Direct Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2019: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2018: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Keywordsヘム蛋白質 / 酵素反応 / ヘム分解酵素 / ヘム / 生体分子 / 反応中間体 / 分子進化 / シアノバクテリア
Outline of Annual Research Achievements

本研究は病原菌に存在するヘム分解酵素によって生じたヘムの分解産物であるビリベルジンに注目し、その生理機能を分子進化の過程から明らかにすることを目的としている。ビリベルジンを光合成の出発原料に利用するシアノバクテリアには、機能不明のタンパク質Alr5027が存在し、これは代表的な病原菌であるコレラ菌に存在するヘム分解酵素HutZの相同体である。アミノ酸の相同性より系統樹ではAlr5027と他の細菌類を含めたHutZとで枝の分岐を示していた。さらにAlr5027とHutZの配列を比較すると、Alr5027ではヘム分解反応に必要であるArg、Aspは保存されてたものの、ヘムの結合に必要な軸配位子のHisが保存されておらず、Lys164となっていた。したがって、HutZ型ヘム分解酵素を持つ病原菌は進化の過程でAlr5027を改変することでヘム分解酵素を獲得したと考え、分子進化を通しヘム分解酵素の生理機能を検討するためAlr5027のヘムの分解機能の付加を試みた。
ヘムと結合するのかを紫外可視吸収スペクトルを用いて検討したところ、ヘムとの結合は観測されなかった。そこでLys164をHisに置換した変異体(K164H)を作成したところヘムとの結合が観測された。この変異体がヘムの分解反応を行うのかを検討するため、過酸化水素を加えヘム分解反応を観測すると、ヘム分解酵素のみで観測される反応中間体ベルドヘムの生成を確認した。Hisを挿入する位置をN末端側、C末端にそれぞれ一残基ずらしても、ヘムの結合が観測されず、ベルドヘムの生成量が著しく少なかったので、Lys164の位置にHisを置換することがAlr5027のヘム分解活性の獲得には最適であった。以上より、Lys164をHisに変異しただけでAlr5027にはヘムが結合し、ヘムの自己酸化反応であるヘム分解反応の機能を付加することに成功した。

Research Progress Status

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Report

(1 results)
  • 2018 Annual Research Report
  • Research Products

    (2 results)

All 2019

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results)

  • [Journal Article] Subunit-subunit interactions play a key role in the heme-degradation reaction of HutZ from Vibrio cholerae2019

    • Author(s)
      Uchida Takeshi、Ota Kazuki、Sekine Yukari、Dojun Nobuhiko、Ishimori Koichiro
    • Journal Title

      Dalton Transactions

      Volume: 48 Issue: 12 Pages: 3973-3983

    • DOI

      10.1039/c9dt00604d

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Role of His63 in HutZ from Vibrio cholerae in the heme degradation reaction and heme binding2019

    • Author(s)
      Uchida Takeshi、Dojun Nobuhiko、Sekine Yukari、Ishimori Koichiro
    • Journal Title

      Dalton Transactions

      Volume: 印刷中 Issue: 16 Pages: 5408-5416

    • DOI

      10.1039/c9dt00926d

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2018-05-01   Modified: 2024-03-26  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi