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結合タンパク質の網羅的な解析を指向したタンパク質ラベル化法の開発

Research Project

Project/Area Number 18J21621
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Bio-related chemistry
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

對馬 理彦  東京工業大学, 生命理工学院, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2018-04-25 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥2,800,000 (Direct Cost: ¥2,800,000)
Fiscal Year 2020: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2019: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywordsタンパク質ラベル化 / Ru光触媒 / 有機光触媒 / タンパク質-タンパク質相互作用 / 分子標的同定 / キナーゼ / レクチン
Outline of Annual Research Achievements

前年度までに、アフィニティービーズ上で有機光触媒のスクリーニングを行った。従来まで用いていたRu/dcbpy錯体には効率は劣るものの、Acriflavin、BODIPY、Coumarinなど蛍光プローブとして汎用される種々の分子がタンパク質ラベル化触媒となることを見出した。これらの有機光触媒は十分な細胞膜透過性を有する。このことから上記で見出した光触媒は生きた細胞内でタンパク質をラベル化できるポテンシャルを秘めている。モデル系として、HEK293FT細胞中膜上にHaloTag-TM(Transmembrane domain of PDGFR)を遺伝子工学的に強制発現させた。このHaloTagに対して前年度に見出されてきた有機光触媒を共有結合で連結し、可視光照射条件下、HaloTag-TMのラベル化を試みた。平面性かつカチオン性を有するAcriflavinを用いることで、HaloTag上で解析対象タンパク質や相互作用タンパク質を効率よくラベル化することに成功した。Acriflavine光触媒を用い、10 nm程度の直径のタンパク質含有複合体nucleosomeに対して本ラベル化法を適用した。H2BをPOIとしたラベル化を実施したところ、細胞内環境においてもacriflavineはHaloTag-POI上で近接ラベル化反応を可能にすることが明らかとなった。本法は1分間の可視光照射という迅速かつ温和な条件で、従来法よりも局所的空間でPOIおよび相互作用タンパク質をラベル化できる。そのため、本法によってH2Bの関連タンパク質やH2Bと非常に近い距離に存在するH2Aの関連タンパク質を選択的にラベル化できることが明らかとなった。本研究で開発したラベル化法は6 nmのラベル化半径もつことから細胞内微小環境における隣接したPPIを高精度に解析できる初めての手法である。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • 2018 Annual Research Report
  • Research Products

    (20 results)

All 2021 2020 2019 2018 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (5 results)

  • [Journal Article] Target Protein Identification on Photocatalyst-Functionalized Magnetic Affinity Beads2020

    • Author(s)
      對馬理彦、佐藤伸一、中根啓太、中村浩之
    • Journal Title

      Current Protocols in Protein Science

      Volume: 101 Issue: 1 Pages: 1-25

    • DOI

      10.1002/cpps.108

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Utilization of Single Electron Transfer Reaction in Protein Chemical Labeling2019

    • Author(s)
      Sato Shinichi、Tsushima Michihiko、Nakamura Hiroyuki
    • Journal Title

      Journal of Synthetic Organic Chemistry, Japan

      Volume: 77 Issue: 5 Pages: 463-471

    • DOI

      10.5059/yukigoseikyokaishi.77.463

    • NAID

      130007644985

    • ISSN
      0037-9980, 1883-6526
    • Year and Date
      2019-05-01
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Catalyst-proximity protein chemical labelling on affinity beads targeting endogenous lectins2019

    • Author(s)
      Tsushima Michihiko、Sato Shinichi、Niwa Tatsuya、Taguchi Hideki、Nakamura Hiroyuki
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 55 Issue: 88 Pages: 13275-13278

    • DOI

      10.1039/c9cc05231c

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 1-Methyl-4-aryl-urazole (MAUra) labels tyrosine in proximity to ruthenium photocatalysts2018

    • Author(s)
      Sato Shinichi、Hatano Kensuke、Tsushima Michihiko、Nakamura Hiroyuki
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 54 Issue: 46 Pages: 5871-5874

    • DOI

      10.1039/c8cc02891e

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Target-protein-selective inactivation and labelling using an oxidative catalyst2018

    • Author(s)
      Sato Shinichi、Tsushima Michihiko、Nakamura Hiroyuki
    • Journal Title

      Organic & Biomolecular Chemistry

      Volume: 16 Issue: 34 Pages: 6168-6179

    • DOI

      10.1039/c8ob01484a

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Development of photocatalyst-proximity protein labeling for profiling protein-protein interaction in intracellular microenvironment2021

    • Author(s)
      對馬理彦、佐藤伸一、中村浩之
    • Organizer
      日本化学会第101回年会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] タンパク質-タンパク質相互作用の解析を志向した細胞内触媒近接ラベル化の開発2020

    • Author(s)
      對馬理彦、佐藤伸一、中村浩之
    • Organizer
      第64回日本薬学会関東支部大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] リガンド連結型有機光触媒を用いた標的タンパク質の酸化的不活性化と抗腫瘍活性2020

    • Author(s)
      對馬理彦、Wen Yijin、津賀雄輝、金森功吏、湯浅英哉、中村浩之
    • Organizer
      LASER WEEK IN KOCHI 2020
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Ru光触媒の近傍で起こる一電子移動反応を利用した標的タンパク質のケミカルラベリング2019

    • Author(s)
      對馬理彦、佐藤伸一、中村浩之
    • Organizer
      第115回有機合成シンポジウム
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] アフィニティービーズ上での触媒近接標識のためのラベル化剤開発2019

    • Author(s)
      對馬理彦、佐藤伸一、中村浩之
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第14回年会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 標的タンパク質の部位選択的ラベル化を志向した光触媒担持ビーズ上での近接ラベル化法の開発2019

    • Author(s)
      對馬理彦、佐藤伸一、中村浩之
    • Organizer
      第9回CSJ化学フェスタ2019
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Proximity-dependent labeling on ruthenium photocatalyst- functionalized affinity beads2019

    • Author(s)
      對馬理彦、佐藤伸一、中村浩之
    • Organizer
      日本化学会第99回年会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] Ru光触媒を担持したアフィニティービーズを用いたリガンド結合タンパク質の網羅的なラベル化2018

    • Author(s)
      對馬理彦、佐藤伸一、中村浩之
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第13回年会
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] 光触媒を担持したアフィニティービーズ上におけるタンパク質ラベル化2018

    • Author(s)
      對馬理彦、佐藤伸一、中村浩之
    • Organizer
      第12回バイオ関連化学シンポジウム
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Presentation] SELECTIVE PURIFICATION AND LABELING OF LIGAND-BINDING PROTEINS ON RUTHENIUM PHOTOCATALYST FUNCTIONALIZED AFFINITY BEADS2018

    • Author(s)
      Michihiko Tsushima, Shinichi Sato, Hiroyuki Nakamura
    • Organizer
      International Chemical Biology Society 7th Annual Conference
    • Related Report
      2018 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 中村・岡田研ホームページ

    • URL

      https://syn.res.titech.ac.jp/

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Remarks] 中村・岡田研ホームページ

    • URL

      http://syn.res.titech.ac.jp/

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Remarks] T2R2 東京工業大学リサーチリポジトリ

    • URL

      http://t2r2.star.titech.ac.jp/cgi-bin/researcherpublicationlist.cgi?lv=en&q_researcher_content_number=89b5886cb7b187f310cd759c0ee2a6a0&q_year_from=2019&q_year_to=2019&tab_yf=2020

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Remarks] 中村布施研ホームページ

    • URL

      http://syn.res.titech.ac.jp/

    • Related Report
      2018 Annual Research Report
  • [Remarks] T2R2 東京工業大学リサーチリポジトリ

    • URL

      http://t2r2.star.titech.ac.jp/cgi-bin/researcherpublicationlist.cgi?q_researcher_content_number=89b5886cb7b187f310cd759c0ee2a6a0&q_year_from=2018&q_year_to=2018&tab_yf=2018

    • Related Report
      2018 Annual Research Report

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Published: 2018-05-01   Modified: 2024-03-26  

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