• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Effects of lipid envionment on the functions of sarcoplasmic reticulum calcium pump

Research Project

Project/Area Number 18K06105
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 43030:Functional biochemistry-related
Research InstitutionAsahikawa Medical College

Principal Investigator

Kazzuo Yamasaki  旭川医科大学, 医学部, 講師 (60241428)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Keywordsカルシウムポンプ / イオン輸送 / ナノディスク / 静電相互作用 / リン脂質 / 膜タンパク質 / タンパク質ー脂質相互作用 / 部位特異的変異 / タンパク質-脂質相互作用 / タンパク質-脂質間相互作用 / 静電的相互作用 / タンパクー脂質間相互作用 / 表面電荷 / 生体エネルギー変換 / タンパク質-脂質連関
Outline of Final Research Achievements

Sarcoplasmic reticulum Ca pump was used to investigate the effect of transient protein-lipid interactions on the function of membrane proteins. The results show that the interaction between Arg324 and the phosphate group of the phospholipid, which wasobserved in the crystal structure, plays an important role in determining the affinity for lumenal Ca in the calcium release process of the calcium pump. It was also found that Arg324 changes partners with multiple types of lipids during the reaction cycle. It was concluded that in order to fully understand the function of the calcium pump under physiological conditions, it is essential to examine its behavior in a complex lipid environment rather than a single lipid environment.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

膜タンパク質は生命機能について知る上で、非常に重要なターゲットであるが、タンパク質と脂質両方の要因が絡むため問題が非常に複雑で取り扱いが難しい。今回の研究ではナノディスクにカルシウムポンプを組み込んだ標品を用いることにより、様々な脂質環境での酵素機能測定が容易となった。また結晶構造を基にターゲットとなるアミノ酸残基を絞り込むことができたため、部位特異的変異と組み合わせて焦点を絞った研究を行うことができた。得られた結果は、酵素反応サイクル中に特定のアミノ酸残基が相互作用する脂質の種類を変えるという予想していないものであり、脂質組成の重要性を浮き彫りにする意義深いものであった。

Report

(5 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • 2018 Research-status Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2021 2020 2019 2018

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (10 results)

  • [Journal Article] Angle change of the A-domain in a single SERCA1a molecule detected by defocused orientation imaging2021

    • Author(s)
      Katoh Takanobu A.、Daiho Takashi、Yamasaki Kazuo、Danko Stefania、Fujimura Shoko、Suzuki Hiroshi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 11 Issue: 1 Pages: 13672-13672

    • DOI

      10.1038/s41598-021-92986-3

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 筋小胞体カルシウムポンプの多機能側鎖Arg324と多種のリン脂質のアンサンブル2021

    • Author(s)
      山崎和生、 大保貴嗣、 Danko Stefania、安田 哲、川辺 淳一、 鈴木裕
    • Organizer
      第94回 日本生化学会大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 筋小胞体カルシウムポンプの多機能性残基 Arg324 と脂質との相互作用の多様性について2021

    • Author(s)
      山崎和生、 大保貴嗣、 Danko Stefania、安田 哲、川辺 淳一、 鈴木裕
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会第47回討論会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 筋小胞体カルシウムポンプの結晶構造中に見られたArg324とリン脂質間のリンクが果たす役割について2020

    • Author(s)
      山崎 和生、大保 貴嗣、安田 哲、Stefaina Danko、川辺 淳一、鈴木 裕
    • Organizer
      第92回日本生化学会大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 筋小胞体カルシウムポンプの結晶構造中に見られた Arg324とリン脂質間のリンクが果たす役割について2020

    • Author(s)
      山崎 和生、大保 貴嗣、安田 哲、Stefania Danko、川辺 淳一、鈴木 裕
    • Organizer
      第46回日本生体エネルギー研究会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 筋小胞体カルシウムポンプTyr122-疎水性クラスター変異体の古典的物理化学公式を用いた解析-酵素反応における疎水性結合の寄与の定量化の試み―2019

    • Author(s)
      山崎和生、山崎誠一郎、市村佑人、大保貴嗣、Stefania Danko、安田哲、鈴木裕
    • Organizer
      第45回日本生体エネルギー研究会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 筋小胞体カルシウムポンプのTyr122クラスター変異体で観測された異常に遅いEP分解2019

    • Author(s)
      山崎和生、市村佑人、山崎誠一郎、大保貴嗣、Stefania Danko、安田哲、鈴木裕
    • Organizer
      第92回日本生化学会大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 筋小胞体Ca2+-ATPaseの脱共役モードについて2018

    • Author(s)
      山崎 和生, 大保 貴嗣, Stefania Danko, 安田 哲, 鈴木 裕
    • Organizer
      第91回日本生化学会大会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] 筋小胞体Ca2+-ATPaseの脱共役モードについて2018

    • Author(s)
      山崎 和生, 大保 貴嗣, Stefania Danko, 安田 哲, 鈴木 裕
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会 第44回討論会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] ナノディスク中の筋小胞体Ca2+-ATPaseに標識された単一分子の角度と明滅による中間体構造の評価2018

    • Author(s)
      竹村 勁哉、小島 知樹、山崎 和生、大保 貴嗣、Stefania Danko、鈴木 裕、政池 知子
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会 第44回討論会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] デフォーカスイメージング法の確度評価とSERCA1aの構造変化検出に向けた試み2018

    • Author(s)
      加藤 孝信、藤村 章子、山崎 和生、大保 貴嗣、Danko Stefania、鈴木 裕、 西坂 崇之
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会 第44回討論会
    • Related Report
      2018 Research-status Report

URL: 

Published: 2018-04-23   Modified: 2023-01-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi