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Bacterial foraging under turbulent mixing

Research Project

Project/Area Number 18K04843
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 27040:Biofunction and bioprocess engineering-related
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

Yawata Yutaka  筑波大学, 生命環境系, 准教授 (10586457)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords微生物生態学 / ロボティクス / マイクロ流体工学 / 運動性 / 走化性 / ビデオ顕微鏡 / 乱流 / 拡散 / 海洋細菌 / 微生物 / 炭素循環 / 海洋微生物学 / 数値モデリング / マイクロ流体デバイス / 環境微生物 / 微少環境 / 不均一性
Outline of Final Research Achievements

Turbulent mixing in the marine environment stretches millimeter-scale patches of dissolved organic matter (DOM) into tangled webs of ephemeral thin filaments, fundamentally altering nutrient landscapes for motile marine bacteria that exploit DOM by chemotaxis. Here, using a novel milli-fluidic experimental arena in which a robotic arm reproducibly stirs a patch of polypeptide into filaments with a chaotic pattern akin to turbulent mixing, we have directly visualized bacterial interaction with the temporally evolving nutrient landscape and analyzed its effect on nutrient exploitation by bacteria. By performing experiments in conditions representing a range of turbulent intensities occurring in the natural environment, we found that chemotaxis enables bacteria to exploit DOM patches even under turbulence. This study provides the first imaging-based insight for bacterial foraging under the turbulent conditions that characterize many microbial habitats.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究は、海洋など水圏において微生物が媒介する炭素化合物循環に乱流が影響を与えていることを示す証拠となる。また工 業プラントにおける適切な攪拌についても新たな知見を提供する。例として、適切な強度の乱流は遊泳微生物の餌との会合確率を高める一方で、強すぎる、あるいは弱すぎる強度の乱流はマ イナスの影響を与えることが明らかになった。また、餌(溶存態有機物)の塊が乱流によって引き延ばされる現象と、遊泳微生物が群がる様子をリアルタ イムで可視化することができるマイクロ流体ロボティクス装置は、今後の実現場・実環境における微生物動態解明の基盤となることが期待される。

Report

(5 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • 2018 Research-status Report
  • Research Products

    (23 results)

All 2021 2020 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (9 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 7 results) Remarks (4 results)

  • [Int'l Joint Research] メルボルン工科大学(オーストリア)

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  • [Int'l Joint Research] メルボルン工科大学(オーストラリア)

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  • [Presentation] 日本微生物生態学会奨励賞 受賞講演 「様々な時間軸と微生物の行動生態」2021

    • Author(s)
      八幡 穣
    • Organizer
      日本微生物生態学会奨励賞
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    • Invited
  • [Presentation] 微生物の行動生態学 とライブ可視化技術2021

    • Author(s)
      八幡 穣
    • Organizer
      新学術領域研究「超地球生命体を解き明かすポストコッホ機能生態学」第1回公開シンポジウム
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  • [Presentation] 海洋細菌の遊泳持久力の実測とその多様性の解明2021

    • Author(s)
      原克樹、Zhang Yiyun, 平山智宏、高部響介、八幡穣
    • Organizer
      日本微生物生態学会第34回大会
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  • [Presentation] 微生物の行動生態学 とライブ可視化技術2020

    • Author(s)
      八幡 穣
    • Organizer
      新学術領域研究 超地球生命体を解き明かすポストコッホ機能生態学 第1回 公開シンポジウム
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  • [Presentation] 微生物の行動生態学 とライブ可視化技術2020

    • Author(s)
      八幡 穣
    • Organizer
      マリンバイオテクノロジー学会 若手の会 「秋のシンポジウム」
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  • [Presentation] Single-Cell Innate Fluorescence Analysis by Confocal Microspectroscopy2019

    • Author(s)
      Yutaka Yawata
    • Organizer
      TSB2019
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  • [Presentation] Single-Cell Innate Fluorescence Analysis by Confocal Microspectroscopy2019

    • Author(s)
      Yutaka Yawata
    • Organizer
      日本顕微鏡学会第62回シンポジウム
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  • [Presentation] CRIF: 一細胞自家蛍光解析の新展開2019

    • Author(s)
      八幡 穣
    • Organizer
      微生物ウィーク2019
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    • Invited
  • [Presentation] マイクロ流体テクノロジー、ロボティクス、低侵襲細胞イメージング評価技術の融合2019

    • Author(s)
      八幡 穣
    • Organizer
      日本農芸化学会大会
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  • [Presentation] マイクロ流体テクノロジー、ロボティクス、非破壊細胞分析の統合:1細胞解像度のライブ生態学に向けて2018

    • Author(s)
      八幡穣
    • Organizer
      環境微生物系学会合同大会2018
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  • [Remarks] 八幡研究室

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  • [Remarks] 八幡穣研究室

    • URL

      https://yawatalab.jp

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  • [Remarks] 八幡穣研究室オフィシャルサイト

    • URL

      https://yyawata.wordpress.com

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  • [Remarks] 筑波大学HP

    • URL

      https://www.tsukuba.ac.jp/notes/119/index.html

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Published: 2018-04-23   Modified: 2023-01-30  

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