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セルラーゼ糖質結合モジュールとリグニン間相互作用の高分解能NMRによる解明

Research Project

Project/Area Number 18J20331
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Wood science
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

徳永 有希  京都大学, 農学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2018-04-25 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
Fiscal Year 2020: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2019: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2018: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Keywordsセルラーゼ / 糖質結合モジュール / リグニン / NMR / 相互作用解析 / 化学シフト摂動法
Outline of Annual Research Achievements

木質等のリグノセルロースに含まれるセルロースは最も豊富かつ再生可能な生物資源であり、それを構成するグルコースは化成品や燃料に変換可能である。セルロースをグルコースに分解する手法としてセルラーゼ等の多糖分解酵素を用いた酵素糖化が挙げられるが、セルラーゼがリグニンに吸着し、効率を下げることが課題となっている。このリグニン-セルラーゼ間の非生産的な吸着にはセルラーゼの糖質結合モジュール(CBM)が大きく影響することが知られている。従って、本研究では糸状菌Trichoderma reesei由来セロビオヒドロラーゼI(Cel7A)が有するCBM1(TrCBM1)に着目し、リグニン-TrCBM1間の相互作用を高分解能NMRにより明らかにすることを目的としている。
今年度は安定同位体標識したβ-O-4結合型リグニンオリゴマーモデルを合成し、TrCBM1との相互作用部位を、NMR化学シフト摂動法を用いて原子レベルで明らかにした。13Cラベル化リグニンモデルの2D 1H-13C HSQC NMRスペクトルを測定しつつ、そこにTrCBM1を添加した状態で再度HSQCスペクトルを測定し、シグナルの化学シフトの変化をもとにリグニンモデル上の吸着部位を評価した。重合度が4.16-4.70のリグニンモデルは芳香核由来のシグナルが主に摂動し、脂肪族やメトキシル基由来のシグナルは変化しなかったため、リグニンモデルが芳香核を中心にTrCBM1と相互作用していることが示された。一方で重合度が2.64-3.12の低分子画リグニンモデルでは、芳香核を含めたすべてのシグナルで明確な摂動が示されなかったため、TrCBM1との顕著な相互作用にはリグニンモデルの重合度4以上が必要であることが示された。以上の内容をBiotechnology for Biofuels誌に投稿し、論文発表を行った。本研究では2018年度にTrCBM1上のリグニンに対する吸着部位をアミノ酸残基レベルで明らかにしているため、リグニンとTrCBM1の両側から詳細な相互作用部位の解析を達成している。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2020 2019 2018 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (15 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Complete NMR assignment and analysis of molecular structural changes of β-O-4 lignin oligomer model compounds in organic media with different water content2020

    • Author(s)
      Yuki Tokunaga, Takashi Nagata, Keiko Kondo, Masato Katahira, Takashi Watanabe
    • Journal Title

      Holzforschung

      Volume: -

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] NMR elucidation of nonproductive binding sites of lignin models with carbohydrate-binding module of cellobiohydrolase I2020

    • Author(s)
      Yuki Tokunaga, Takashi Nagata, Keiko Kondo, Masato Katahira, Takashi Watanabe
    • Journal Title

      Biotechnology for Biofuels

      Volume: 13 Issue: 1

    • DOI

      10.1186/s13068-020-01805-w

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] NMR Analysis on Molecular Interaction of Lignin with Amino Acid Residues of Carbohydrate-Binding Module from Trichoderma reesei Cel7A2019

    • Author(s)
      Yuki Tokunaga, Takashi Nagata, Takashi Suetomi, Satoshi Oshiro, Keiko Kondo, Masato Katahira and Takashi Watanabe
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Issue: 1 Pages: 1977-1977

    • DOI

      10.1038/s41598-018-38410-9

    • NAID

      120006554877

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Interaction analysis between cellulase carbohydrate-binding module and lignin by ultra-high sensitivity NMR for biorefinery2020

    • Author(s)
      Takashi Watanabe, Yuki Tokunaga, Takashi Nagata, Keiko Kondo, Masato Katahira
    • Organizer
      The 11th International Symposium of Advanced Energy Science
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 有機溶媒-水系におけるβ-O-4結合型リグニンオリゴマーモデルの2次元NMRスペクトルの帰属と高次構造の解析2020

    • Author(s)
      德永有希、永田崇、近藤敬子、片平正人、渡辺隆司
    • Organizer
      第433回生存圏シンポジウム (第17回持続的生存圏創成のためのエネルギー循環シンポジウムおよび第10回先進素材開発解析システム(ADAM)シンポジウム)
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 様々な合成条件で調製した Dehydrogenation polymerの性状解析2020

    • Author(s)
      德永有希、渡辺隆司
    • Organizer
      第71回日本木材学会大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] リグニンオリゴマーモデルとセルラーゼ糖質結合モジュール間の相互作用を原子・分子レベルで可視化するためのNMR 解析2020

    • Author(s)
      徳永有希、永田崇、近藤敬子、片平正人、渡辺隆司
    • Organizer
      第70回日本木材学会大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] セルラーゼ糖質結合モジュールに対するリグニンモデル吸着部位の解析2019

    • Author(s)
      徳永有希、永田崇、近藤敬子、片平正人、渡辺隆司
    • Organizer
      第33回セルラーゼ研究会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Interaction analysis between cellulase carbohydrate-binding module and lignin by ultra-high sensitivity NMR for biorefinery2019

    • Author(s)
      Yuki Tokunaga, Satoshi Ohshiro, Hiroshi Nishimura, Takao Kishimoto, Masaharu Nakamura, Keiko Kondo, Takashi Nagata and Masato Katahira
    • Organizer
      The 10th International Symposium of Advanced Energy Science
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] NMR Analysis for Molecular Insight into the Interaction between Lignin and Carbohydrate Binding Module of Cel7A from Trichoderma reesei2019

    • Author(s)
      Yuki Tokunaga, Takashi Nagata, Keiko Kondo, Masato Katahira, Takashi Watanabe
    • Organizer
      The 20th ISWFPC (International Symposium on Wood, Fiber, and Pulping Chemistry)
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] NMR Study on Binding Sites of 13C Lignin Oligomer Models with Carbohydrate Binding Module of Cel7A from Trichoderma reesei2019

    • Author(s)
      Yuki Tokunaga, Takashi Nagata, Keiko Kondo, Masato Katahira, Takashi Watanabe
    • Organizer
      1st International Lignin Symposium Program
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 安定同位体標識リグニンオリゴマーモデルを用いたセルラーゼ糖質結合モジュールとの相互作用解析2019

    • Author(s)
      徳永有希、永田崇、近藤敬子、片平正人、渡辺隆司
    • Organizer
      第402回生存圏シンポジウム(第16回持続的生存圏創成のためのエネルギー循環シンポジウムおよび第9回先進素材開発解析システム(ADAM)合同シンポジウム)
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 13Cラベル化リグニンオリゴマーモデルを用いたセルラーゼ糖質結合モジュールとの相互作用解析2019

    • Author(s)
      德永有希、永田崇、近藤敬子、片平正人、渡辺隆司
    • Organizer
      第69回日本木材学会年次大会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Trichoderma reesei由来Cel7AのCBM1がリグニンに吸着するメカニズムの解析2018

    • Author(s)
      德永有希、永田崇、近藤敬子、片平正人、渡辺隆司
    • Organizer
      第32回セルラーゼ研究会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Interaction analysis between cellulase carbohydrate-binding module and lignin by ultra-high sensitivity NMR for biorefinery2018

    • Author(s)
      Takashi Watanabe, Yuki Tokunaga, Satoshi Ohshiro, Hiroshi Nishimura, Takao Kishimoto, Masaharu Nakamura, Keiko Kondo, Takashi Nagata and Masato Katahira
    • Organizer
      第9回エネルギー理工学研究所国際シンポジウム
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] NMR法によるリグニン-セルラーゼ糖質結合モジュール間吸着の解析2018

    • Author(s)
      德永有希、永田崇、近藤敬子、片平正人、渡辺隆司
    • Organizer
      第63回リグニン討論会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] NMR化学シフト摂動法を用いたセルラーゼ糖質結合モジュールとリグニン間相互作用の解析2018

    • Author(s)
      德永有希、永田崇、近藤敬子、片平正人、渡辺隆司
    • Organizer
      第385回生存圏シンポジウム(第15回持続的生存圏創成のためのエネルギー循環シンポジウムおよび第8回先進素材開発解析システム(ADAM)合同シンポジウム)
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] NMR analysis of Non-productive Binding of Carbohydrate Binding Module of Cellobiohydrolase with Lignin2018

    • Author(s)
      Yuki Tokunaga, Takashi Nagata, Keiko Kondo, Masato Katahira, Takashi Watanabe
    • Organizer
      The 3rd Asia Research Node Symposium on Humanosphere Science
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] セルラーゼとリグニンの相互作用をはじめて分子レベルで包括的に解明

    • URL

      http://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research/research_results/2018/190213_1.html

    • Related Report
      2018 Annual Research Report

URL: 

Published: 2018-05-01   Modified: 2024-03-26  

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