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How many birds are there which originated from Japan but widespread to the continent?

Research Project

Project/Area Number 18K06399
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 45030:Biodiversity and systematics-related
Research InstitutionNational Museum of Nature and Science, Tokyo

Principal Investigator

Nishiumi Isao  独立行政法人国立科学博物館, 動物研究部, 研究主幹 (90290866)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywords生物多様性 / 種多様性 / 種分化 / 種の起源地 / DNAバーコード / 鳥類 / 大陸島 / 日本列島 / 起源地 / ソース集団 / 遺伝的多様性 / 分子系統 / 系統地理 / DNAバーコード
Outline of Final Research Achievements

We have sequenced the DNA barcode regions of 1,778 samples from 245 Japanese breeding species of birds and registered them in database of the BOLD Systems. We analyzed the latest data and re-estimated the species of Japanese origin by comparing the phylogeny among closely related species or the intraspecific genetic diversity between the continent and Japan. As a result, the number of species suggested to be of Japanese origin increased by 8 to 48. Conversely, the number of species suggested to be of continental origin increased to 52, and the number of species with no difference in phylogenetic relationships or genetic diversity between the Japanese and continental populations increased to 48. Therefore, although we increased the number of species analyzed, it did not change our assessment that one-third to half of the Japanese species co-distributed in continent may have originated in Japan.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

「ガラパゴス化」という言葉が象徴するように、島での生物進化はその島以外では生きていけないような特殊な種を生み出すと一般には理解されている。ガラパゴス諸島のような海洋島では、それは確かにあてはまるが、日本列島のように地史的に大陸ともつながったことのある大陸島では必ずしもあてはまらない。現在では広く分布している鳥類種の中には日本列島で種分化し、日本列島を起源として大陸にまで分布を拡大した種も少なからずいることがDNAバーコードの分析の結果として示された。日本列島はアジア大陸の鳥の種多様性の起源地として重要な役割を果たしてきたことが示唆された。生物多様性の進化学的理解を進めたといえる。

Report

(4 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Research-status Report
  • 2018 Research-status Report
  • Research Products

    (25 results)

All 2021 2020 2019 2018

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (15 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 2 results) Book (3 results)

  • [Journal Article] Great journey of Great Tits (Parus major group): Origin, diversification and historical demographics of a broadly distributed bird lineage2020

    • Author(s)
      Song, G., R. Zhang, F. Machado-Stredel, P. Alstrom, U. S. Johansson, M. Irestedt, H. L. Mays JR., B. D. McKay, I. Nishiumi, Y. Cheng & Y. Qu
    • Journal Title

      Journal of Biogeography

      Volume: 47 Issue: 7 Pages: 1585-1598

    • DOI

      10.1111/jbi.13863

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      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Cryptic speciation of the Oriental Greenfinch Chloris sinica on oceanic islands2020

    • Author(s)
      Saitoh, T., K. Kawakami, Y. A. Red'kin, I. Nishiumi, C. H. Kim & A. P. Kryukov
    • Journal Title

      Zoological Science

      Volume: 37 Issue: 3 Pages: 1-15

    • DOI

      10.2108/zs190111

    • NAID

      40022252848

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Breeding Status and Sex Ratio of Ancient Murrelets Captured in the Nocturnal At-sea Congregation off Teuri Island, Japan2020

    • Author(s)
      Matsui Shin、Whitworth Darrell、Sugita Norimasa、Nishiumi Isao
    • Journal Title

      ORNITHOLOGICAL SCIENCE

      Volume: 19 Issue: 2 Pages: 203-209

    • DOI

      10.2326/osj.19.203

    • NAID

      130007881636

    • ISSN
      1347-0558
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    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] ライチョウの保全遺伝学2020

    • Author(s)
      西海 功
    • Journal Title

      生物の科学 遺伝

      Volume: 74 Pages: 166-169

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    • Author(s)
      濱尾章二・西海功
    • Journal Title

      自然教育園報告

      Volume: 51 Pages: 7-12

    • NAID

      40022168284

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      西海 功
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      Volume: 40 Pages: 139-141

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      Mochizuki, M. & I. Nishiumi
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      VII North American Ornithological Conference, Puerto Rico
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    • Invited
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      森さやか・泉洋江・千葉悟・西海功・水田拓
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      日本鳥学会2019年度大会
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  • [Presentation] 小笠原諸島-伊豆諸島 ツバメの渡り調査2019:DNA に地域差はあるか?2019

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      重原美智子・西海功・川上和人
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      日本鳥学会2019年度大会
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    • Author(s)
      小島みずき・西海功
    • Organizer
      日本鳥学会2019年度大会
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  • [Presentation] 自由集会:みんなで作ろう!目録8 版2019

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      西海功・金井裕・山崎剛史・小田谷嘉弥・亀谷辰朗・齋藤武馬・平岡考・池長裕史・板谷浩男・大西敏一・梶田学・先崎理之・高木慎介
    • Organizer
      日本鳥学会2019年度大会
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  • [Presentation] キジバトの2 タイプのmtDNA と核DNAの比較2019

    • Author(s)
      小島みずき・西海功
    • Organizer
      第66回日本生態会大会
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  • [Presentation] DNAバーコードでわかったミャンマーで越冬する日本の小鳥2018

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      西海功・四方田紀恵・Win Win Nwe
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  • [Presentation] Two species of Japanese migrant birds wintering in Myanmar suggested by DNA barcoding2018

    • Author(s)
      Nishiumi, I., N. Yomoda and W. Win Nwe
    • Organizer
      International Symposium ‘Updating of Flora and Fauna of Myanmar’
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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] DNAからみる鳥の系統進化と分類2018

    • Author(s)
      西海 功
    • Organizer
      野学校第25回
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  • [Book] Birds. (ed.) Tanaka, N. A Guide to Flora and Fauna in Southern Myanmar.2021

    • Author(s)
      Nishiumi, I.
    • Publisher
      National Museum of Nature and Science, Tokyo
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  • [Book] 遺伝子解析により解明されたライチョウの系統分化.楠田哲士編,神の鳥ライチョウの生態と保全―日本の宝を未来へつなぐ.2020

    • Author(s)
      西海功
    • Publisher
      緑書房
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  • [Book] 動物学の百科事典2018

    • Author(s)
      西海 功ほか(分担執筆)
    • Total Pages
      770
    • Publisher
      丸善出版
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      2018 Research-status Report

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Published: 2018-04-23   Modified: 2022-01-27  

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