• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Integrated implementation of human computation and computational drug discovery

Research Project

Project/Area Number 18K11523
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Yamamoto Kazuki  東京大学, アイソトープ総合センター, 特任助教 (90758301)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大上 雅史  東京工業大学, 情報理工学院, 助教 (50743209)
森脇 由隆  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 助教 (70751303)
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywordsケムインフォマティクス / ソーシャルネットワーキングサービス / 分子構造 / 可視化 / 化合物空間 / オープンサイエンス / シチズンサイエンス / 創薬知 / 創薬計算科学 / バーチャルスクリーニング / ヒューマンコンピュテーション / ドラッグデザイン
Outline of Final Research Achievements

We implemented the integration between chemistry software tools and social media on our own portal site chemical.space, and offered it to the public. We have been operating several bots interfacing these functions on social media to promote the service as an online drug discovery knowledge sharing platform. The service will continue to be maintained by the principal investigator at his own expense, and useful tools will be added as needed, both domestically and internationally.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

機械的な探索だけでは効率的に網羅し難い創薬探索空間を,人智を活用したヒューマンコンピュテーション(HC)技術と計算創薬との融合的実装によって開拓することを目的として,新規化合物構造を人智から創出・収集し,幅広く蓄積・シェアできるオンライン創薬知プラットフォームを実装した.これにより,現在の計算創薬の限界の打破に向けての端緒的基盤を提供した.

Report

(4 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Research-status Report
  • 2018 Research-status Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2021 2020 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Open Access: 2 results,  Peer Reviewed: 1 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (6 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Toronto(カナダ)

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Journal Article] Twitter Integration of Chemistry Software Tools2021

    • Author(s)
      Yoshikawa Naruki、Kubo Ryuichi、Yamamoto Kazuki
    • Journal Title

      ChemRxiv (査読誌投稿中)

      Volume: -

    • DOI

      10.26434/chemrxiv.14394302.v1

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] ソーシャル創薬プロジェクト ─人智(創薬知)と計算(IT創薬)の融合,創薬エコシステムの社会実装を目指して─2018

    • Author(s)
      山本一樹
    • Journal Title

      デジタルプラクティス

      Volume: 9 Pages: 842-858

    • NAID

      170000149783

    • Related Report
      2018 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 創薬における計算と人智の融合、群衆リソース活用の動向2020

    • Author(s)
      山本一樹
    • Organizer
      第43回 日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Drug Discovery Raid Battle 2018: an open challenge to discover PD-1/PD-L1 small-molecule inhibitors2019

    • Author(s)
      山本一樹
    • Organizer
      CBI 学会 2019 年大会「構造生物学と情報科学の真の融合を目指して ~AI 時代の新創薬化学~」
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] ソーシャル創薬プロジェクト: 人智(創薬知)と計算(IT創薬)の融合、創薬エコシステムの社会実装を目指して2018

    • Author(s)
      山本一樹
    • Organizer
      第397回CBI学会講演会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] ソーシャル創薬プロジェクト -人智(創薬知)と計算(IT創薬)の融合、創薬エコシステムの社会実装を目指して-2018

    • Author(s)
      山本一樹
    • Organizer
      第17回情報科学技術フォーラム
    • Related Report
      2018 Research-status Report
    • Invited
  • [Remarks] chemical.space: 化合物空間探索のためのウェブポータル

    • URL

      https://chemical.space/

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Remarks] GitHub repository for chemical.space

    • URL

      https://github.com/ddquest/chemical.space

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Remarks] Bots bring chemistry research tools to Twitter

    • URL

      https://www.chemistryworld.com/news/bots-bring-chemistry-research-tools-to-twitter/4013601.article

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Remarks] ソーシャル創薬補助ウェブサイト: chemical.space

    • URL

      https://chemical.space/

    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Remarks] 分子構造表示 bot 機能付きSNSアカウント

    • URL

      https://twitter.com/souyakuchan

    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Remarks] 創薬レイドバトル

    • URL

      https://gist.github.com/souyakuchan/7f9add656d9d6b91f02f6939b88aa2c8

    • Related Report
      2018 Research-status Report

URL: 

Published: 2018-04-23   Modified: 2022-01-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi