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Identification of novel enzymes for C-mannosylation and analysis of its substrate proteins

Research Project

Project/Area Number 18K06137
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 43030:Functional biochemistry-related
Research InstitutionKeio University

Principal Investigator

Simizu Siro  慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 教授 (30312268)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
KeywordsC型糖修飾 / R-spondin2 / MFAP4 / ADAMTS4 / Isthmin-1 / 細胞外分泌 / フィブリノーゲンC末端領域 / がん分子標的
Outline of Final Research Achievements

The objective of the research is to identify the enzyme responsible for C-mannosylation and to search for new substrate proteins. During the period, we were able to develop a simple method for detecting C-mannosylation to identify the responsible enzyme(s). Furthermore, we identified R-spondin2, MFAP4, ADAMTS4 and Isthmin-1 as novel C-mannosylated proteins. Functional analysis of each substrate protein was also performed, and it was demonstrated that C-mannosylation plays an important role in various protein functions.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ポストゲノム時代においてタンパク質の性質を理解することは重要である。特にヒトタンパク質は多くの翻訳後修飾を受けることで活性が制御されているため解析が困難である。本研究課題では、翻訳後修飾の中でも最も解析が遅れていた糖修飾に着目したものである。中でもC型糖修飾は報告されている基質タンパク質の数が少なく未解明な点が多いが、本研究により新たに4つの基質タンパク質を同定することができた。この中のいくつかは疾病に関連するものもあるため、当該研究分野に多大な貢献をすることができた。

Report

(4 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Research-status Report
  • 2018 Research-status Report
  • Research Products

    (61 results)

All 2021 2020 2019 2018 Other

All Journal Article (15 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 15 results,  Open Access: 4 results) Presentation (43 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results,  Invited: 5 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Seven‐Step Synthesis of All‐Nitrogenated Sugar Derivatives Using Sequential Overman Rearrangements2021

    • Author(s)
      Okuyama Yuya、Kidena Mayu、Kato Erina、Kawano Sayaka、Ishii Koki、Maie Kenta、Miura Kazuki、Simizu Siro、Sato Takaaki、Chida Noritaka
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 60 Issue: 10 Pages: 5193-5198

    • DOI

      10.1002/anie.202015141

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      Miura K、Suzuki T、Sun H、Takada H、Ishizawa Y、Mizuta H、Dohmae N、Simizu S
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects

      Volume: 1865 Issue: 3 Pages: 129833-129833

    • DOI

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    • Author(s)
      Yoshimoto S、Katayama K、Suzuki T、Dohmae N、Simizu S
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects

      Volume: 1865 Issue: 3 Pages: 129840-129840

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2020.129840

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    • Author(s)
      Miura Kazuki、Kawano Sayaka、Suto Takahiro、Sato Takaaki、Chida Noritaka、Simizu Siro
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      Volume: 34 Pages: 116041-116041

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2021.116041

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    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 1261-1261

    • DOI

      10.1038/s41467-021-21396-w

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      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects

      Volume: 1864 Issue: 9 Pages: 129637-129637

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      Volume: 28 Issue: 2 Pages: 115253-115253

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      Takao Ken-ichi、Ogura Akihiro、Yoshida Keisuke、Simizu Siro
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      Synlett

      Volume: 31 Issue: 05 Pages: 421-433

    • DOI

      10.1055/s-0039-1691580

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      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      Volume: 27 Issue: 15 Pages: 3334-3338

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2019.06.014

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      Ishizawa Yudai、Niwa Yuki、Suzuki Takehiro、Kawahara Ryota、Dohmae Naoshi、Simizu Siro
    • Journal Title

      Glycobiology

      Volume: 29 Issue: 10 Pages: 696-704

    • DOI

      10.1093/glycob/cwz052

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      Suto, T., Yanagita, Y., Nagashima, Y., Takikawa, S., Kurosu, Y., Matsuo, N., Miura, K., Simizu, S., Sato, T. & Chida, N.
    • Journal Title

      Bulletin of the Chemical Society of Japan

      Volume: 92 Pages: 545-571

    • NAID

      130007611672

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      Mizuta, H., Kuga, K., Suzuki, T., Niwa, Y., Dohmae, N. & Simizu, S.
    • Journal Title

      International Journal of Oncology

      Volume: - Pages: 2127-2138

    • DOI

      10.3892/ijo.2019.4767

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      Kawahara, R., Niwa, Y. & Simizu, S.
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      Cancer Science

      Volume: 109 Issue: 8 Pages: 2490-2496

    • DOI

      10.1111/cas.13693

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      Volume: 30

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      130007521336

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  • [Presentation] トポロジー解析によるDPY19L1活性中心の探索2018

    • Author(s)
      横山 典弘、柳原 凌太郎、小松 良亮、三浦 一輝、丹羽 祐貴、清水 史郎
    • Organizer
      第37回日本糖質学会年会
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  • [Presentation] C-mannosylation-基質と酵素の探索2018

    • Author(s)
      清水 史郎
    • Organizer
      日本農芸化学会中部支部 第183回例会
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    • Invited
  • [Presentation] C-mannosylation of R-spondin2 as a potential cancer biomarker2018

    • Author(s)
      水田 隼斗、丹羽 祐貴、清水 史郎
    • Organizer
      第77回日本癌学会学術総会
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  • [Presentation] R-spondin1 におけるリン酸化の機能解析2018

    • Author(s)
      西谷 拓海, 鈴木 健裕, 丹羽 祐貴, 三浦 一輝, 堂前 直, 清水 史郎
    • Organizer
      日本農芸化学会関東支部会2018年度大会
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  • [Presentation] トポロジー解析によるDPY19L1のC-mannosyltransferase活性中心の探索2018

    • Author(s)
      横山 典弘, 柳原 凌太郎, 三浦 一輝, 丹羽 祐貴, 清水 史郎
    • Organizer
      日本農芸化学会関東支部会2018年度大会
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  • [Presentation] ヒトC型糖転移酵素DPY19L3のプロモーター解析2018

    • Author(s)
      吉本 哲、三浦 一輝、清水 史郎
    • Organizer
      日本農芸化学会関東支部会2018年度大会
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  • [Presentation] Vibsanin A誘導体の生物活性評価および標的分子の同定2018

    • Author(s)
      三浦 一輝、松木 渉、高尾 賢一、清水 史郎
    • Organizer
      日本農芸化学会関東支部会2018年度大会
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  • [Remarks] 慶應義塾大学 理工学部 応用化学科 生物化学研究室

    • URL

      https://www.applc.keio.ac.jp/~simizu/

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  • [Remarks] 慶應義塾大学 理工学部 応用化学科 生物化学研究室

    • URL

      https://www.applc.keio.ac.jp/~simizu/index.html

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  • [Remarks] 慶應義塾大学 理工学部 応用化学科 生物化学研究室

    • URL

      http://www.applc.keio.ac.jp/~simizu/

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Published: 2018-04-23   Modified: 2022-01-27  

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