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Epigenetic control of plant genome and gene expression by transposons

Research Project

Project/Area Number 18K06301
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 44030:Plant molecular biology and physiology-related
Research InstitutionNational Institute for Basic Biology

Principal Investigator

Atsushi Hoshino  基礎生物学研究所, 多様性生物学研究室, 助教 (80312205)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywordsエピジェネティクス / トランスポゾン / アサガオ / DNAメチル化 / ヒストン / 花
Outline of Final Research Achievements

Using the duskish mutant of Japanese morning glory as a model, transposon-induced epigenetic variation and its impact on gene expression were studied. The results outlined the relationship between DNA methylation and histone modifications of a transposon and suppression of the genes for transposition. By decoding the whole genome sequence of the duskish mutant, novel autonomous transposons were identified. Analysis of their transcripts also revealed the structure of the genes for transposition.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

生物の多様性の獲得と進化に、エピジェネティックな変異が突然変異と同様に寄与するとされている。刷毛目絞はエピジェネティックな変異が生じて次世代に伝達するため、多様性の獲得の過程を観察していると言える。そのため本研究の成果は、エピジェネティクスの理解だけでなく、生物が多様性獲得する機構の一端に迫るものとしても意義がある。

Report

(5 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • 2018 Research-status Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2022 2021 2019 Other

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Effectiveness of Create ML in microscopy image classifications: a simple and inexpensive deep learning pipeline for non-data scientists2021

    • Author(s)
      Nagaki Kiyotaka、Furuta Tomoyuki、Yamaji Naoki、Kuniyoshi Daichi、Ishihara Megumi、Kishima Yuji、Murata Minoru、Hoshino Atsushi、Takatsuka Hirotomo
    • Journal Title

      Chromosome Research

      Volume: 29 Issue: 3-4 Pages: 361-371

    • DOI

      10.1007/s10577-021-09676-z

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] アサガオ:ゲノム情報でキラリと光りはじめた日本独自のバイオリソース2022

    • Author(s)
      星野敦、白澤健太、仁田坂英二
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] アサガオの花弁周縁部に特異的な三重化した遺伝子のRNAサイレンシング2022

    • Author(s)
      中川颯也、朴慶一、森田裕将、飯田滋、星野敦
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] アサガオの主要な変異原Tpnトランスポゾンの転移及び転移抑制機構2021

    • Author(s)
      水成友紀、白澤健太、星野敦、仁田坂英二
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] リシーケンスによるアサガオ100系統の多型と遺伝子変異の解析2021

    • Author(s)
      星野敦、白澤健太、仁田坂英二
    • Organizer
      日本遺伝学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] アサガオにおける安定化自律性因子が制御するTpnトランスポゾンの転移2021

    • Author(s)
      水成友紀、白澤健太、星野敦、仁田坂英二
    • Organizer
      日本遺伝学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] アサガオのエピジェネティクスによる模様形成と経世代伝達2019

    • Author(s)
      星野敦
    • Organizer
      日本進化学会第21回大会(シンポジウム・模様研究のあした ~形成機構や機能~)
    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] アサガオの刷毛目絞を司るエピジェネティックな遺伝子発現御2019

    • Author(s)
      星野敦, 森田裕将, 長岐清孝
    • Organizer
      第60回日本植物生理学会年会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] アサガオの刷毛目絞とエピゲノム解析2019

    • Author(s)
      星野敦, 森田裕将, 長岐清孝
    • Organizer
      第10回アサガオ研究集会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Remarks] 基礎生物学研究所多様性生物学研究室

    • URL

      https://www.nibb.ac.jp/hoshino/

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      2020 Research-status Report
  • [Remarks] Japanese Morning Glory Genome Database

    • URL

      https://ipomoeanil.nibb.ac.jp/

    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Remarks] 基礎生物学研究所多様性生物学研究室

    • URL

      http://www.nibb.ac.jp/hoshino/

    • Related Report
      2019 Research-status Report 2018 Research-status Report

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Published: 2018-04-23   Modified: 2023-01-30  

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