豚レンサ球菌と近縁菌種の比較ゲノム解析による病原因子の探索
| Project/Area Number |
18J40081
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| Research Category |
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 国内 |
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| Research Field |
Veterinary medical science
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
黒木(石田) 香澄 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 特別研究員(RPD)
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| Project Period (FY) |
2018-04-25 – 2022-03-31
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| Project Status |
Declined (Fiscal Year 2021)
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| Budget Amount *help |
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
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| Keywords | 豚レンサ球菌 / 比較ゲノム解析 / ヒアルロニダーゼ / Streptococcus suis |
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| Outline of Annual Research Achievements |
Streptococcus suisは人獣共通感染症を引き起こすが、莢膜以外に病原因子として確定しているものはない。また、分類再検討が行われる以前までは S. suis とされていた Streptococcus ruminantium は牛の心内膜炎などから分離されるが、同じくS. suisから再分類されたStreptococcus parasuisは病豚からの検出例は少ない。そこで、S. suis と病原性や毒力が異なると推測される近縁菌種と比較解析を行い S. suis の新規病原因子探索を試みた。
令和２年度は、これまで報告されていなかった S. parasuisの全ゲノム配列を明らかにし、データベ ース上に公開されている S. suis と S. ruminantium の全ゲノム配列を合わせて比較ゲノム解析を実施した。 3菌種が保有する遺伝子として8,103種類の遺伝子がみつかり、そのうち740種類は3菌種全株に共通して保存されていた。S. suisとS. ruminantiumにはアスコルビン酸代謝経路に関与する遺伝子があるのに対して、S. parasuis には保存されていなかった。一方で、ヒスチジンやトリプトファンなどのアミノ酸合成遺伝子は、S. parasuis に保存されていたが、S. suis と S. ruminantiumには保存されていなかった。また、毒力が強いS. suis 株と S. ruiminantium 2株には宿主のグリコサミノグリカンを分解するヒアルロニダーゼとヘパリナーゼを含む遺伝子群が保存されていたが、S. parasuisには保存されていなかった。これらの解析結果から、S. suis とS. ruminantiumは宿主で生存するように適応進化し、S. parasuisは環境中でも生存できるよう適応進 化したことが示唆された。
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| Research Progress Status |
翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
翌年度、交付申請を辞退するため、記入しない。
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Report
(2 results)
Research Products
(8 results)
