Carcinogenesis and therapeutic targetability analysis of fusion genes identified by next-generation sequencing of asbestos-related malignant mesothelioma
| Project/Area Number |
18K10046
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 58020:Hygiene and public health-related: including laboratory approach
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| Research Institution | Kyushu Institute of Technology |
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Principal Investigator |
嘉数 直樹 九州工業大学, 学生支援本部, 特任教授 (20264757)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2020: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
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| Keywords | 悪性中皮腫 / 悪性中脾腫 / 融合遺伝子 / 次世代シークエンス |
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| Outline of Annual Research Achievements |
近年、悪性中皮腫において発癌に関与していると考えられる融合遺伝子が続々と同定されている。それに伴い、同定された複数の融合遺伝子において片方の遺伝子が同じであるような場合がいくつも見つかり、グループを形成できることも明らかになってきた。現時点では、NF2融合群（11融合遺伝子）、ALK融合群（5融合遺伝子）、BAP1融合群（5融合遺伝子）、PBRM1融合群（5融合遺伝子）、SETD2融合群（4融合遺伝子）、EWSR1融合群（3融合遺伝子）、PTEN融合群（2融合遺伝子）にグループ分けできることを明らかにした。我々がRNA-seq解析した悪性中皮腫細胞株の1つにおいては、先に報告したALK群の2融合遺伝子（ALK-SDC1、ALK-RAB3B）以外にいずれかの融合群に含まれる融合遺伝子がないか探索したところ、SETD2融合群に含まれる1融合遺伝子（SETD2-PCDH15）が見出され、同じ融合群に含まれる他の融合遺伝子（SETD2-NBEAL2、SETD2-PHF7、SETD2-SPATA12、SETD2-CCDC12）と同じく悪性中皮腫の発癌に関与していると考えられた。
一方、我々が解析した悪性中皮腫細胞株で同定され有力な発癌ドライバーと考えられた融合遺伝子DUS4L-BCAP29は、その後に非癌性の上皮細胞株や線維芽細胞株でも癌細胞株と同程度に発現していることが明らかになった。DUS4LとBCAP29はゲノム上で隣接しており、read-throughによるcis-splicingによって融合転写産物が形成されたものと推測される。他の融合遺伝子についても、その転写産物がread-through転写によって生じた可能性がある場合は、発癌との関連性について慎重に検討する必要があると考えられた。
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Report
(6 results)
Research Products
(2 results)
