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豚レンサ球菌と近縁菌種の比較ゲノム解析による病原因子の探索

Research Project

Project/Area Number 18J40081
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Veterinary medical science
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

黒木(石田) 香澄  東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 特別研究員(RPD)

Project Period (FY) 2018-04-25 – 2022-03-31
Project Status Declined (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords豚レンサ球菌 / 比較ゲノム解析 / ヒアルロニダーゼ / Streptococcus suis
Outline of Annual Research Achievements

Streptococcus suisは人獣共通感染症を引き起こすが、莢膜以外に病原因子として確定しているものはない。また、分類再検討が行われる以前までは S. suis とされていた Streptococcus ruminantium は牛の心内膜炎などから分離されるが、同じくS. suisから再分類されたStreptococcus parasuisは病豚からの検出例は少ない。そこで、S. suis と病原性や毒力が異なると推測される近縁菌種と比較解析を行い S. suis の新規病原因子探索を試みた。
令和2年度は、これまで報告されていなかった S. parasuisの全ゲノム配列を明らかにし、データベ ース上に公開されている S. suis と S. ruminantium の全ゲノム配列を合わせて比較ゲノム解析を実施した。 3菌種が保有する遺伝子として8,103種類の遺伝子がみつかり、そのうち740種類は3菌種全株に共通して保存されていた。S. suisとS. ruminantiumにはアスコルビン酸代謝経路に関与する遺伝子があるのに対して、S. parasuis には保存されていなかった。一方で、ヒスチジンやトリプトファンなどのアミノ酸合成遺伝子は、S. parasuis に保存されていたが、S. suis と S. ruminantiumには保存されていなかった。また、毒力が強いS. suis 株と S. ruiminantium 2株には宿主のグリコサミノグリカンを分解するヒアルロニダーゼとヘパリナーゼを含む遺伝子群が保存されていたが、S. parasuisには保存されていなかった。これらの解析結果から、S. suis とS. ruminantiumは宿主で生存するように適応進化し、S. parasuisは環境中でも生存できるよう適応進 化したことが示唆された。

Research Progress Status

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Transition of microbiota in chicken cecal droppings from commercial broiler farms2021

    • Author(s)
      Takeshita Nachiko、Watanabe Takayasu、Ishida-Kuroki Kasumi、Sekizaki Tsutomu
    • Journal Title

      BMC Veterinary Research

      Volume: 17 Issue: 1 Pages: 10-10

    • DOI

      10.1186/s12917-020-02688-7

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Complete Genome Sequences of Two Streptococcus suis Strains Isolated from Asymptomatic Pigs2020

    • Author(s)
      Minowa-Nozawa Atsuko、Nozawa Takashi、Takamatsu Daisuke、Yoshida Akemi、Murase Kazunori、Kikuchi Taisei、Ishida-Kuroki Kasumi、Nitta Yoshihiro、Sekizaki Tsutomu、Nakagawa Ichiro
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 9 Issue: 47

    • DOI

      10.1128/mra.01142-20

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 6S rRNA gene amplicon sequence data from feces of five species of wild animals in Japan2020

    • Author(s)
      Ishida-Kuroki K, Takeshita N, Nitta Y, Chuma T, Maeda K, Shimoda H, Takano A, Sekizaki T
    • Journal Title

      Microbiol Resour Announc

      Volume: 9 Issue: 22

    • DOI

      10.1128/mra.00368-20

    • Related Report
      2020 Annual Research Report 2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 16S rRNA gene amplicon sequence data from feces of wild deer (Cervus nippon) in Japan2020

    • Author(s)
      Ishida-Kuroki K, Takeshita N, Nitta Y, Chuma T, Maeda K, Shimoda H, Takano A, Sekizaki T
    • Journal Title

      Microbiol Resour Announc

      Volume: 9 Issue: 22

    • DOI

      10.1128/mra.00346-20

    • Related Report
      2020 Annual Research Report 2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 新たな汚染指標細菌候補であるStreptococcus suisの豚肉フードチェーン内汚染状況調査2020

    • Author(s)
      黒木香澄、仁田義弘、門屋亨介、関崎勉
    • Organizer
      第93回日本細菌学会総会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 鶏肉のカンピロバクター汚染に関連する市販鶏肉表面の細菌叢についての調査2019

    • Author(s)
      吾郷良輔、竹下奈知子、黒木香澄、門屋亨介、関崎勉
    • Organizer
      第92回日本細菌学会総会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 豚肉フードチェーン内の細菌叢解析による新たな汚染指標細菌Streptococcus suisの有用性の検証2019

    • Author(s)
      黒木香澄、仁田義弘、門屋亨介、関崎勉
    • Organizer
      第51回レンサ球菌研究会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 豚肉フードチェーン内の網羅的な細菌汚染状況調査とStreptococcus suisの汚染指標細菌としての有用性の検証2019

    • Author(s)
      黒木香澄、仁田義弘、門屋亨介、関崎勉
    • Organizer
      第162回日本獣医学会学術集会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report

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Published: 2018-05-01   Modified: 2024-03-26  

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